辽沈战役、淮海战役、平津战役是中国人民解放战争中规模空前的战略决战。作为军委副主席兼代总参谋长，作为毛泽东在军事指挥上的主要助手，周恩来殚精竭虑、夙夜在公，精心筹划指导，积极献计献策，狠抓督导落实，为三大战役的决战决胜作出了历史性的贡献。
商讨重大军情，几乎每天夜里都要参加“五大书记会”。
1948年中央召开9月政治局会议后，我军提出了建军五百万和从根本上打倒蒋介石的战略构想。此时，战略决战的序幕战——济南战役已经打响。此前，中央书记处虽然也经常召开“五大书记会”，但毕竟次数不是太多。而在大决战期间，几乎天天都开会。据《周恩来传》记载，每天晚上八时左右，朱德、刘少奇、周恩来、任弼时都准时到毛泽东的办公室来，进行集体办公。一般来讲，这些会开得都比较长，几乎每次都是通宵。
周恩来因为兼任代总参谋长，五大书记决策后的具体落实层面，都由周恩来来承担。这样就使得他不仅夜里不能睡觉，白天还得继续开会布置有关工作。所以，周恩来就更显得格外忙碌，工作量绝对是超级饱和。有时工作累了，周恩来“就打开桌上小碟里放着的万金油，用食指沾了一点，抹在两鬓和前额，搓了几下，又继续工作下去”。
掌握重大军情，开辟专门的小作战室。
作为代总参谋长，周恩来需要实时掌握重大军情，需要及时为战略决策提供咨询。为此，除了军委作战部外，周恩来在他的住处还设置了一个小作战室。这个小作战室由张清化任主任，实际上相当于周恩来的军事秘书。据张清化回忆，他们每天都根据战局变化分析敌情、掌握我情，标注要图。而周恩来常到这个小作战室了解情况，并与大家一起研讨有关情况。他对敌我双方的总体态势、兵力部署、部队特点、战斗力强弱，甚至国民党方面指挥官的简历、性格等等，可以说是了如指掌。如果遇有什么情况，周恩来总是先仔细地核实并弄清，然后及时向毛泽东报告。
起草签发文电，成为毛泽东战略指挥的主要助手
当时，毛泽东和周恩来在西柏坡所住的院子靠得很近，可以说天天见面。遇有什么问题，两人随时交换意见，共同商议解决。由于当时通信手段受限，战略层面上的指挥主要就是靠电报。对前方的作战情况，“一般经毛泽东、周恩来商量研究确定对策后，多数由毛泽东起草文电，少数由周恩来起草，而所有军事方面的文电都经周恩来签发”。《周恩来传》这样记载道：
“发送军事方面的文电大致有三种情况：一是议后发。有了情况，书记处几个领导人共同商议，然后由毛泽东或周恩来起草文电发出。二是阅后发。由于军情紧迫，来不及一起商议，由毛泽东或周恩来起草好文电，再送其他领导人传阅后发出。这种情况是比较多的。三是发后阅。由于情况紧急，刻不容缓，为了争取时间，由毛泽东或周恩来起草好电文先发出，再送其他领导人传阅”。
三大战役期间，是中央军委实施战略指挥最为紧张繁忙的时期，也是军事工作最为卓有成效的时期，周恩来作为军委副主席兼代总参谋长，作为毛泽东在军事指挥上的主要助手，其运筹帷幄决胜千里的指挥艺术，其聚焦军事工作全身心投入大决战的事业品质，确实令人叹服佩服敬服！