松浦氏起源
根据各种松浦氏家谱，松浦氏出自嵯峨源氏。嵯峨天皇皇子源融的后裔渡边纲（渡边氏的祖先），是清和源氏3代目源赖光麾下四天王之首。源赖光在正历元年（990年）被任命为肥前守，带着手下朗党到松浦郡上任，住在筒井村，任期结束后在正历5年（995年）回京都。在此期间，渡边纲的儿子在奈古屋（名护屋）出生，取名奈古屋授（源次授、渡边授）。奈古屋授的儿子是泷口泰，泷口泰的儿子是松浦久是松浦氏的祖先。也有说法松浦氏是在前九年之役中被源氏击败后流放九州的安倍宗任的后裔。
延久元年（1069年），松浦久被任命为肥前国松浦郡宇野御厨的庄官，领有松浦郡、彼杵郡以及壹岐国的领地约2230町，后来又被任命为检非违使，官位为从五位。松浦久又被称为源太夫判官，治理着松浦郡、彼杵郡的一部分以及壹岐岛。松浦久在今福梶谷建立了居馆，在背后的城山上建立了胜屋城，奠定了松浦氏发展的基础。
松浦久的儿子有松浦直（松浦安）、波多持、石志增（石志胜）、荒久田闻、神田广、佐志调、松浦正（松浦公赖）和养子松浦高俊，松浦直的儿子有松浦清、有田荣、大河野游、峰披、山代围、值贺连，各自建立了分家，这些人的后代中又分出新的分家。
关于松浦氏的家谱，目前流传的大约有30种左右，各自的内容都有不同，具体传承无法确定。
松浦党的发展
松浦氏一族以各自据点的地名为姓氏，由于大多居住在岛屿或者沿海地区，与朝鲜半岛、中国大陆隔海相望，利用船从事贸易的机会较多。同时由于靠船生活，作为水军，有时候也会从事掠夺财物等营生，在中央贵族眼中留下海盗惯犯的形象，因此被蔑称为松浦党。
关于松浦党的由来也有其他说法。从平安中期到室町时期的肥前国有宇野御厨庄。原本御厨是在古代、中世纪时期向朝廷上供鱼贝类祭品的地方。宇野御厨庄是横跨筑后、肥前的广阔的海、河川地区，但随着时代的变迁，地区逐渐被限定，到平安末期仅指小值贺岛、五岛等地区。十二世纪，宇野御厨庄的地头据说有二十多个，出自源氏、平氏、藤原氏、清原氏等氏族。他们在以肥前国的南、北松浦郡为中心的地区活动，开发田地，逐渐发展为当地领主，互相联合也互相争斗。松浦氏的松浦直担任宇野御厨执行兼总追捕使。松浦直的后裔为了壮大松浦氏，将这些本姓不同、来源复杂的诸氏族编入松浦氏一族，逐渐形成了松浦党。
平安时代，松浦党盘踞的地区是平家的领国，所以松浦氏是平家的御家人。但在源平合战后，松浦党转为投靠源氏，成为镰仓幕府的镇西御家人，在当地担任地头。正治元年（1199），宗家松浦清和大河野游、山代围等人进入镰仓，得到了领地保全的朱印状。但是，源赖朝对原本臣属平家的九州豪族信任度很低，为了控制九州，将少贰氏、岛津氏、大友氏等作为守护派遣到九州，松浦氏与秋月氏、蒲池氏等势力，被置于这些新来的东国御家人麾下。
元朝第一次入侵时期，松浦党一族中佐志氏的佐志房和山代氏的山代阶等都参加了战斗。在肥前国松浦郡与蒙古军战斗的佐志房和三个儿子佐志直、佐志留、佐志勇一起战死，松浦党有数百人被杀或被俘虏，松浦郡和壹岐岛被蒙古军蹂躏。
幕府为了防备元军的再次来袭，在九州北岸特别是博多湾附近建立了防御阵地。以相神浦松浦定为首的松浦党的各族也参加了建造。
弘安四年（1279年），元军再次来袭，从平户岛侵入五岛列岛一带，逼近博多。松浦氏一族一起奋战。战后，松浦党向幕府请求恩赏，但没有被接纳。在幕府看来，这是一场防御战斗，没有多余的土地封赏。松浦党的代表志佐氏、山代氏、有田氏向镰仓提出了诉讼，最终得到了肥前国神崎庄内的土地。
