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撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

阿尔茨海默病(AD)的标志性特征是淀粉样斑块沉积,主要由γ-分泌酶从99个氨基酸残基的淀粉样前体蛋白C末端片段(APP-C99)切割产生的β-淀粉样蛋白(Aβ)肽组成。

淀粉样前体蛋白(APP)首先通过α-分泌酶或β-分泌酶的初步切割产生含有83个或99个氨基酸残基的跨膜片段(APP-C83或APP-C99)。APP-C99通过γ-分泌酶的一种内肽酶活性 (ε-切割) 被切割,生成Aβ48或Aβ49,然后通过γ-分泌酶的另一种羧肽酶活性(ζ-切割和γ-切割)被切割,Aβ49的切割会导致Aβ46、Aβ43和Aβ40的依次生成;同样,Aβ48会生成Aβ45、Aβ42和Aβ38。较长的Aβ肽(≥Aβ42)被认为在毒性Aβ聚集的启动中发挥关键作用。

γ-分泌酶对APP-C99连续切割并产生了不同长度的β-淀粉样蛋白(Aβ)肽,值得注意的是,通常每次切割3个氨基酸残基,然而,这种连续切割以及每次切割3个氨基酸残基的具体机制目前仍不清楚。

2024年6月6日,西湖大学施一公院士、清华大学生命科学学院周瑞等人在Science期刊发表了题为:Molecular mechanism of substrate recognition and cleavage by human γ-secretase 的研究论文。

该研究确定了人γ-分泌酶分别与APP-C99、Aβ49、Aβ46和Aβ43结合的原子分辨率的冷冻电镜(cryo-EM)结构, 描述了人γ-分泌酶在淀粉样前体蛋白(APP)切割过程中如何与不同的Aβ肽底物相互作用,阐明了γ-分泌酶如何产生不同长度的Aβ肽,这些发现将加深我们对淀粉样蛋白生物学的理解,并有助于开发治疗阿尔茨海默病的策略。

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成熟的γ-分泌酶由四个亚基组成,分别是前体蛋白酶(PS)、前体蛋白酶增强因子2(PEN-2)、前咽缺陷蛋白1(APH-1)和Nicastrin蛋白(NCT)。其中催化亚基是PS,而PS1是其主要的异构体。人γ-分泌酶与APP-C83结合的冷冻电镜(cryo-EM)结构揭示了底物和PS1之间的杂交β-折叠,底物β链引导切割位点,与APP-C83相比,由γ-分泌酶切割的APP-C99效率较低。APP-C99的N端多出的16个氨基酸可能调节γ-分泌酶-底物复合物的形成。

尽管已经在γ-分泌酶结构上取得了进展,但控制其连续切割的底层机制仍不清楚,特别是不清楚为什么切割过程中主要每次切割三个氨基酸残基。

在这项最新研究中,研究团队报告了人γ-分泌酶分别与其底物APP-C99、Aβ49、Aβ46和Aβ43结合的原子分辨率水平的冷冻电镜(cryo-EM)结构,这些结构分析揭示了其底物识别和切割的机制。该研究发现,在所有情况下,底物都具有相同的结构特征:一个跨膜α螺旋、一个由γ-分泌酶切割的三氨基酸残基连接肽和与PS1蛋白形成的杂合β折叠链。蛋白酶水解切割发生在底物β折叠链的前方。每个切割步骤之后,底物α螺旋会发生一次解旋和转位,并形成一个新的β折叠链。这种机制与现有的生化数据一致,可能可以解释γ-分泌酶切割其他底物的过程。

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人γ-分泌酶识别APP-C99的结构基础

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人γ-分泌酶对Aβ49的特异性识别

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人γ-分泌酶对Aβ46和Aβ43的识别

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人γ-分泌酶裂解底物的机制

大脑神经元中β-淀粉样蛋白(Aβ)聚集是阿尔茨海默病(AD)等神经退行性病变的主要标志和原因之一。Aβ是由γ-分泌酶对淀粉样前体蛋白(APP)进行连续切割产生的,然而,这些多次切割的具体过程尚未完全阐明。

这项研究使用冷冻电镜(cryo-EM)技术观察和描述了人类γ-分泌酶在APP切割过程中如何与不同的Aβ肽底物相互作用。阐明γ-分泌酶如何产生不同长度的Aβ肽,将加深我们对淀粉样蛋白生物学的理解,并有助于开发治疗阿尔茨海默病的策略。

论文链接

https://www.science.org/doi/10.1126/science.adn5820