甲氨蝶呤在临床使用已有70余年历史。起初它的适应症仅仅是作为叶酸拮抗药物治疗急性白血病，被认为安全性不好，毒性很大。
但进入20世纪80年代之后，甲氨蝶呤“华丽转身”，令人刮目相看。因为风湿免疫科医生喜欢使用甲氨蝶呤来治疗类风湿关节炎，不但价格低廉，而且疗效卓越，安全性也还好，并非人们所想象的毒性那样大。
和新的生物制剂相比，甲氨蝶呤的性价比更高。很多临床试验研究的结果也证明，甲氨蝶呤长期使用耐受性较好。当然，甲氨蝶呤具有一定的细胞毒性，如果错误使用，比如过量服用，会导致中毒，所以一定要在医生或药师指导下，按正确用法用量使用。
用法用量（具体使用一定要在专科医生指导下进行）
甲氨蝶呤用于治疗肿瘤，口服，成人每次用量5～10毫克（2～4片），每周1～2次，1个疗程总用量范围为50～100毫克（20～40片）。用于急性淋巴细胞白血病维持治疗，根据体表面积，每次15～20毫克/平方米（6～8片/平方米），每周1次。
治疗类风湿关节炎，口服、肌肉注射、关节腔内或静脉注射均有效，每周给药1次，常用剂量为每周7.5～20毫克。治疗系统性红斑狼疮，每次7.5～15毫克，每周1次，口服、皮下注射或静脉注射。有临床专家认为，甲氨蝶呤在治疗类风湿关节炎时，注射使用比口服起效速度快，疗效也优于口服。
注意事项
甲氨蝶呤在使用过程中可能会引起胃肠道反应、肝功能损害；大剂量应用时，可致高尿酸血症肾病；长期用药可引起咳嗽、气短、肺炎或肺纤维化，血液系统可有骨髓抑制等不良反应。
甲氨蝶呤使用过程中，需要注意以下几点：
对本品高度过敏的患者，全身多器官功能衰竭、恶液质或并发感染及心、肺、肝、肾功能不全者禁用，孕妇及哺乳期禁用；乙醇和其他对肝脏有损害的药物如与本品同用，可增加肝脏毒性；本品可引起血液中尿酸水平增高，痛风或高尿酸血症患者应相应增加别嘌呤醇等药剂量；本品可增强抗凝药物的药效；与氟尿嘧啶同用，或先用氟尿嘧啶后用本品，均可产生拮抗作用，如先用本品，4～6小时后再用氟尿嘧啶则可产生协同作用。