吕文远是安徽颍上人，出生于1907年，出生于一个行医家庭。早年时期，吕文远主要在家乡以及南京等地读书，他天资聪颖，学习刻苦，读书成绩很好。1919年，五四运动之后，吕文远开始追求真理，向往光明，积极参加各种反帝反封建爱国运动，为将来走上革命之路奠定了基础。
1925年，吕文远参加革命，并加入了共青团，同年，吕文远转为正式党员。当时恰好是大革命时期，两党处于第一次合作期间，因此，入党之后的吕文远被组织派到南京，在南京的工人群体中宣传我党的革命思想，发展革命骨干分子，引导工人们走向进步与光明。
1926年，吕文远被组织派到广东，考入了黄埔军校第六期。不过，一年之后，蒋介石在广州大肆逮捕党员，迫害进步人士，吕文远也不幸被捕，并被关押起来，直到1930年才出狱。出狱之后，吕文远没有对革命灰心，继续坚定地投身革命斗争。
在这之后，吕文远辗转东江以及上海等地，参与了红十一军的建设，1931年年初，他在上海再次被捕，一年后，经过保释，吕文远恢复了自由。吕文远出狱时，上海的革命形势已经发生了巨大的变化，因为在他被捕后不久，顾顺章也在汉口被捕，旋即叛变。
顾顺章的叛变对革命事业造成了巨大的损失，上海的组织几乎被破坏殆尽。在这种背景下，吕文远也离开上海，前往河南，1933年，他担任了河南省工委第一任书记，领导河南的工人进行革命斗争活动。1934年，27岁的吕文远担任了河南省委书记，继续在极端危险的环境下与敌人进行斗争。
1934年年底，吕文远返回上海，不久后，他再次被捕，直到1936年才出狱。出狱之后，吕文远与组织失去联系，他被迫返回家乡，以教书为生。1938年，吕文远前往革命圣地延安，进入抗日军政大学学习，毕业后他留在延安工作，担任了民政厅秘书主任等职务。
抗日战争胜利后，吕文远被派到晋冀鲁豫根据地，主要从事部队的政治工作，期间，他参与了解放中原大地的战斗以及淮海战役、渡江战役等大型战斗，新中国成立后，吕文远又马不停蹄地跟随二野参加了解放西南的战斗。西南解放后，吕文远留在西南地区，投身新生政权的巩固。
1953年，吕文远被调到中央工作，担任了劳动部部长助理、办公厅主任、副部长等职务，官至副部级。不过，1965年，吕文远却受到不公正对待。吕文远之所以受到不公正对待，主要是革命时期，他曾多次被捕，在一些别有用心的人的策划下，吕文远受到无端调查，不仅被免除了副部长的职务，而且还被调到武汉，担任了武汉市教育局副局长、顾问。
紧接着，1966年，十年浩劫开始，吕文远继续受到冲击。虽然身处逆境，但吕文远始终保持着一个党员的高尚情操与坚定信仰，与造反派进行了不屈不挠的斗争，拒绝了造反派强加在自己身上的一切不实之词。
1979年，中央为72岁的吕文远平反，恢复了他的一切名誉，在这之后，吕文远又担任了湖北省人大常委会副主任，他也继续发挥老干部的作用，为地方的各项建设献言献策，做力所能及的工作。2003年，吕文远因病去世，享年96岁。