柯文哲在8 月 29 日就政治献金风波鞠躬致歉，并宣称请假 3 个月以静候调查。然而，仅隔一天，他便因京华城案遭到检廉约谈。9 月 5 日，柯文哲遭羁押禁见，台北地方法院于 11 月 1 日裁定将其羁押期限延长 2 个月。
随着台北地检署对京华城案的持续侦办，民众党中央委员会于 18 日作出决定，将柯文哲的请假期限延长 3 个月，并暂缓推选代理党主席。对于此事，民众党立法机构党团总召黄国昌16日表示，支持柯文哲继续请假，但最困难的是他们不知道柯文哲现在的想法。
此外，民众党中央委员张凯钧、江和树、李国璋共同提案，声称柯文哲遭受了不公正的政治追杀，提请中央委员会批准柯文哲继续请假 3 个月至 2025 年 2 月 28 日。对于投票结果，林富男表示，14 位委员一致通过，柯文哲继续请假 3 个月至明年 2 月 28 日。而该提案也由 14 位委员举手赞成，一致通过，由危机处理小组的 3 位共同召集人处理党内的一切政务。
由于民众党是一个名副其实的“一人政党”，身为党主席的柯文哲就是绝对核心；所以，在柯文哲 锒铛入狱后，民众党立刻陷入了群龙无首的境地；与此同时，各方势力皆蠢蠢欲动，试图抢占更多的话语权。
事实上，黄珊珊尽管掌控着党中央，然而由于政治献金案而被停止党权，只能于幕后进行运筹帷幄；黄国昌虽然在党内拥有颇高的声望，但是当初加入之时曾与柯文哲约定绝不染指党务；至于蔡壁如所领导的地方派系，虽说侥幸躲过了此次风波，可实力相较而言较为薄弱。在这场不见硝烟的接班之战当中，三派势力各自具备优势，同时也各自存在短板。
据媒体相关报道，民众党不分区被提名人李贞秀宣称，今年 4 月柯文哲曾透露，倘若自身健康出现状况，便由黄国昌接任。黄国昌也公开澄清道，自己从未听闻过这种说法，当前党主席依旧是柯文哲。
黄国昌暂时没有“取而代之”的想法，但是，绝对不愿意看到黄珊珊“独揽大权”，成为民众党的领导者；正因为如此，黄国昌一方面全力支持柯文哲继续“请假”，避免民众党进行党主席的改选；另一方面，他在政治舞台上积极行动，在“立法院”大展拳脚；此举，无疑就是想让蓝绿阵营都不敢小觑民众党立法机构党团，都要依赖黄国昌以及民众党立法机构党团。
从过去数月的事件来看，黄国昌的策略取得不错的成效。可以预见的是，一旦柯文哲默认，黄国昌积累的“政治资本”足够多，那么黄国昌必定会立即跳出来，竞选民众党主席的位置。