撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

大规模扰动图谱已改变了系统生物学,然而人类心脏领域尚缺乏此类资源——对于心脏而言,收缩功能与转录组状态必须同步测量。

2026 年 7 月 28 日,澳大利亚 QIMR Berghofer 医学研究所的研究人员在 Cell 子刊Cell Stem Cell上发表了题为:Cardiopedia-Ligand: A ligand-receptor perturbation atlas of human cardiac organoid function and transcriptional state 的研究论文。

该研究绘制了人类心脏类器官功能与转录状态的配体-受体扰动图谱——Cardiopedia-Ligand

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在这项最新研究中,研究团队建立了一个综合性的扰动-功能-转录组图谱——Cardiopedia-Ligand,通过用 87 种配体(靶向人类心脏表达的 98 种细胞膜受体)刺激人类心脏类器官(hCO)生成。研究团队开发了一套自动化高通量流程,可实现个体化收缩力测量及单个类器官 mRNA 测序。

利用该流程,研究团队定义了已知及此前未被识别的功能和转录聚类,包括正性肌力药物(增强心肌收缩力)、内皮素肽(收缩血管)、细胞外基质调控因子及多个炎症相关聚类。聚类分析、机器学习及人类心力衰竭活检组织的“指纹图谱”分析揭示了配体之间此前被低估的相似性,以及一种驱动射血分数保留型心力衰竭(HFpEF)的干扰素-γ 信号特征。

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该研究的亮点:

  • 87 种可溶性配体的功能及转录组扰动筛选;

  • 表型、功能和转录聚类的鉴定;

  • 炎症配体的差异性转录特征鉴定;

  • 机器学习与配体指纹识别揭示疾病驱动因素。

总的来说,这一全面的 Cardiopedia-Ligand 数据集为探究心脏生物学与人类疾病提供了宝贵且易获取的资源。

论文链接

https://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(26)00264-X