首先，孔捷在指挥上失误，的确是一个事实，但并不是绝对的，他在独立团时，团里面的任务是担任总部侧翼的掩护，可孔捷却把防御重点放在了日军据点方向，却并没有在后山设立防御，导致了杨村遭到山本特工队的袭击，再加上孔捷对日军非常规战术的预判严重不足，遭遇袭击时，也是没有立刻采取进攻战术，而是采用阵地防守战，从而造成己方200人的伤亡。
但这件事情并不是客观因素造成的，主要是孔捷的经验失误导致的，他常年跟日军交战，并没有渗透作战这方面的经验，况且，山本特工队的目的是袭击八路军总部，而杨村只是个意外，独立团发现了山本特工队的踪迹，并且还主动开火，就已经完成了担任警戒的任务了，客观上来说，山本特工队的任务失败了。
此时，李云龙想保住孔捷真的并不难了，李云龙并不是直接找总部替孔捷喊冤，而是立下一个军令状，他承诺自己接受独立团后，会带领部队打个翻身仗，留下孔捷当这个副团长，目的也是为了让他戴罪立功，说到底，就是李云龙利用自己的政治前途来跟孔捷绑定，其实，总部这边可能也清楚李云龙的心思，毕竟独立团刚吃了败仗，让团长留下来也有利于士气。
李云龙留下孔捷，可能目的也很简单，剧情里面有个桥段，就是孔捷要离开独立团时，被一大堆战士拦着，李云龙明白孔捷这个团长是深受战士们的喜爱，如果这时候，把孔捷这个团长给撸了，自己想带部队就要难很多，不如直接想办法留下孔捷，这时候，反而可以让孔捷在独立团继续工作，同时也可以让孔捷发挥自己的力量帮自己。
其实，孔捷也并不是完全被抛弃了，要知道，你别觉得孔捷就是吃了败仗的团长，事实上，他即便吃了败仗，但他完成了任务，成功保护了总部，况且，在当时的那个环境下，就算孔捷去总部喂马，也不见得是什么坏事，最起码安全是可以保证的，而且估摸着很快也会官复原职，因为那会的八路军严重缺干部，早晚也会让他去别的部队当团长的。
而且李云龙的求情，也是在给总部一个台阶，因为上级需要考虑的事情太多了，不仅需要整肃军纪，还要学着怎么震慑其他部队，但也要确保骨干不能流失，李云龙这时候一个电话打过来后，直接就给了总部机会，从后续的剧情来看，孔捷也并没有被怎么样，还被重用，调去了新二团当团长，后来更是一度干到了军长的职务。