镰仓幕府末期，后醍醐天皇为推翻幕府发动了正中之变、元弘之变，各地方势力起兵响应。幕府在九州的镇西探题在少贰氏、大友氏等的进攻下灭亡。松浦党各氏族有的支持幕府，有的参加倒幕。
建武3年（1336年），在京都的权力之争中失败的足利尊氏为了东山再起逃到了九州。此时，松浦党的一部分氏族加入了进攻足利尊氏的菊池武敏方的军队。但是在多良滨之战后，足利尊氏的势力大增，松浦党各族又投入足利尊氏麾下。
南北朝动乱时期，北朝方足利尊氏任命一色范氏作为九州探题经营九州。南朝方面以菊池氏为中心集结势力，兴国3年（1342年），后醍醐天皇的皇子怀良亲王作为征西将军宫登陆萨摩。随着观应之乱爆发，足利氏内部陷入纷争，足利尊氏的庶子足利直冬进入九州。九州地区出现北朝九州探题、南朝宫方和足利直冬三大势力鼎立的局面。
各势力都尝试将松浦党团结为整体纳入麾下。应安4年（1371年），今川了俊被任命为九州探题。他推动松浦党各族通过地缘关系签订了合作协议。松浦党的合作协议在应安6年（1373年）到明德3年（1392年）的约20年间签订了4次。
根据居住地区的不同，松浦党大致分为上松浦党和下松浦党。上松浦党在松浦久以来以岸岳城为中心，拥有巨大的势力，但其中势力最大的波多氏在战国时代灭亡了。作为下松浦党旁系的平户松浦氏，在战国时代后期逐渐成为松浦党中硕果仅存的独立大名，关原之战以后，作为外样大名平户藩存续。
相神浦松浦氏
松浦氏的嫡流是松浦清的今福松浦氏，据点在梶谷城。松浦清的儿子松浦尧在相神浦新建了城堡，并迁移至此。之后直到战国时代初期，相神浦都是松浦氏宗家的据点。元朝入侵时，松浦定与松浦一族一起奋战。
南北朝争乱时代，相神浦松浦氏的当主松浦正致力效忠南朝，但嫡子松浦清支持足利氏。南北朝统一后，相神浦松浦氏领地得到保全。
室町时代，松浦党的各族都处于各自割据的状态。
到了战国时代，为了防备北方的平户松浦氏的南进和南方的有马氏、大浦氏等势力的北上，松浦盛在从相神浦通往佐世保的要地大野的濑户越筑起了大智庵城，并迁移到此。
延德3年（1491年），平户松浦氏发生了内讧，平户松浦氏一族、继承田平峰氏的峰昌和继承平户松浦氏的弟弟松浦弘定对立，受到松浦弘定的攻击而失败的峰昌投靠了有马氏。有马贵纯邀请大村纯忠、相神浦松浦定等进攻平户。
在联军的攻击中败北的松浦弘定逃离平户，向周防的大内义兴寻求支援。在大内义兴的斡旋下，松浦弘定恢复了领地，但平户松浦氏怨恨相神浦松浦氏，两家开始互相争斗。
延德4年/明应元年（1492年），松浦政继承相神浦松浦氏，成为大智庵城主，领有相神浦、有田、今福、黑岛、鹰岛、佐世保等地。明应7年（1498年），松浦政在狩猎时与家臣山田四郎左卫门结怨，从相神浦出奔的山田四郎左卫门兄弟，投靠了平户松浦氏，向松浦弘定表示愿意成为向导，讨伐松浦政，松浦弘定也准备报仇雪恨。
明应7年（1498年）十二月，松浦弘定、松浦兴信父子以大野源五郎为总大将，在山田兄弟的带领下从小道突袭了大智庵城。大智庵城仅一夜就被攻陷，松浦政自尽，平户军把松浦政的妻子和儿子幸松丸作为人质带回了平户。
明应8年（1499年），松浦政的遗臣趁松浦政的妻子和幸松丸参拜今福年神宫，将他们夺回。幸松丸进入有田的唐船城，在那里成长。成年后，幸松丸改名松浦亲，与家臣们一起谋求恢复旧领。
