截至5月21日,来自葡萄牙、比利时、美国的三个研究小组分别公布了近期在全球多地暴发的猴痘(Monkeypox)疫情中感染者所携带病毒基因组序列的初步结果。三份猴痘病毒(MPXV)的DNA序列初步显示同源,同属温和的西非株系,其与2018年和2019年在英国、新加坡和以色列发现的猴痘病毒关系密切。

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5 月 13 日 至 21 日 WHO 收到的猴痘非流行国家病例报告。来源:WHO

此前世界卫生组织曾表示,猴痘病毒主要有两个分支:西非分支和刚果盆地分支。西非分支的致死率较低,大约1%的感染会导致死亡;刚果盆地分支则可以导致10%的死亡率。

当地时间5月19日,葡萄牙国家卫生研究所的约翰.保罗.戈麦斯(João Paulo Gomes)及其同事在(https://virological.org)网站上,以论文形式公布了团队5月4日对一名葡萄牙男性患者携带的猴痘病毒的基因组测序草案(PT0001)。这也是近期全球多地暴发猴痘疫情以来,第一份猴痘病毒最新基因组的测序结果。

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葡萄牙团队公布的基因进化树分析草案基于对包括52个猴痘病毒基因序列的核心比对(在137 668 bp长度的基因序列中比对了955个变异位置)

根据这篇论文,基因进化树分析草案显示,分离出来的病毒与2018年和2019年从尼日利亚传播到英国、以色列和新加坡的病毒有密切关系。

比利时的样本报告则于当地时间5月20日公布。比利时安特卫普大学的研究人员在(www.virological.org)上发布其对该国一名猴痘患者携带的病毒基因测序报告。

随后,研究者在Oxford Nanopore的minION平台上使用非靶向宏基因组学方法获得猴痘病毒全基因组序列数据,重构了98.9%的基因组,平均测序深度为18.9倍。

图二:比利时团队公布的猴痘病毒基因进化树

研究者称,通过对新测序基因组与此前公开基因组的蛋白质编码区的核心区域进行快速比对,他们发现,比利时猴痘病毒基因组(ITM_MPX_1)也属于猴痘病毒的西非分支,与最近上传的葡萄牙疫情基因组关系最为密切,这进一步证明了在欧洲有大量的社区传播。

第三份猴痘病毒基因组测序报告(MA001)由美国研究者公布。当地时间5月20日,美国的研究团队公布了5月18日在美国马塞诸塞州确诊的猴痘患者所携带病毒的基因测序结果。目前的数据结果仅公布在国家医学医学图书馆的数据库中,未有相关文章公开发表。

(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2241461119)

世界卫生组织表示,自5月13日以来,全球12个未流行猴痘病毒的国家已报告了92例确诊病例和28例疑似病例。现有信息表明,与有症状的病例发生密切身体接触的人群中正在发生人际传播。

数据显示,这些确诊和疑似病例主要来自英国、西班牙和葡萄牙,其余分布在澳大利亚、比利时、加拿大、法国、德国、意大利、荷兰、瑞典和美国。到目前为止,还没有相关的死亡报告。

世卫组织预计,随着监测的扩大,未来有可能在已报告病例的国家和其他国家发现更多病例。

据联合国网站介绍,猴痘是一种罕见的病毒性人畜共患病(从动物传播给人的病毒),病人症状与过去在天花病人身上所观察到的相似,但临床严重程度较轻。

本文来源:生物谷