南都讯 记者谢萌 6月21日，微生物研究领域顶级国际期刊《Nature Microbiology》刊登了深圳市宝安中医院（集团）副院长黄链莎副教授（生殖健康科）、转化医学中心孙文助理研究员与大连医科大学鄢秋龙副教授等课题组的研究论文“A multi-kingdom collection of 33,804 reference genomes for the human vaginal microbiome”。
人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统，各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖的对立统一，其间的平衡关乎女性生殖健康及胎儿孕育。此前跨multi-kingdom的阴道微生物组的基因组水平分析存在一定的限制性。
研究团队通过宏基因组测序数据和微生物培养技术建立了庞大的女性阴道微生物基因组集合，为生殖道复杂的微生物生态系统提供了全面的表征，标志着在理解人类生殖道微生物方面取得重大进展。团队建立了包含786种原核生物、11种真菌和4263个病毒操作分类单元（vOTUs）的人类阴道微生物基因组集合（Vaginal Microbiome Genomes Collection，VMGC），总计超过33,000个。
该成果首次发现了多种新型阴道病原体的基因组数据，如BVAB1和BVAB2，并对其功能特性和生态位适应进行了描述，揭示了它们在维持生殖健康和导致疾病发生的潜在作用。借助该集合，还鉴定了原核生物和真核病毒关键基因组变异和功能特性，且该研究建立的VMGC包含了100万个特殊的基因序列，在广度和深度上大大超越了现有的数据库，使深入探索生殖道微生态在女性生殖健康中的作用成为可能。
新的VMGC揭示了前所未有的微生物多样性和对健康的潜在影响，是研究阴道微生物群及其对阴道健康影响的宝贵资源，为开发针对生殖疾病预防、诊断和治疗新方法等应用奠定坚实基础。
据悉，这也是深圳市宝安区中医系统内首次以第一单位在国际顶级学术期刊上发表研究论文。近年来宝安中医院（集团）着力推进科研与创新工作，通过以临床为导向，科研强推动，加速促进创新成果转化，打造“医、学、研、创、用”一体化的创新链，进一步强化新质生产力的培育和发展，以创新引领，赋能高质量发展，为医院打造先行示范的研究型中医院奠定坚实基础。
【论文链接】
https://www.nature.com/articles/s41564-024-01751-5