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2023年广东省出生缺陷防治人才培训项目实践技能培训课程

染色体微阵列

第二期顺利举行

出生缺陷防治能力提升

2024年3月7日至3月10日,广东省出生缺陷防治人才培训项目实践技能培训系列课程之“染色体微阵列”第二期在广东省妇幼保健院番禺院区举行。

根据国家卫生健康委办公厅印发的《出生缺陷防治能力提升计划(2023-2027年)》中对出生缺陷防治重点专业和重点疾病防治高级人才培训的要求,针对“染色体微阵列单元”,带教老师设计了总共为期7天的实践技能操作培训,至今日已顺利完成。实践课程采用理论授课、病例分享和实践练习相结合的教学模式:老师详细讲解CNV的分类、评分细则、相关数据库的使用以及CNV的报告标准等;学员分享真实案例,展示变异的评级过程并提出疑问,老师进行点评和答疑;学员在老师的指导下案例练习。经过两期实践培训课程,学员系统地掌握相关知识和实践操作。

专家授课

广东省妇幼保健院 卢建

卢建老师从CNV分类-病例水平评分、CNV分类-报告标准两个方面授课。详细介绍了对于不含ClinGen明确的剂量敏感基因/区段的CNV,快速检索文献的方法、注意事项以及筛选可用病例信息的过程;当没有足够的片段证据或证据不足以得出致病分类时,评估CNV内基因的方式;CNV内不含OMIM疾病相关基因时的证据收集流程和检索策略等。另外他结合国内外报告指南和临床经验讲述了CMA检测报告内容、报告标准和意外发现、嵌合体、ROH、外显不全、表现度差异等结果的报告建议及注意事项。最后通过典型的案例指出CNV的分析解读需要细胞遗传,分子细胞遗传及分子遗传方面专业知识的融汇结合。

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广东省妇幼保健院 黄伟伟

黄伟伟老师的授课主题是CNV分类-人群数据、病例对照数据。他详细介绍了人群基因组结构变异频率相关的gnomAD数据库和DGV 数据库,同时将DGV数据库与DGV Gold数据库进行对比说明,阐述其不同之处及特点。另外他还讲解了病例对照研究中所用的统计学方法,强调p-values结合效应量(effect size)更有统计学意义。

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广东省妇幼保健院 胡蓉

胡蓉老师介绍了CNV五分类的定义及评级的五大证据项,并对CNV五分类的典型病例逐步讲解,主要内容包括基因组含量初步评估,是否与剂量敏感基因/区域重叠、蛋白编码基因计数、文献数据库病例查找、患者遗传模式及家族史评估等方面;强调CNV评级中注意事项等细节问题,如需综合衡量病例的CNV范围、遗传模式和病例表型信息;建议先将CNV区域作为整体查询合适的病例进行评估,然后对CNV内的基因进行评估等等。讲解同时带领学员进行CNV评级现场实操。

病例探讨

学员分享本单位病例,结合指南完整展示CNV致病性评分过程,并提出判读中的疑点难点,如性染色体CNV的报告标准、基因内CNV评分、外显不全CNV评分和共分离次数计算等,指导老师逐一进行细致点评和答疑。

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深圳市南山区妇幼保健院雷洁医生病例分享

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深圳市罗湖区人民医院阚丽娟医生病例分享

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河源市妇幼保健院李登峰医生病例分享

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梅州市人民医院吴和明医生病例分享

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梅州市妇幼保健院林子慧医生病例分享

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茂名市妇幼保健院谭满胜医生病例分享

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佛山市妇幼保健院曾舒雯医生病例分享

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广东医科大学顺德妇女儿童医院吴海燕医生病例分享

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韶关市妇幼保健院周慧医生病例分享

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北京大学深圳医院葛颂医生病例分享

专家点评病例

实例操练

实例练习

CNV分类/临床意义/遗传建议

结语

本次培训18名来自广东各地医疗机构的学员面对面进行学习交流及CNV案例实操演练。各学员对本期培训活动均予以高度好评,表示在CNV评级,数据库文献使用,报告撰写等方面有了极大的提高。

2023年广东省出生缺陷防治人才培训项目实践技能培训课程之“染色体微阵列”已顺利结课,期待下一次的相遇!