一、
唐高宗显庆元年，这天上午，中书侍郎的李义府到大理寺视察工作，他听说监狱里关押着一个长得非常美貌的洛州女子淳于氏。
于是，他在大理丞毕正义的陪同下进了监室，立刻就被淳于氏的美貌吸引住了。
这淳于氏是因为谋杀亲夫而被关进监狱的，只等罪名一定就杀头。李义府让毕正义将淳于氏放了。
胆小怕事的毕正义知道李义府与皇后武则天关系密切，他不敢不办。所以就悄悄找了个替罪羊，把淳于氏替换了出来。
李义府大喜，就把淳于氏带回家中纳为小妾。不料这事被大理寺卿段宝玄发现了，就将其告到朝廷，顿时闹得满城风雨。
事关重大，唐高宗亲自过问后，将此案交给事中刘仁轨等监察官员查办。
李义府得知后非常害怕事情败露，就逼迫毕正义自杀，想杀人灭口，逃过此劫。谁知刘仁轨办案严明，最终李义府遭到弹劾。
李义府这人能说会道，善于察言观色，当初，他猜透李治想立武昭仪为皇后，但又害怕大臣们不同意。于是趁机上表，请求废黜王皇后，改立武则天为皇后。唐高宗大喜，武则天也对其感谢不尽。
因此，此案风声一过，李义府很快官复原职，而弹劾他的刘仁轨就倒霉了，很快被贬为青州刺史。
二、
已经60岁的刘仁轨，只好离开京城默默地去青州上任。
就在此时，朝鲜半岛发生内斗，唐朝选择扶持的一派新罗遭到高句丽的攻击，新罗担心亡国，就向唐朝求援。
唐高宗已做好了彻底消灭高句丽的决定，就任命苏定方为大将率兵东出。而作为新任青州刺史的刘仁轨负责筹集军粮，为出征的唐军提供后勤保障。
李义府本来就想报复刘仁轨，于是，他就以朝廷的命令，要刘仁轨立刻组织运粮船奔赴前线。刘仁轨奉命安排民夫及运粮船出海。哪知道很倒霉，运粮船队在海上遭遇风暴，船体侧翻，军粮都被掀到海里去了。
事故意外发生，刘仁轨难辞其咎，唐高宗就令监察御史袁异式查办此案。出发前，李义府找到袁异式，让其严查不待。
袁异式是个聪明人，在见到刘仁轨后，就说：“你在朝廷里得罪了谁，怎么做你自己心里清楚。”暗示要刘仁轨自己上吊自杀。
刘仁轨知道李义府要他死，但他据理力争就是不自尽，袁异式也没办法，只好将此事上报给皇帝。唐高宗召集众大臣商议，李义府坚持要杀刘仁轨，朝臣大多附和。唯独刑部尚书源不同意，他说：“遭遇风暴，是自然灾害，非人力所及，刘仁轨固然有错，但罪不至死。”
这时，识相的刘仁轨赶紧悔罪，表示自己可以不做官，但求为国效力。于是，唐高宗将他贬为庶民，发配至辽东军前效力。
李义府虽然不满唐高宗的决定，但他认为刘仁轨既已参军，那就可以用军法杀他，就密令镇守泗沘城的名将刘仁想办法弄死他。
刘仁从前做过唐太宗的侍卫，为人正直且能文能武。他知道李义府这些年在朝中陷害忠良的事，于是，对于李义府的密令，置若罔闻，没有杀刘仁轨。
这时，唐军已经将朝鲜半岛的百济国占领大半了，但围攻高句丽的战事一直拖到了年底，因朝鲜半岛北部进入冬季，苏定方只能带着部队撤出高句丽，回国休整。
苏定方一撤走，需要留守人员，唐高宗一时半会找不到合适的人，于是就升刘仁轨为朝鲜开城刺史，守卫熊津都督府。
对于这项任命，李义府认为，刘仁轨离死期不远了。因为刘仁轨是文官，不能上阵杀敌。可刘仁轨却欣喜若狂，他接到任命后，就以抗外敌做打算。