永正九年（1512），松浦亲举兵夺回大智庵城和武边城，与平户松浦氏对抗。不久，在龙造寺氏的斡旋下，相神浦松浦氏与平户松浦氏达成和解。享禄4年（1531年），由于舅舅少贰资元的奔走，室町幕府要求平户松浦氏归还今福、有田等领地，松浦亲恢复了旧领地。为了巩固与少贰氏的关系，松浦亲将少贰资元的儿子松浦镇收为养子。随着少贰氏的势力逐渐衰退，为了与在岛原一带扩大势力的有马氏结盟，松浦亲收有马晴纯子松浦盛为养子。得到有马氏做后盾的松浦亲，企图向平户松浦氏复仇。
天文4年（1535年）左右，松浦亲建造了新的居城饭盛城。
平户松浦隆信以南进为目标，进攻相神浦松浦氏。天文十二年（1543），松浦隆信攻打了松浦亲的领地鹰岛、今福，第二年又攻打饭盛城，饭森城地势险要，平户军攻打一年有余也没有攻下，但饭森城下町被平户军大肆破坏，领民受损严重。松浦亲被迫接受有马是的仲裁，以割让鹰岛为代价与平户讲和。
永禄六年（1563年），作为相神浦松浦氏后盾的有马氏在龙造寺氏的打击下，势力衰退。平户松浦隆信趁机发兵进攻相神浦。平户势从海陆两面进军，突袭饭森城。相神浦军顽强抵抗，战斗一直持续到永禄九年等不到有马氏援军的，相神浦军逐渐陷入劣势。最终在龙造寺氏等的中介下，松浦亲收松浦隆信的三儿子松浦亲（与养父同名）为养子，臣服于平户松浦氏。下到了平户松浦家。为了维持与有马氏的关系，松浦亲让养子松浦亲继承相神浦成为第17代当主，另一个养子松浦盛（有马晴纯子）继承有田的唐船城，自己则出家归隐了。随着作为松浦氏宗家的相神浦松浦氏屈服于平户松浦氏，平户松浦氏成为了松浦氏的总领家。
元龟2年（1571年），第17代当主松浦亲攻打了针尾岛的针尾氏。元龟3年（1572年）1月20日，在松浦盛家老山本右京的内应下，松浦亲攻下唐船城。同年，因城主远藤盛胤内通龙造寺氏，松浦亲攻下佐世保城。
天正2年（1574年），松浦亲想诛杀对立的重臣东时忠，结果被东时忠刺杀。儿子松浦定继承为第18代当主。
天正5年（1577年）第16代当主、隐居多年的松浦亲去世。
天正十五年（1587年），丰臣秀吉发动九州征伐，相神浦松浦氏加入了丰臣方，年幼的松浦定作为松浦氏的人质被送到堺港。
文禄2年（1593年），松浦定跟随松浦镇信参加侵朝战争，在平壤战死。子孙被德川幕府提拔，世世代代居住在江户，作为幕府旗本存续。
平户松浦氏
平户松浦氏出自松浦直的儿子峰披。峰披的子峰持因为母亲是弁济使藤原真高的女儿，继承了峰披的领地峰、鹰岛、平户、小价贺等地头职和母亲的职位，成为下松浦拥有最广领地的人。峰持当初住在小价贺岛，后来将据点转移到平户，自称平户氏，奠定了平户松浦氏的基础。
峰持的儿子平户繁从宇久氏收养了平户湛。平户湛时期元朝入侵，平户湛与嫡子平户答一起出阵。继承平户答的平户定遭遇了南北朝的动乱，支持南朝的后醍醐天皇，建武中兴后被任命为肥前守。平户定在战场上武力超群，被称为鬼八郎。北朝足利尊氏的势力大增后，松浦党各氏族大部分投入足利尊氏麾下，只有平户定坚定效忠南朝方。
之后的平户胜转为北朝方，被允许使用肥前国司的称号。南北朝统一之后，平户胜制定了松浦党的规章，进一步加强了团结。
永享九年（1437），平户胜的儿子平户义在谒见将军足利义教时，戴着赤乌帽子，被义教信任和重用，留下了“肥前赤乌帽子”的绰号。嘉吉之乱（1441年）时，他参加了攻打赤松氏居城白旗城，立下了战功。
