抗战胜利后，1945年10月，程世才奉命到达沈阳。未几，担任新组建的东北人民自治军第三纵队司令员，同时兼任辽东军区司令员。
当时到东北的部队特别杂，山东部队最多，其次是从江苏远道而来的新四军三师（黄克诚），还有邻近东北的晋察冀、晋绥部队。东北人民自治军草草拉起子，101手里连电台都不够用，下级找不找总部，总部指挥不到师、旅是普遍现象。更遑论进行整编呢，乱之极矣。
从编制上看一团乱麻，既有师，也有旅，还有纵队，实际三种单位基本相当。团一级作战单位，既有团，也有支队，也基本相当。
担负作战任务的，既有军区部队，也有野战部队，东西南北满各成立了军区，军区指挥下面的旅、团作战，分不清谁是主力谁是辅助。
101着急也没办法，只能先捡着相对成熟的部队组建成主力部队。
1946年3月，东北人民自治军改为东北民主联军后，成立了新的三纵，程世才以军区司令员身份兼任三纵司令。在此之前还有一个老三纵，那是山东3师改编的部队。新的三纵是老三纵与冀东16军分区部队合并组建的，16军分区三个旅都是程世才带出来，程世才资历又远远高于老三纵司令胡奇才，故而由他出任新三纵司令。
大概到1946年9月，东北初代主力纵队一共组建了4个，分别是一纵、二纵、三纵、四纵。
一纵、四纵是山东八路军部队改编组建，二纵是黄克诚三师改编组建。司令员依次是万毅、刘震、程世才、胡奇才。
程世才的本事无疑是个中佼佼，但佼佼未必就能引出好结果。
我们先说过程，程世才任第三纵队司令员并未多久，1946年11月，辽东、南满两军区合并，程世才地位急剧弱化，南满军区来了两个大佬，陈云南满军区第一书记、政委，萧劲光任南满军区司令员，这两位都是兼职，原有其本职，陈云是东北民主联军副政委，萧劲光是副司令员。
程世才无论如何也不能与这两位比肩，只能专任副司令员。另一位年轻的大佬萧华则任副司令员兼副政委。这样一来，程世才在南满实际上只能排到四号。
更甚者，程世才还免兼三纵司令员，其缺由曾克林接任。
所以后来我们看各种关于四保临江战役的记录，高光人物是陈云、萧劲光、韩先楚，而主要负责作战指挥的副司令员程世才几乎隐身。《中国人民解放军高级将领传》卷37《程世才传》极力为程将军多记点功劳，四保临江之战也只有可怜的一句话：“程世才参与指挥军区部队进行了四保临江作战。”
再其后，时间忽忽而过，程世才一直在军区工作，从南满调到安东军区，又调到辽西军区，东北野战军发气气势恢弘的辽沈战役，程世才只能敲敲边鼓，打的最大的仗，乃是国民党军主力就歼后，率军区部队清扫沈阳战场。
三、迟来的补偿
当年红四方面军数一数二的能征惯战之将，怎么在东北越走越低、路越来越窄了呢？
关键节点就是1946年5月的四平保卫战。
东联主力在四平坚守，三纵奉命打开原、昌图一线，截断新六军等其他国军主力来援的通道。
结果打着打着出现意外情况。
廖耀湘率新六军猛攻，正与三纵迎头撞上。新六军抗战新胜之师，武器全美械，而且兵力较强，除了本军三个师，还指挥七十一军一个师，兵力比三纵多。
廖耀湘起初准备硬攻，发现三纵全纵主力集中于此，不太好冲得过去，便改变战术，以少量部队继续进攻三纵，其余主力分左右两路，乘坐600辆汽车准备绕到三纵侧背，直插四平外围。
三纵一个纵队断然抵挡不住，如果把新六军放到四平外围，那东联主力就顶不住了。
这时发生了比较有意思的情况。
面对危局，三师师长黄克诚和三纵司令员程世才同时向101发电。
黄克诚建议，不要与敌硬拼，适当抵抗一下，赶紧撤出，我们应该让开大路，占领两厢。
程世才则建议，敌人猛攻，且改变战术，我三纵部队也应改变战术，放弃原定阻击计划，以机动迂回对机动迂回，也绕到四平侧翼，在运动中打击敌人。
101对两人的反应耐人寻味。黄克诚的电报虽然方向是正确的，后来东北我军确实执行的让开大路占领两厢的策略，但客观地讲，当大军交争、炮火连天之际，首要解决的是我军生存问题，最好能争取战术上的胜利，而后才能去讲长远战略问题。
所以，101对黄克诚的电报既不回应，也不撤兵。黄克诚急的没办法，只好再次越级给中央发报，向毛主席强烈建议放弃四平。这是另一段故事，不多说。
对程世才的电报呢，101却态度激烈地说，让你就地阻击你就得执行，不要搞别的。
程世才很不理解。敌情已经发生较大变化，阵地战死守战又非我军之长，为何不发扬我军善于机动的优势呢？
多年后，在北京功德林改造的廖耀湘撰文回忆迂回四平之战，说到当时他的指挥心态，说进攻当面不需多虑，需要高度关注的是侧翼，这是解放军最擅长的运动战打法。他给各师长官反复提醒，一定要注意侧翼注意侧翼。
各师做了充足准备，但一反廖氏预测，解放军主要抵抗方向一直在正面，反而是侧面基本没有什么骚扰。这一度令廖耀湘百思不得其解。其文载于政协《文史资料选辑》第42辑《蒋军新六军迂回四平街的经过》，有心人可仔细看一下新六军战斗情况。
当年和程世才搭档的三十军政委李先念，后来亦曾在回忆文章提到此事，说程世才的意见莫名其妙地令林氏不快，这大概就是后来程世才职务困难的主要原因。
寻其根本，林氏的军事才华不需怀疑，如果在平时发生这样的争论，当不会有太大动静。偏生这时乃是林氏军事生涯中从所未见的困难局面，他那时需要的是绝对服从。程氏与他从无渊源，你在红四幸得大名，与我有何？再者，大家都是23岁当军长，莫不是你我好有一比？林氏收拾不了黄克诚这种大佬，暗里对程氏的军事地位施加一些影响，当不难办到。
这些脉络虽不见于书纸，但明事理者都知道怎么回事。
程世才1945年抗战前就准备到中原与新四军五师会合，程李准备再度合体，李先念对程世才关心备至，在东北这档子事，他老人家虽目不见之，心里是清楚的。
当然，对美质良材被浪费最痛彻心扉的，自然是解放前夕在太原前线病骨支离的徐向前。
建国后，中央有人看到程世才的委屈，从二级军区司令员位置上，越级提拔为新成立的公安部队副司令员，给罗瑞卿大将当副手，也算是一种补偿吧。
不过这补偿来得，未免有些晚了。
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