刚刚谷歌DeepMind和制药初创公司Isomorphic Labs共同推出了人工智能模型
AlphaFold 3
能够前所未有地精确预测蛋白质、DNA、RNA、配体等生命分子的三维结构及它们之间的相互作用，这将开启人工智能细胞生物学的未来
opencat 第一时间带来解读
AlphaFold 3模型概述
AlphaFold 3的核心是一种名为Evoformer的新型深度学习架构,以及覆盖所有生命分子的大规模训练数据。该模型先处理输入的分子数据,然后通过一个类似于图像生成器的扩散网络,从一片原子云开始,经过多个步骤不断优化,最终收敛得到高精度的分子结构预测
AlphaFold 3根本性突破
AlphaFold3最根本的突破在于:
通过单一模型全面预测生命分子结构及相互作用
具体来说:
- 预测范围之广
AlphaFold 3能够预测从巨大的蛋白质、DNA、RNA分子,离子和化学修饰组成，到小分子配体药物等所有生命分子的三维结构。不仅如此,它还能预测这些分子之间如何相互作用、组合在一起。这是第一个能够统一预测生命分子全貌的人工智能系统
- 预测精度之高
在关键的分子相互作用预测上,如蛋白质与配体、抗体结合等,AlphaFold 3的准确率比现有最佳方法提高50%以上,某些类型的相互作用预测准确度更是翻了一番。它是首个在分子结构预测上超越传统物理方法的AI系统
AlphaFold 3 在预测类药物相互作用方面实现了前所未有的准确性，Isomorphic Labs 正在将 AlphaFold 3 与一套互补的内部 AI 模型相结合，致力于内部项目以及与制药合作伙伴的药物设计
- 预测方式之新
AlphaFold 3采用了全新的Evoformer深度学习架构,并通过类似图像生成的扩散模型,以一种全新的端到端、整体计算的方式得到分子结构预测,而不是将问题分解成子问题分步解决
正是这种通过单一模型对整个生命分子王国进行高精度、整体性预测的根本性突破,赋予了AlphaFold 3革命性的影响力,有望加速生物学研究突破瓶颈,促进药物、材料、农业等重要领域的创新
提供全球免费使用
AlphaFold Server是DeepMind新推出的一款免费在线服务平台,让世界各地的科研人员能够轻松获取由AlphaFold 3模型生成的生命分子结构与相互作用预测结果
通过免费开放AlphaFold Server,DeepMind希望赋能全球科研人员,利用AlphaFold 3的强大功能,加速生物学研究进程,在疾病治疗、作物育种、新材料开发等领域实现突破性进展
使用地址
AlphaFold Server: alphafoldserver.com
结语
AlphaFold 3 将生物世界带入高清。它使科学家能够了解细胞系统的所有复杂性、结构、相互作用和修饰。这个关于生命分子的新窗口揭示了它们是如何相互联系的，并有助于理解这些联系如何影响生物功能——例如药物的作用、激素的产生和 DNA 修复的健康保护过程
详细信息
https://blog.google/technology/ai/google-deepmind-isomorphic-alphafold-3-ai-model/#life-molecules
https://www.nature.com/articles/s41586-024-07487-w