平户义之后是松浦丰久。这时期，平户松浦氏逐渐扩大势力。永享年间（1429～1440），松浦丰久征服了生月、一部、山田、加藤等势力，控制了北松浦半岛，文明八年（1476）征服佐佐。
由于田平的峰弘没有嗣子，松浦丰久让长子峰昌（后来继承志佐氏改名为志佐纯元）继承田平峰氏，让次子松浦弘定继承平户本家，三子赖继承佐佐，四子荣继承田平的小手田和生月的山田，五子定久继承吉田，六子始继承紫加田，松浦丰久通过分封诸子守备各地，谋求统治的稳固。
继承田平峰氏的峰昌与养父峰弘不和，峰弘临终遗言田平不给峰昌继承，而是托付给平户本家的松浦弘定，因此峰昌与松浦弘定关系恶化。重臣大岛筑前父子进行斡旋，但峰昌没有接受，最终寻求有马贵纯的支持，大村纯伊、宗家相神浦松浦氏等也支持峰昌。延德三年（1491年），联军进攻松浦弘定。
松浦弘定放弃白狐山城，据守中野的箕坪城。由于联军的围攻，城中的粮食逐渐耗尽。三个月后，松浦弘定从海路逃到筑紫，向大内义兴求援。在大内义兴的斡旋下，松浦弘定得以恢复旧领地，但松浦弘定怨恨相神浦松浦氏，两家开始对立。
明应七年（1498），松浦弘定以相神浦松浦氏家臣山田四郎左卫门为向导，奇袭大智庵城，杀死相神浦当主松浦政，将松浦政的妻子和孩子幸松丸作为人质带回平户。
第二年，松浦政的遗臣们夺回了松浦政的妻子和幸松丸，幸松丸进入有田的唐船城，在那里成长，即后来的松浦亲。
松浦弘定之后由志佐纯元（峰昌）的长子松浦兴信继承。为了积累财力，松浦兴信积极进行海外交易，允许葡萄牙船进入平户港。
永正九年（1512年），相神浦松浦氏对平户松浦氏发动反攻。在龙造寺氏的斡旋下，双方议和。同时在支援相神浦松浦的少贰氏的奔走下，平户家将控制的相神浦一带还给了相神浦家。
松浦兴信援助因玉之浦纳的叛乱失败而避难的宇久盛定于永正18年（1521年）回归旧领。
松浦兴信之后由松浦隆信继承。当时平户居住着很多明朝商人和海盗，号称“五峰”的海盗头目王直就在胜尾山建造宅邸，传说是他最早带着葡萄牙商船到平户的。松浦隆信向大友义镇申请贸易许可，开始与葡萄牙人开展贸易（南蛮贸易）。
天文19年（1550年），耶稣会传教士弗朗西斯科·扎维尔从被拒绝传教的鹿儿岛来到了平户。由于松浦隆信允许传教士在本地传教，1553年至1561年期间，葡萄牙船每年都会来航，平户作为贸易中心而繁荣起来，松浦隆信率先购买了枪、大炮等西式武器。
虽然优待西方传教士，但松浦隆信信仰曹洞宗不认可基督教，领地内信徒的增多导致冲突发生。永禄元年（1558年），松浦隆信命令传教士加斯帕·维雷拉离开平户，佛教徒趁机烧毁教会。永禄4年发生因商业纠纷导致葡萄牙人被杀伤的事件（宫之前事件），葡萄牙商船转移到了大村纯忠的横濑浦。
然而，随着大村纯忠受洗入教，大村氏领地发生骚乱，横濑浦被烧毁。永禄7年（1564年）松浦隆信请求葡萄牙商船重新入港，教会也被重建，但第二年葡萄牙人还是离开了，在路易斯·弗洛伊斯等人的周旋下，葡萄牙人在大村纯忠领地的长崎港开展贸易，平户的葡萄牙贸易结束了。
通过贸易积累的巨额财富，松浦隆信在领内制造火枪、储备火药和训练火枪部队，增强了实力，成功压制了领地内的3个倭寇据点。永禄六年（1563年），松浦隆信进攻相神浦。双方一直交战到永禄九年，战况逐渐对相神浦方不力。最终在龙造寺氏等的斡旋下，相神浦松浦氏收松浦隆信的三子松浦亲为养子，成为了平户松浦氏的家臣。
