菲律宾，矿产资源丰富，战略位置重要，使它不可避免地成为了首当其冲的日军攻击对象，与对马来亚的奇袭不同的是，日军采取的是破坏力度极大的正面攻击，使得菲律宾的各大城市，港口受到严重破坏，导致菲律宾全国饥荒，1942年日本取代美国成为新的宗主国后，采取了更残暴的统治，因为菲律宾与其它东南亚小国不同的是，菲律宾更加支持美国，日军解散了菲律宾所有的政治团体，规定“任何企图伤害日本兵和日本平民的行为”，都要枪毙10个菲律宾来报复，同时为了支援正面战场的后勤，成立了食物管制协会，短短三年的时间，日军给菲律宾人民留下了贫困，苦难和社会动荡。
1973年，"最后一名投降的日军"向菲律宾政府投降
日军进攻示意图
菲律宾只得到了最初要求的二十分之一，甚至赔偿的方式对于日本来说都意味着是投资，前日本首相吉田茂说：“对方不喜欢投资的名称，而是使用“赔偿”的字眼，实际上对于我们来说，是投资。”
日本政府付出的赔偿，对于战败后的日本来说，确是加快了日本的经济复兴，促进了日本工业的发展，不但了结了给菲律宾的战争赔偿，又取得了该国的商品市场，同时还达到了只赔偿不认罪的目的。
1945年日本投降后，以美军为首的盟军进驻日本，去军事化管理，要求日本在保证国民最低生活标准下进行战争赔款，根据国际法有资格向日本索取战争赔款的战胜国中，中国、美国、英国、苏联、荷兰、澳大利亚、印度都放弃了战争赔款，而作为太平洋主战场的菲律宾向日本提出了100亿美元的战争赔款。
在日本所侵略的民族中，除了中国外，菲律宾受难其次。因此，战后的菲律宾积极致力于对日索赔，但是作为前美殖民地的菲律宾并没有能力强行要求日本赔偿，日本当局刻意回避，导致多次谈判失败，1952年末，在美国的干预下，日本明确提出赔偿2亿美元，而且是以少量现金与合作开发的形式进行，菲律宾当局拒绝接受，在1956年最终达成的《菲律宾共和国和日本国赔偿协定》中约定：“日本对菲律宾赔偿总额为5.5亿美元，其中5亿产品，3000万为技术劳务，2000万现金分20年付清。”