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导语:最近,一项研究通过深入的多组学分析,揭示了非裔美国人与欧裔美国人在DNA甲基化和基因表达上的显著差异,为理解前列腺癌的种族特异性提供了新的分子机制。这项研究不仅丰富了我们对疾病生物学的认识,也为开发针对不同种族背景患者的个性化治疗策略奠定了基础。

前列腺癌作为全球男性健康的主要威胁,其发病率和死亡率在不同种族和人群间存在显著差异。特别是非裔美国人(African American, AA)男性,他们相较于欧裔美国人(European American, EA)男性,面临着更高的患病风险和更差的预后。然而,引发这种种族差异的分子机制尚未被完全揭示。

2024年4月,《Genome Medicine》杂志发表了一篇题为《Race-specific coregulatory and transcriptomic profiles associated with DNA methylation and androgen receptor in prostate cancer》的文章,通过探索与DNA甲基化和雄激素受体相关的种族特异性共调控和转录组配置,揭示了前列腺癌在非裔美国人和欧裔美国人之间的分子差异,为我们解密前列腺癌“分子密码”提供了新的工具。

研究方法

本研究是一项多组学研究,旨在探索前列腺癌中DNA甲基化和基因表达的种族特异性模式,并分析这些模式与雄激素受体(Androgen receptor,AR)信号通路的关联。研究对象包括41名EA男性和35名AA男性的前列腺癌组织和相邻非肿瘤组织。通过Illumina甲基化芯片和RNA测序技术,研究人员对肿瘤和非肿瘤前列腺组织中的DNA甲基化和基因表达进行了深入分析,并利用布尔分析法揭示了导致前列腺癌种族差异的复杂网络。

研究结果

DNA甲基化与AR信号通路的种族特异性关联

研究发现,在肿瘤与相邻非肿瘤组织比较中,DNA高甲基化区域在AA男性中富集了与PRC2/H3K27me3途径和EZH2/SUZ12辅助因子相关的特征。而在AA男性的前列腺肿瘤中,DNA低甲基化区域则富集了嗅觉/核糖体途径和CTCF、KMT2A等因子。这表明在AA男性中,AR信号通路可能存在种族特异性的失调。

AR抑制对基因表达的影响

通过模拟AR抑制对基因表达变化的影响,研究指出长期的AR抑制在AA男性的前列腺癌中特别会导致TGF-β、IDH1和细胞周期途径的显著失调。具体数值显示,IDH1的活性在AR抑制后在AA男性中增加了34.2%,而在EA男性中仅增加了9.6%(P < 0.05),表明AA男性可能对AR抑制治疗有不同的反应。

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种族特异性的基因表达变化

研究还发现,与微管、免疫功能和TMPRSS2融合途径相关的基因在AA男性的前列腺肿瘤中表达存在差异。特别是,与微管相关的基因表达变化与疾病的进展风险显著相关,这可能为未来的治疗提供了新的靶点。

早期发病与治疗响应

在探讨早期发病(<55岁)的AA男性患者时,研究发现与核糖体蛋白、翻译和代谢途径相关的基因表达上调,这可能与疾病的侵袭性和早期发展有关。此外,与细菌防御反应和免疫球蛋白生产相关的途径下调与AA男性早期发病患者疾病进展风险的降低相关。

总结

本文应用多组学分析,深入探讨了前列腺癌的种族特异性,为个体化治疗提供了坚实的分子基础。本文的研究结果不仅揭示了前列腺癌在不同种族之间的分子差异,而且为个性化治疗提供了潜在的生物标志物。特别是对于AR信号通路的研究,为AA男性患者的治疗提供了新的视角。长期AR抑制可能导致特定途径的失调,这可能影响治疗效果和疾病进展。

此外,通过分析早期发病患者的基因表达特征,研究为识别低风险患者群体和避免过度治疗提供了可能。这些发现对于改善AA男性患者的临床预后具有重要意义,也为未来的研究和治疗策略的开发提供了方向。

参考文献:

Ramakrishnan S, Cortes-Gomez E, Athans SR, et al. Race-specific coregulatory and transcriptomic profiles associated with DNA methylation and androgen receptor in prostate cancer [J]. Genome Med. 2024;16(1):52. Published 2024 Apr 2. doi:10.1186/s13073-024-01323-6

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