对于桔梗根腐病，可用多菌灵1000倍液浇灌病区；对于桔梗炭疽病，可喷施50%甲基托布津可湿性粉剂800倍液防治；对于桔梗拟地甲，使用90%敌百虫800倍液喷施防治。炭疽病主要危害桔梗茎秆基部，发病初期茎基部出现褐色斑点，逐渐扩大至茎秆四周，后期病部收缩，最后植株倒伏死亡。
一、桔梗根腐病
1、危害
一般危害根部，受害后根部出现黑褐斑点，后期腐烂至全株枯死。
2、防治
（1）可用多菌灵1000倍液浇灌病区。
（2）雨后注意排水，田间不宜过湿，降低发病率。
二、桔梗白粉病
1、危害
主要危害叶片。发病后病叶布满灰粉末，发病严重情况下全株会枯萎。
2、防治
可于发病初期选用波美0.3度石硫合剂、白粉净500倍液、20%的粉锈宁粉1800倍液喷洒防治。
三、桔梗根线虫病
1、危害
根部有病状突起，地上茎叶早枯。
2、防治
施入1500千克/公顷茶籽饼肥作为基肥，可以减轻桔梗根线虫病危害，另外，可于播种前用石灰氮或二溴氯丙烷对土壤进行消毒，降低发病率。
四、桔梗紫纹羽病
1、危害
9月中旬为发病高峰期，发病后的植株10月根会腐烂。根部受害后，初期变红、密布网状红褐色菌丝，发病后期形成绿豆大小紫色菌核，茎叶枯萎，最后死亡。
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2、防治
拔除病株烧毁，病穴灌5%石灰水消毒。切忌连作，可实行轮作倒茬。
五、桔梗炭疽病
1、危害
7-8月高温高湿天气时为发病高峰期，植株会成片倒伏死亡。主要危害茎秆基部，发病初期茎基部出现褐色斑点，逐渐扩大至茎秆四周，后期病部收缩，最后植株倒伏死亡。
2、防治
在幼苗出土前用20%退菌特可湿性粉剂500倍液喷雾预防，发病初期喷1：1：100波尔多液或50%甲基托布津可湿性粉剂800倍液，间隔10天喷1次，连续喷3-4次。
六、轮纹病和斑枯病
1、危害
主要危害叶片。
2、防治
可以在发病初期喷施1：1：100波尔多液或50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液，需要连续喷施2-3次。
七、桔梗拟地甲
1、危害
危害桔梗的根部，播下的种子和将出土的作物幼苗会受到幼虫的危害，可能会咬断幼苗根茎部，造成缺苗断垄。
2、防治
可于3-4月成虫交尾期、5-6月幼虫期选用90%敌百虫800倍液、50%辛硫磷乳油1000倍液喷杀防治。