1949年9月25日、26日，国民党新疆警备总司令陶峙岳、新疆省政府主席包尔汉相继发表通电，宣布脱离国民党反动统治，接受中国共产党的领导，新疆正式宣告和平解放。
当时的驻疆部队，既有中央军嫡系，也有地方骑兵部队，还有长期盘踞边疆的旧军阀武装，官兵的政治立场、思想认知差异极大。部分顽固军官拒绝接受起义决定，暗中串联、散布谣言，试图破坏和平局面。各地的反动势力、封建头目也伺机而动，妄图趁解放军尚未全面进驻之际制造混乱。
在这样的背景下，中央军委与第一野战军决定由第一兵团司令员王震率部快速西进，既要完成防务接收、军事布防，更要开展政治工作、团结各族群众、整训起义部队，以最快速度稳定新疆全境。
担负进军南疆先头任务的，是第一野战军第二军第四师。这支部队历经长征、抗日战争、解放战争的洗礼，作风顽强、执行力强，是进疆部队的精锐力量。
进军前夕，部队配发了美式防寒大衣、野战帐篷，携带十日应急干粮，全军调配百余辆汽车承担运输任务。即便如此，跨越千里戈壁、穿越天山隘口的行军依旧充满艰险。
戈壁滩上风沙终日不息，昼夜温差极大，缺水、缺粮、冻伤、疲劳成为官兵面临的常态考验，部分路段车辆无法通行，官兵只能徒步跋涉。王震亲自点将，任命吴子杰代理第四师师长，率部作为先头梯队率先开赴南疆。
1949年10月中旬，第二军第四师先头部队抵达鄯善县城外围。此时的鄯善，名义上已归属和平起义后的新疆省政府管辖，驻守城内的是原国民党整编第六十五旅第一九四团的一个营，起义后暂由解放军序列指挥。
当地县长司马义·艾买提是维吾尔族开明人士，始终拥护和平解放，提前组织群众筹备粮草、整理街道，准备迎接解放军入城，城内的各族群众也期盼着解放军到来，结束动荡不安的局面。
但是驻守该营的营长丁少斋，系胡宗南嫡系军官，从始至终反对和平起义，对解放军的政策充满敌视。在少数反动军官的煽动与串联下，丁少斋决心铤而走险，制造武装叛乱。
10月16日傍晚，丁少斋纠集数十名亲信士兵突然发动兵变：下令关闭县城所有城门，在城头架设轻重机枪，控制城墙制高点与城内交通要道；同时派人劫持了正在筹备迎军工作的县长司马义·艾买提，在混乱中将其残忍枪杀。
叛乱发生后，鄯善城内瞬间陷入混乱。丁少斋等人在城内散布“解放军进城后会清算旧军官、抢夺百姓财物”等谣言，煽动不明真相的士兵顽抗；起义部队中的多数官兵并未参与叛乱，面对突发变故不知所措，只能原地观望；各族百姓紧闭家门，惶恐不安，担心战火蔓延。城门紧闭、枪声四起、主官遇害，鄯善的突发叛乱，瞬间打乱了解放军进军南疆的部署，也成为新疆和平解放后，南疆地区第一起武装叛乱事件。
叛乱消息迅速上报至第二军军部与第一兵团指挥部。此时王震正与军部参谋人员研究南疆进军路线与防务接管方案，得知鄯善叛乱、县长遇害、城门被封的消息后，当即作出决断：命令第四师代理师长吴子杰率部星夜驰援鄯善，务必在最短时间内控制局面、平息叛乱。王震特别强调，此次行动不是单纯的军事战斗，而是一场政治仗，既要快速出击、防止事态扩散，又要稳妥处置、避免伤及无辜、激化与起义部队的矛盾，“打赢这一仗，南疆可定；处置失当，后患无穷”。
军令如山，吴子杰接到命令时已是深夜。他立即停止部队休整，紧急召集师级干部召开作战会议，快速集结主力部队，分三路向鄯善县城疾速推进。戈壁的深夜寒风刺骨，车辆只能关闭大灯、以暗灯缓慢行驶，部分路段崎岖难行，官兵们裹紧大衣，顶着风沙徒步跟进，即便疲惫不堪、手脚冻僵，也无人掉队。军情紧急，每拖延一分钟，叛乱都可能进一步扩大，甚至引发其他地区起义部队的连锁反应。
行军途中，吴子杰与师政委、参谋长反复研判局势：丁少斋仅控制百余人的亲信，多数起义官兵处于观望状态，城内百姓无心反抗；若采取强攻，虽能快速破城，但必然造成平民与起义官兵的无辜伤亡，还会让反动势力借机挑拨民族关系、恶化军民关系。最终，第四师以军事威慑为基础，以政策宣传为核心，最大限度争取观望官兵，只严惩首恶分子。
10月17日凌晨，第四师主力部队抵达鄯善城下，迅速完成对县城的全面合围，封锁所有城门与出城通道，切断叛乱分子的外逃路线。吴子杰派出侦察连便衣战士潜入城内，摸清城内兵力部署、官兵态度、百姓动向等核心信息。侦察情报很快传回：丁少斋的核心武装仅百余人，集中驻守城墙、营房与电台等关键点位；其余起义官兵大多未参与叛乱，甚至不清楚叛乱的完整经过，只是被动待命；城内百姓闭门不出，普遍厌恶战乱，期盼解放军平息事态。
天亮后，吴子杰下令部队对空鸣枪示警，形成军事威慑；同时安排政治干部使用扩音器，向城内反复喊话，宣讲解放军的政策：只惩办丁少斋等首恶分子，对被胁迫参与的士兵一律不追究责任，放下武器、主动配合者予以宽待。喊话持续数小时，城内仅有零星枪声回应，叛乱分子的顽抗并未得到多数士兵的响应，丁少斋试图裹挟更多官兵参战的企图彻底落空。
10月17日上午十时许，吴子杰判断时机成熟，下令发起肃清行动。突击队以轻武器压制城墙火力点，同时派出精干战斗小组攀越城墙，快速打开城门。整个行动仅持续二十分钟，解放军便顺利控制城门、电台、水源、军营等核心设施，未造成大规模交火与平民伤亡。丁少斋见大势已去，率十余名亲信弃城向西逃窜，早已预伏在城外的解放军分队迅速合围，将其当场擒获。
当日午后，第四师政治部工作人员全面进入城内，召集全体起义官兵召开政策宣讲会，详细讲解中国共产党对起义部队的优待政策、民族政策与群众政策；为生活困难的起义士兵发放粮食、衣物等生活物资；组织医护人员在城内巡诊，为各族群众提供医疗帮助。
对于叛乱人员，吴子杰下令将丁少斋等四名主谋单独羁押，后押解至迪化（今乌鲁木齐），经军事法庭审判后依法处决；其余被胁迫参与叛乱的士兵，经过短期政治教育与思想改造，绝大多数自愿申请编入解放军部队，成为进疆部队的补充力量。