北伐战争时，吴石任北伐军参谋部作战科长时，与周恩来结识。一九三七年五月，周恩来、叶剑英率中共代表团到南京时，与叶剑英以及李克农认识，并接受其领导。
一九四二年，吴石被调往国军第四战区，与日军作战时，还营救过被误当日军间谍抓住并差点就地枪决的胡志明（后任越共主席）。
抵台后，吴石就任国防部参谋次长。一九四九年十一月二十七日，在上海、香港从事情报工作的女中共党员朱谌之赴台与吴石联系。
一九五0年一月二十九日，国民党特务逮捕了中共台湾省工作委员会书记蔡孝乾、蔡叛变，吴石和朱谌之由此被捕。一九五O年六月十日，吴石牺牲于台湾。
一九七三年，周恩来总理力排众议，在毛主席的支持下，由国务院追认吴石将军为革命烈士。
从这段文字看出，吴石在台湾伏法二十三年后才由周恩来力排众议，在毛泽东支持下，由国务院民政部追认吴石为革命烈士、明明是壮烈牺牲在敌人的刑场，为什么还要“力排众议”呢?
当时香港有一份受国民党中央海外工作会津贴的《新闻天地》周刊，在吴石被处决后三个月的七月八日、十五日出版的第125、126期连载了一篇长文《吴石间谍案破获始末》，作者署名李资生，自称是吴案的“承办审讯负责人”，此文泄露的细节显示，吴石被捕后的表现实在不敢令人恭维。
吴石将军
三月二日（被捕翌日）上午，吴石就供出了通敌的经过情形：
一晚失眠，并没有影响吴石的精神。三月二日的清晨，吴次长已经起身了，送上去的早点是牛奶和面包，但是吴次长只喝了一口牛奶，其他什么也没有动，他显然是胃纳不佳，他被准许阅读报纸，当天的报纸，详细的记载了昨天总统复职典礼的盛况，他看到这些消息后，心中的感触是不可言喻的，接着是某处长如约而至：
某处长说：“昨晚睡得还好吧?”
“一夜没有睡”吴石沮丧地回答。
“那么我们今天是否仍照原定计划来谈谈呢?”
某处长仍然有礼貌地征求吴次长的意见。
“好的，我昨天考虑了一夜，我自己觉得非常难过，我深信我是错了，我对不起国家，我对不起蒋总统，我决定很坦白的说出我的一切，我只有这样，才能镇定我自己的精神。”
吴次长说到“对不起蒋总统”这一句话的时候，曾向室内墙壁悬挂着的蒋总统戎装肖像作了一个九十度的鞠躬（按：据国民党中央党务顾问王大任回忆，吴石临刑前曾向蒋总统肖像行三鞠躬礼，连说自己该死）