之后松浦隆信持续征战扩大领土，到永禄年间成功压制了北松浦半岛。随着龙造寺隆信的崛起，松浦党各氏族陆续臣服龙造寺氏，平户松浦氏也被迫屈服。
永禄11年（1568年），松浦隆信将家督让给嫡子松浦镇信后隐居，但据说松浦隆信仍掌握实权。
元龟2年（1571年），松浦镇信将壹岐置于统治之下。
元龟3年（1572年），松浦镇信攻打大村纯忠，到天正2年（1574年）终于使之屈服，大村纯忠的女儿松东院嫁给松浦镇信的儿子松浦久信，两家和解。
天正9年（1581年），直谷城主志佐纯正的弟弟志佐纯意娶了松浦隆信的女儿，攻灭了志佐纯正的儿子志佐纯量，志佐氏投入平户松浦氏旗下。
天正12年（1584年）冲田畷之战爆发，龙造寺隆信战死，平户松浦氏恢复独立。
天正14年（1586年）3月，松浦镇信向已经控制大半个日本、想要染指九州的丰臣秀吉献上贡品，与丰臣秀吉建立了友好关系。4月，平户松浦氏受到大村纯忠、有马义纯、宗义智、波多信时、有田盛等的围攻，松浦镇信广田城合战中击退了将联军击退。
天正15年（1587年），丰臣秀吉发动九州征伐，松浦镇信和父亲一起加入了丰臣方，领地得到保全。
天正18年（1590年）的关东小田原征伐中，松浦镇信派出了水军参战。
文禄侵朝战争时期，松浦镇信与弟弟松浦信实、儿子松浦久信一起出征，与大村喜前、有马晴信、五岛纯玄等肥前诸将隶属于小西行长的第一军，在朝鲜度过了7年，在鹊院关之战、蔚山城之战、顺天城之战、露梁海战等战役中功不可没参与出征。文禄2年（1594年），父亲松浦隆信被秀吉委托监督壹岐、五岛列岛和朝鲜间的军粮米运输，获得嘉奖。
庆长4年（1599年）,松浦镇信开始建设龟冈城(后来的平户城）。这一年，隐居的松浦隆信去世，享年七十二岁。
庆长5年（1600年）关原之战爆发，在大阪的松浦久信加入了西军，但在本国的松浦镇信邀请了肥前的大村喜前、有马晴信、五岛玄雅，聚集在神集岛讨论加入哪个阵营，虽然四人在之前的文禄庆长之役作为小西行长属下的第一军一起战斗，但最终大家接受了大村喜前的意见，加入了支持德川家康的东军。为了不引起德川家康的疑虑，松浦镇信将建设中的一部分城堡烧毁了。战后，松浦镇信壹岐和松浦郡6万3200石的领地得到幕府认可，成为了肥前平户藩第一代藩主。松浦久信也没有被追究责任。
庆长8年（1603年），松浦久信去世，松浦镇信带着孙子松浦隆信到江户拜谒德川家康。
庆长12年（1607年）建筑途中的平户城被大火袭击后几乎全部烧毁。平户松浦氏虽然拥有壹岐国和肥前两个郡，却没有国主大名的待遇，成为了无城大名。直到宝永元年（1704年）平户城开始重建，享保3年（1718年）才建设完成。
庆长14年（1609年）5月，在松浦镇信的不懈努力下，荷兰商船首次进入了平户港。松浦镇信把荷兰使节带到骏府（德川家康的隐居地）奉上国书，得到了贸易许可。平户开设了荷兰商馆，雅克斯·斯佩克斯成为了第一任馆长。庆长18年（1613年），英国东印度公司的约翰·塞利斯来到平户。献上国王詹姆士一世的国书，得到德川家康的贸易许可，松浦镇信在平户的木引田町开设了英国商馆，理查德·考克斯成为了第一任馆长。
江户时代，平户藩历经12代藩主。第5代藩主松浦栋在元禄2年（1689年）分封弟弟松浦昌1万石，成立了支藩平户新田藩（植松藩）。
明治维新后，平户藩松浦家被封为伯爵。