综合工具的任务是将SoC设计映射到可用的FPGA资源中。自动化程度越高，构建基于FPGA的原型的过程就越容易、越快。
SoC设计到FPGA原型设计的三个“定律”：
法则1：SoC规模一般大于单个FPGA规模（SoC的规模一般比较大）
法则2：SoC速率比FPGA速率更快（FPGA虽快但不及SoC快）
法则3：SoC设计方法和FPGA设计方法是有些不一致的（需要移植）
这些“定律”的会带来如下挑战：
a) 设计可能需要分割到多片FPGA系统；
b) 该设计可能无法以全SoC速度运行；
c) 为了使FPGA就绪，设计可能需要一些代码的返工移植工作。
诚然，这些挑战确实比较大，有时会被打破，例如，一些SoC设计确实只需要一个FPGA来原型，从而打破了第一条法律。然而，这三条定律很好地提醒了使用基于FPGA的原型时需要克服的主要问题，以及为FPGA做好设计准备所需的步骤。
综合方法
执行原型设计的最重要原因之一是与其他验证方法（如Simulation）相比，实现尽可能高的性能；然而，综合结果如果不够完美会危及这一目标。为了实现更快的运行时间，一些合成工具允许使用快速通过的低工作量综合，或者减少综合目标是很有吸引力的，正是为了这种权衡。然而，在某些设计块中，为了满足原型的总体性能目标，必须获得最佳的综合结果。综合工具有许多特性，通常对原型开发人员有益。其中包括：
快速综合：一种操作模式，其中综合工具忽略一些完全优化的机会，以便更快地完成综合。通过这种方式，以FPGA性能为代价，可以使运行时间比正常速度快2到3倍。如果综合运行时间以小时为单位，那么这种快速模式将在原型项目期间节省许多天或数周的等待时间。快速合成运行时在最初的分区和实现试验中也很有用，因为只需要估计设计大小和粗略的性能。
增量综合：在这种操作模式中，设计被视为每个FPGA内的块或子树。综合工具维护每个子树的历史版本，并可以注意到新的RTL更改是否影响每个子树。如果增量综合识别出子树没有改变，那么它将避免重新综合，而是使用该子树的历史版本，从而节省大量时间。增量综合引擎的决策作为放置约束被前向注释到后端布局布线工具，以便保持先前的逻辑映射和布局。考虑使用增量综合可以显著减少从小型设计变更到FPGA板上最终实现设计的周转时间。
物理综合：一种针对物理实现优化综合的功能，其中工具考虑了实际的路由延迟，并产生逻辑布局约束，供布局布线工具使用。该特征通常为设计产生更快和更准确的定时闭合。这似乎与我们对上述快速综合的考虑相矛盾，但通常情况下，原型中的一个特定FPGA难以达到全速，因此选择性地使用物理综合是一种使FPGA能够更快地完成定时关闭的方式。
尽管FPGA容量已根据摩尔定律增加，但SoC设计本身的尺寸和复杂性也有所增加，因此SoC设计通常仍大于当今最大的FPGA设备。因此，原型设计的第一定律越来越在多数情况下显得正确，那么FPGA原型设计者面临的任务是将SoC设计划分为多个更小的FPGA器件。
RTL级别的分区
该流程通常是自上而下执行的，这要求分区工具和它们运行的工作站具有容纳整个SoC设计的能力，其数据量可达千兆字节。因此，工具效率和运行时间可能成为重要因素，需要考虑从RTL更改到新版本的设计分区并在原型板上运行。
最初，RTL分割方法要求在整个设计中进行编译和合成，这可能会导致运行时间过长，并需要大量的服务器资源。然而，在所有FPGA上并行执行FPGA综合，这需要分割工具对每个FPGA的最终结果进行估计，以便推断每个设备上IO的时序预算。好处是，通过并行运行多个综合工具，总运行时间大大提高。每次RTL更改和bug修复的周转时间都会相应减少，特别是在使用增量综合布局布线技术的情况下。
这种流动的缺点是它实际上是一种双通道流动。为了进行正确的分割，需要了解每个RTL模块所需的最终FPGA资源。如果可能的话，如果定时驱动分区是我们的目标，那么每个模块边界的时序知识也会很有用。这种对资源和时间的准确了解只能来自综合（或者最好来自地点和路线）。因此，在将结果反馈给分区器之前，我们需要提前跳过并预运行综合。为了估计资源和时间，综合以快速通过自动模式运行。因此，尽管是两程流程，但实际上预合成似乎是单程流程中的额外“估计”步骤。
自顶向下的RTL分割功能最强大的情况是性能，特别是FPGA间性能至关重要。通过自上而下的工作和使用系统级约束，RTL分割允许同时在多个FPGA之间对时间进行预算和约束。该合成还更能够考虑板级延迟和引脚复用，以便在各自的流中正确地约束各个FPGA。
综合后网表级别分割
下图显示了单个模块如何被合成并分别映射到FPGA元件中，从而产生大量的门级网表。网表被组合成一个层次结构，然后重新分组为FPGA大小可以容纳的规模。同时，为FPGA调整网表（例如，将门控时钟更改为启用），并为将在外部建模的模块（例如，RAM）创建包装器。
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