这时，百济国的王子不甘心失败，趁机想收复失地，不料，刘仁轨当晚就带人偷袭了他的营帐，逼得这位百济王子带着部属一口气跑出了两百里开外。之后，唐军一路猛追，一举攻克了百济与新罗间的军事重镇真岘城。
收到捷报的唐高宗乐坏了，他同意刘仁轨的请求，派大将孙仁师再率7000将士，分乘170艘舰船，去增援刘仁轨。
刘仁轨料定，百济王子打不过唐军，必然会向日本国求助，而日本要与唐军交战，则必然会派出舰船与唐军在海上一决生死。这正是孙仁师率水军增援的意义。果然，日本发兵27000余人来打唐军。
刘仁轨虽然有孙仁师带来的7000唐军，但合并之后，唐军总兵力不过两万，在人数上远不是日本军的对手。
这年的8月28日，中、日决战打响了。刘仁轨用兵如神，以少胜多，摧毁日军400百艘战船。战下倭寇不甘心失败，重新集结400余艘战舰对唐军发动猛攻。
刘仁轨沉着应战，发射7支射程超过1000米的巨箭，直接摧毁前方日军战船。刹那间，烟焰涨天，唐朝水师大获全胜。
倭国战败后，百济复国无望，只好臣服，奉唐为正朔。至于高句丽，在失去盟友百济的情况下，又坚守了六年，最终灭亡。从此，朝鲜半岛进入新罗统一时代。
刘仁轨收复了百济故地后，并没有立即撤军西还，而是在熊津驻军，缓解唐朝东境的边防压力。
留在熊津都督府几年之后，年逾古稀的刘仁轨才获得朝廷特许，回国述职。
唐朝向来十分看重军功，刘仁轨此番回国，摆脱了数十年怀才不遇的境遇。
看到白发苍苍的刘仁轨，唐高宗激动不已，不光热情地招呼他入阁拜相，还多次委派他改修国史、出镇吐蕃、留守长安。
可此时的刘仁轨已然年老体衰，他多次向唐高宗请辞，得到的却是朝廷一而再、再而三的挽留。即便唐高宗最后同意了，过段时间也还是将其返聘回朝。
有别于已经去世的李义府，刘仁轨身居高位却从不打击报复他人。
三、
刘仁轨回朝任大司宪时，从前得罪过他的监察御史袁异式担心刘仁轨报复，可没想到，刘仁轨上任的第一天就专程找他喝酒，并向他保证，自己绝对不会做出此等事情。还推荐其为户部郎中。
683年12月，唐高宗驾崩，太子李显继位，此时，武则天掌权，她以躲避关中大旱之名，迁往洛阳居住。
作为唐朝首都，长安即便没有君主坐镇，其行政的重要性依旧不容忽视，所以，武则天出发前便将偌大的长安委托给刘仁轨打理。
此时，刘仁轨已年过八旬。虽然他不忍坐视“女主当政”，但这个时候他已然明白，自己根本无法左右唐朝的政局更迭。
684年2月，唐中宗李显遭武则天废黜，豫王李旦继位，成了傀儡皇帝，失去行动自由。
不久，武则天以太后的身份宣布改革唐朝官制，感受到世事沧桑，刘仁轨默默地递交辞呈，打算离开回乡养老。
听闻刘仁轨要走，武则天立即传旨晋刘仁轨为尚书左仆射，并派自己最信任的侄子武承嗣拿着自己的亲笔信，前去抚慰他，挽留他。因为她知道，以刘仁轨四朝元老的威望，这位重量级人物的去留，将直接影响自己登基的难易程度。
但，刘仁轨早已预料到武则天会拿自己树立典型。在给武则天的回信中，他警示武则天不要胡来。
当然，刘仁轨也给自己留了条后路，就是不干预武则天专权。
此后，无论刘仁轨有多想辞职回家，武则天始终都是一个态度：“不批准。”
一直到685年正月，84岁的刘仁轨病逝于长安。武则天闻讯，立即命在京官员依次到他家中吊祭，并准许其陪葬乾陵，并让刘仁轨的子孙后代承袭家业。