近日,AI 平台抱抱脸(Hugging Face)联合中国中关村学院、意大利那不勒斯腓特烈二世大学的研究人员,发布了开源生物学 AI 模型 Carbon-X。该模型能够同时理解 DNA 序列和自然语言,用户可以像使用 ChatGPT 一样,询问特定 DNA 变异可能对基因活性和健康产生的影响。
研究团队在现有语言模型基础上扩展了词汇表,使其能够以每 6 个碱基为一组读取 DNA,并利用 3000 亿个涵盖 DNA 序列、英文文本及生物学描述的 token 继续训练。训练数据涉及哺乳动物、植物、真菌等多类生物,但出于生物安全考虑,未纳入病毒序列。
Carbon-X 拥有 140 亿个参数,可在本地设备运行,无需上传敏感基因组数据。模型每次可处理约 5 万个碱基对,有望辅助研究人员判断基因突变是否致病,为靶向药物和基因疗法开发提供线索。不过,模型预测结果尚未经湿实验验证,准确性仍有待评估。
来源:Wired
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