正常来说，在部队系统当中一个军事单位只会有一个直接的领导上级；比较特殊的是在“军委管总、战区主战、军种主建”体制下，诸如战区陆军、战区空军、战区海军等部队能够同时有两个直接联系的上级单位，分别是负责指挥调度的战区和负责领导管理的军种总部。但是，其实还有更特殊的，那就是新疆军区、西藏军区，这两个军区竟然同时拥有三个直接上级，即陆军总部、战区指挥机关和军委国防动员部，而这种特殊的设置也是由多方面原因造成的。
首先是军改的影响：在此前的军改中（具体时间是2016年2月初），新疆军区、西藏军区脱离了省军区系统整体转隶陆军领导，其中新疆军区直接从副大军区级套改为副战区级、西藏军区则是从正军级升格为副战区级。如此一来，新疆军区、西藏军区就和五个“战区陆军”一样成为了由陆军总部直接领导管理的陆军副战区级单位，并与西部战区陆军平起平坐、互不隶属、平行运转。
同时在战区体制下，新疆军区、西藏军区在作战指挥、兵力调度、联合作战等方面要服从接受西部战区的指挥引导，同时还需要实时向战区联合作战指挥中心报送相应的情报资料、战场态势、边境防务、兵力部署等情况。因此，军改后，新疆军区、西藏军区分别在作战指挥和部队领导管理建设这两个领域拥有了2个直接的上级。
其次是历史体制的影响：在此番军改前，新疆军区、西藏军区分别是隶属兰州军区、成都军区的一个省军区，级别分别对应副大军区级、正军级，同时还都下辖有大量的野战部队和边防部队。但无论级别规格如何，新疆军区、西藏军区在本质上仍旧是省军区，下辖相应的军分区、警备区（新疆军区还领导管理着南疆军区、兵团军事部），再往下还有大量的县区人武部，是省军区系统的重要组成部分。
而既然是省军区，那么新疆军区、西藏军区自然要肩负起“国防动员、后备力量建设、兵役、民兵队伍管理建设、军地协调联系、双拥、国防战备设施保护”等职责。但在此前的军改中，这些职责都已经移交给新组建的军委国防动员部牵头领导了，另一方面，新疆军区、西藏军区又是转隶陆军领导，二者之间似乎没有什么联系。
不过大家可千万别忘了，新疆、西藏两军区虽然转隶陆军序列了，但“省军区”的牌子还在，它们下辖的军分区、警备区以及县区人武部也照样继续存在，从军区本级到这些军分区、警备区、人武部仍旧是同级地方党委的军事工作部门、同级地方政府的兵役工作机构，继续发挥原先省军区系统的工作职责。于是，在这种情况下，新疆军区、西藏军区在国防动员这个大领域还要接受军委国防动员部的业务领导指导。
最后，简单介绍一下军委国防动员部：这是军改中军委机关设立的新部门，成立于2016年1月，主要职责是在精简常备军的同时加强国防动员建设，履行组织指导国防动员和后备力量建设职能，领导管理省军区，从而有助于增强国防实力、保卫国家安全。