《生命树》整部剧最大的谜团，莫过于男主角多杰的失踪之谜。
当初，多杰参加完北京的会议，在返回玛治县的途中突然失踪，从此杳无音讯。
整整18年，多杰的下落始终不明。
直到大结局，在孟耀辉和林培生的供述里，我们才知道了事情的真相——
多杰驾车时被孟耀辉打了一枪，但并没有受到致命伤。
由于感念多杰此前在无人区救命的恩情，孟耀辉还放了多杰一马。
之后，林培生想要救出多杰，但是车辆却中途抛锚，多杰最终因为失血过多而死。
至此，真相似乎终于水落石出。
然而经过我们仔细分析才发现，《生命树》多杰之死另有隐情，林培生至死都在说谎。
大结局中，冯克清和孟耀辉都被判处死刑，而同样身为主犯的林培生，最后却是无期徒刑。
之所以会是这样的结果，很大程度上就是因为林培生的手上没有沾上人命。
林培生的说辞，成功地让警察们相信，多杰的死跟林培生没有半分关系，林培生在尽力拯救多杰的生命，奈何最后因为不可抗力导致失败。这大大减轻了林培生身上的罪责。
然而，剧中有至少3个细节证明，林培生在说谎，恰恰是他亲手害死了多杰。
第一，当时林培生开着车，载着中枪的多杰前往医院。
由于不是致命伤，只要能尽快赶到医院，正常情况下多杰有很大概率被救活。
可是不一会儿，林培生就对多杰说，“车子坏了，我下去推车”。
林培生嘴上虽然这么说，其实根本就没有一点儿实际行动。
所以，车子实际上并没有坏，林培生在说谎。
第二，如果中途车辆抛锚，那么车子理应停在公路上，然而镜头画面显示，林培生的车却停在一片荒野之中。
而且多杰当时身受重伤，已经流了很多血，根本经不起更多的颠簸，如果林培生真的想救多杰，他不可能连这个常识都不知道。
因此，林培生把车子开进荒野，明显就是故意制造颠簸，拖延时间，从而亲眼看着多杰失血而死。
林培生的供述中也有十分关键的一句话，“我这辈子就没见过一个人的身体里有这么多血”，意思就是他当时在焦急地等待多杰死亡。
多杰死后，林培生直接拿出铁锹把他埋了。
这说明林培生在来的路上准备非常充分，连挖土埋尸的铁锹都准备好了。他对冯克清的人不放心，所以选择亲自出马。
林培生根本就没打算让多杰活着回去，尤其当多杰说出林培生和冯克清勾结的隐秘之后，林培生更加坚定了自己的杀心。
《生命树》中的林培生是一个颇为复杂的人物。他曾经一心为民，致力于促进地方经济的发展，想方设法改善人们的生活水平。
然而到了后期，林培生没能经受住金钱的腐蚀，与虎谋皮满足私欲，最终成了国家的大蛀虫。