现在各国都建立了自己的健康饮食指南，从碳水化合物、蛋白质、脂肪、矿物质、维生素、膳食纤维等等各方面分析人体需求，并结合各国的体质人类学、饮食习惯等进行调整。但是，这些指南很少提及最新研究很热门的肠道菌群，而肠道菌群在人体的营养吸收与代谢中又扮演很重要的角色。因此，加拿大阿尔伯塔大学和爱尔兰科克大学的研究人员分析了当前营养指南与肠道菌群的关系，认为应该分析饮食-微生物组-宿主之间的联系，在营养研究中要分析肠道菌群的作用。
一、饮食是否健康其实与肠道菌群有关
1、全植物饮食
全植物饮食强调水果、蔬菜、豆类、全谷物和坚果等食物的摄入，膳食纤维和植物化学物质是全植物食品的两个重要组成部分。全谷物能够降低患慢性病的可能性的证据是强有力的，并且越来越多地研究肠道细菌在这些影响中的作用。根据一项结合人类研究和小鼠机械评估的研究，微生物群可能对全谷物的健康影响具有因果关系。越来越多的研究表明，肠道微生物组可能在豆类的健康益处中发挥作用。
2、加工食物
加工食物会添加盐、饱和脂肪或糖、食品添加剂等非天然物质，加工食品中可快速发酵的元素可能会导致小肠中细菌过度生长，并导致不良的微生物代谢和成分分布，从而引起免疫与内分泌异常，但是却对结肠的肠道菌群没有益处。
3、地中海饮食
地中海饮食整合了许多对宿主相互作用产生有利影响的食物类型，它建议将水果、蔬菜、豆类、坚果、全谷物和橄榄油作为饮食必需品，适量食用鸡蛋、家禽、鱼类和奶制品，并限制食用加工和红肉以及加工食品。多项最新的微生物组研究加强了地中海饮食在饮食指南中的重要性，因为地中海饮食是对于保持健康合理肠道菌群有益的。
二、强化饮食健康的方法
为了改善肠道菌群，可以考虑对饮食进行针对性强化，可以通过膳食合生元和益生菌来实现，对加工食品的重新配方，可以提高整个人群的饮食质量，降低慢性病风险。
而且，一旦识别出肠道微生物组和促进健康的分类群的特征，就可以使用营养策略来针对它们。由于肠道微生物群对饮食的高度定制化反应，肠道微生物组（肠道菌群）评估是专注于慢性疾病预防和治疗以及其他个体特定方面的精准营养方法的关键要素。
三、营养研究应该强调肠道菌群的价值
研究结果表明，饮食与疾病的存在或存在显着相关，而疾病随后与微生物组相关。预计饮食-微生物组的联系有助于饮食生理效应的分子基础，使肠道微生物组成为营养研究的“黑匣子”，将微生物组知识系统地纳入营养研究可以进一步促进和彻底改变健康饮食。
因此，在营养中强调传统的营养素的基础上，我们也要考虑肠道菌群的作用，进一步改善饮食对健康的影响。