据《陈毅传》记载：长征出发前，周恩来在百忙之中赶来探望正在医院养伤的陈毅。周恩来告诉陈毅：中央机关明天黄昏时就要出动。因陈毅腿伤、不能远征，中央决定他和项英等领导人留下来，坚持中央革命根据地的斗争。中央革命根据地设立中共中央分局，以项英为书记，陈毅担任中央政府办事处主任。说完这些话，周恩来问陈毅还有什么意见，陈毅回答说：“没有意见”。
考虑到中央马上就要开始长征，陈毅忍着伤痛躺在担架上来到了中革军委的驻地。中共中央总负责人博古见陈毅到来，立刻上前对陈毅表示问候，同时也向陈毅表达了歉意，称他因工作太忙而未能前去看望陈毅。博古知道陈毅是带着疑问前来的，于是向陈毅进一步做了解释：“此次撤出根据地，本想把他抬走，但因他在江西搞了七八年，有名望，党内军内群众中都活动得开，项英到中央苏区两三年，又没有打过游击，所以留下他负责军事，帮助项英工作”。
显然，通过博古的一番话，再结合周恩来跟他说的，陈毅知道，把他留下来坚持斗争，中革军委早就内定好了。这不仅有他负伤不便长征的原因，也有他担任过江西省军区司令员兼政治委员熟悉江西的原因，最主要的还是有他反对“王、博路线”受到宗派主义排挤的根本原因。
对于陈毅留下来不参加长征，私下还是有不少人议论的，他们认为：“这样重伤的高级干部留下来，肯定是凶多吉少，甚至是九死一生”。
对于留下来面对的艰险与生死，陈毅当然也十分清楚。但他知道，革命本来就是艰险的事，革命本来就是需要随时付出生命。他自己对中央革命根据地情况确实比较熟悉，留下他负责军事，可以有所作为，可以使大家觉得共产党并没有放弃中央苏区。
对于关系到生死的走与留，陈毅处之泰然、淡然，体现了一个无产阶级革命家的忠贞本色和坚定性格。
当时，中革军委留给中央苏区的红军部队以及各种武装力量共计1.6万人（另有伤员3万多人），赋予项英、陈毅他们的主要任务是：牵制敌人，掩护红军主力转移，保卫中央苏区和土地革命的胜利成果，在苏区及其周围地区开展游击战争，使侵占中央革命根据地的敌人无法稳定其统治，并准备在适当的时机，配合红军主力部队，在有利条件下进行反击，恢复中央革命根据地。
显然，中革军委留给项英、陈毅的任务是极其艰巨的，甚至是远远超出“客观实际的”、远远超出“其能力范围的”。因此其斗争的艰难、残酷、剧烈程度可想而知。
但陈毅硬是顽强地坚持了下来，尽管这之中频繁地转战打游击，随时经历生与死的考验，甚至在梅岭的时候，被国民党第46师围困达20天之久，苦虑不得脱身时，陈毅仍意志坚定，写下了他那气壮山河的“绝笔”《梅岭三章》，仍发出了“此去泉台招旧部，旌旗十万斩阎罗”的惊天地泣鬼神的豪迈之言。
最终，留下来的陈毅与项英一道，领导了艰苦卓绝的三年游击战争，为共产党在南方保留了多个革命战略支点和红军骨干。国共统一战线达成后，这些人又汇成新四军的铁流，旋即投入到伟大的抗日战争之中。