台北地检署（简称为“北检”）于 26 日对台湾民众党主席柯文哲等人提起诉讼，移交至台北地方法院进行裁定，包括柯文哲在内处于羁押中的 5 名被告全部得以交保。
27 日中午，台北地方法院做出补充裁定，柯文哲等 5 人虽然不得与同案被告、证人有所接触，但是“日常家庭生活及工作必须者不在此限”。以柯文哲为例，他仍然能够和妻子陈佩琪进行接触，也可以与民众党人士就党务工作展开会议，不过不得涉及本案的案情。
然而，北检针对柯文哲、应晓薇、沈庆京、李文宗提出抗告，致使台湾“高等法院”在 29 日撤销原裁定，并发回台北地方法院重新裁定。
针对北检提出的抗告，28 日尽管是周六假日，柯文哲于下午驱车前往律师事务所，并和委任律师共同商讨案情。针对媒体询问“是否担心抗告案”这一问题，柯文哲态度低调，并未予以回应。
值得一提的是，在监狱历经一段时间之后，柯文哲仿若丧失了往昔的心气。据一位民众党的成员披露，柯文哲曾经涕泗横流，追悔当初拒绝“蓝白合”，要不然决然不会陷入这般境地。并且，恰是柯文哲的授意，在过去的数月当中，蓝白双方于“立法院”的合作亲密无间，成功阻拦了民进党的诸多提案。此外，被关114天后返回家中，柯文哲或许会重启“蓝白合”，参选2028年台湾地区领导人，并愿意担任副手。
想当初，国民党和民众党的众多有识之士，始终在不遗余力地推动“蓝白合”，意在冲击 2024 年台湾地区领导人之位，使腐败且无能的民进党下台，而此恰与大部分台湾民众的殷切期冀相契合。未曾料想，柯文哲却一直在进行各类政治筹谋，反复无常，还指使“手下大将”黄珊珊炮制出一个假民调，致使“蓝白合”全然破局，此般行径等同于保送赖清德、萧美琴。
其实，如果“蓝白合”得以顺遂功成，即便柯文哲仅充任副手，那么他与民众党所掌控的资源定然会较当下更为丰饶许多，其政治影响力亦将显著擢升，还能够彻查这些年来台湾的诸般弊案，而此乃柯文哲多年来所竭力倡行之事。
当下，民进党执政，他们始终倾力于打击在野党及其政治人物。在这般态势之下，柯文哲竟由原本的“原告”沦落成了名副其实的“被告”，甚至被投送入监狱，这样的结局无疑令人扼腕慨叹。
好在柯文哲和民众党还有机会“亡羊补牢”，还可以卷土重来；但是，相比之前的合作，现在民众党更需要蓝营的力量，需要来自蓝营的支持；而究竟该如何合作，一起冲击2028年的选举，柯文哲和民众党已经没有讨价还价的余地了，只能听从蓝营的安排和指挥。