庾恩旸因父母早逝，靠着长兄的抚养得以入学堂读书，1902年，庾恩旸以优异的成绩考入了中学，并在第二年被选送至昆明高等学堂。庾恩旸的人生发生了翻天覆地的变化，他也因此有了留学日本的机会。
在日本陆军士官学校留学期间，庾恩旸的思想发生了重要转变，在云南留日同乡的影响下，他成为了同盟会的一员，并在杂志上发表揭露清朝廷腐朽的文章。
1909年，庾恩旸学成归国，在云南负责筹办陆军讲武学堂和随营学堂，并担任教官。任职期间，他与全体学员同甘共苦，共同接受训练，他的才能和军事理论受到学员一致肯定。他所带的学员在云南陆军的一次实弹射击演习中，名列第一。庾恩旸也迅速在军中崭露头角，成为了云南当地有名的将领。
这一时期，国内政治动荡，清朝的统治岌岌可危，武昌起义后，全国各地纷纷响应声援，接连起义。在云南，庾恩旸、唐继尧、谢汝翼等人多次秘密开会谋划起义之事。
当时，率先响应武昌起义的是湖南和陕西，尽管云南的革命者已经手握新军武装，拥有一批骨干成员，但因为担心外国殖民者借机出兵干涉，有人便提出等大部分省份响应后云南再行动。
然而，这条建议一提出便遭到了庾恩旸的强烈反对，他坚持不应该推迟，直言：
“若吾滇义师速举，反可促西南诸省独立，则西南大事可成。然后联合诸省，大举北伐，直捣黄龙，满庭可倒矣！”
最终，大家同意了庾恩旸的意见。随即便先后几次秘密召开会议，就起义之事作具体安排和部署。
最后一次会议上，大家一致推举蔡锷担任起义军总司令，并定下于1911年10月30日午夜正式行动。然而，当天晚上8时许，新军战士们在准备枪支弹药，检查武器时，被人发现，导致起义计划提前暴露。鉴于此，蔡锷果断决定提前发动起义。于是，一个小时后，云南境内打响了起义的枪声，因为这一天是农历九月初九，因此也被称作重九起义。
起义打响后，庾恩旸很快便率军同唐继尧等人合兵，并在炮兵的支援下，迅速向督署前进。黎明时分，庾恩旸等人便顺利攻占了督署，取得了起义的胜利。
起义胜利后，蔡锷担任云南都督，庾恩旸任参谋部部长。在云南起义的过程中，智勇双全的庾恩旸在战场上立下了赫赫战功。但令人意外的是，起义后，他的晋升速度却远远不及唐继尧。
庾恩旸和唐继尧是相识多年的老友，两人在日本留学时期就已经相识，又一起在云南起义中并肩作战。按理说，两人之间的感情应该相当深厚了。然而，谁都没想到，庾恩旸最终却死于唐继尧之手。
1913年，蔡锷前往北京，经他推荐，唐继尧担任云南都督，掌握了云南军政大权的唐继尧很快便暴露了本性。尤其在私生活方面，唐继尧十分好色，沉迷于风月场所，家里妻妾成群。尽管如此，他还是不满足，甚至看上了好兄弟庾恩旸的妻子。
庾恩旸的妻子钱秀芬是云南有名的大美女，因丈夫的原因，她经常来唐家做客，找唐太太聊天。而唐继尧在见到钱秀芬后，深深地被她的美貌所吸引，同时，钱秀芬也对唐继尧产生了好感。“一拍即合”的两人很快便在一起了。但这段感情注定见不得光，他们只能偷偷摸摸幽会。
时间一长，唐继尧便觉得庾恩旸太碍事，并渐渐萌生了铲除他的想法。
1917年7月，张勋复辟，云南出兵讨逆，庾恩旸被派往讨伐张勋。1918年2月，庾恩旸率部驻扎在贵州毕节的行营，期间，他被自己的勤务兵李炳臣暗杀身亡，死时年纪35岁。
死后，庾恩旸被追赠陆军上将。李炳臣曾是唐继尧的贴身侍卫，对唐忠心耿耿，而李炳臣本人跟庾恩旸也没有什么冤仇，他是没有作案动机的。这件事在当时也引起了不少人的怀疑。
但令人意外的是，李炳臣被抓后，还没有审查清楚，唐继尧便下令要求处决李炳臣。据说，李炳臣死后，其家属还收到了唐继尧给的一笔丰厚的金钱。
唐继尧的种种行为无不透露着诡异，不少明白内情的人很快就猜到了庾恩旸死亡的真相。而且，在庾恩旸死后的第二年，唐继尧便迎娶了钱秀芬。这让他为霸占钱秀芬而杀害庾恩旸的真相昭然若揭。
庾恩旸死后，他的弟弟庾恩锡为纪念哥哥，生产了一种香烟，并取名“大重九”，庾恩锡创办的烟草公司就是昆明卷烟厂的前身。
庾恩锡的儿子庾家麟后来随国民党政权撤退到了台湾，庾家麟的儿子庾澄庆就是在后来火遍大江南北的华语歌星。