二战期间美国陆军航空队（USAAF）的政策要求评估重型轰炸机设计的炮艇改型，以提供超出战斗机航程范围的长程护航。虽然基于B-17飞行堡垒的YB-40炮舰进行了操作评估阶段，但B-24解放者和B-29超级堡垒的炮艇改型只是一次性的修改。
第四架超级堡垒开发机身，YB-29-BO序列号41-36957，被选中进行改装。标准超级堡垒的武装是十挺.50口径机枪和一门20毫米机炮，总共十一门武器，而B-29炮艇计划携带二十五门武器。
机鼻上安装了一个 ERCO 球形炮塔，内置了双管 .50 口径机枪。机身前后翼梢的位置各安装了四个爱默生 126 型炮座，每个炮座上安装了另一对 .50 口径机枪。
标准的超级堡垒配备了四个遥控炮塔，每个炮塔上装有一对 .50 口径机枪（四管背部炮塔后来才加装）。这些炮塔被更先进的新版本所取代，该版本用一门20毫米机炮增强了双管 .50 口径机枪。
尾部武器也得到了增强。标准的20毫米机炮被替换为30毫米机炮，同时保留了现有的一对 .50 口径机枪。总共配备了二十挺 .50 口径机枪、四门20毫米机炮和一门30毫米机炮。
这些修改进行了评估，但从未投入生产。值得注意的是，41-36957号似乎没有为炮手安装瞄准突起物，因此可能新的炮塔没有整合到集中火控系统中。
S68项目 - 有人炮塔B-29超级堡垒
S68项目是为了评估在通用电气远程炮塔系统出现问题时，在波音B-29超级堡垒上使用有人炮塔的运作情况。
B-29-25-BW序列号42-2441，于1944年10月进行了修改。机鼻武装是一对独特的爱默生136型炮座，每个炮座上装有一挺 .50 口径机枪。
上部遥控炮塔被替换为马丁有人炮塔，而下部则配备了斯佩里A-2型球形炮塔前部和半可收回的A-13型炮塔后部。
机身侧面的瞄准突起被单挺 .50 口径机枪取代，安装在灵活支架上，类似于其他美国陆军航空队的重型轰炸机。尾部武装保持不变。
通用电气远程系统在实际运用中表现出色，因此没有必要将有人炮塔安装推进到评估阶段以外。不过，这仍然是一个有趣的改型。