在艾滋病被发现几年后，有科学家在一个非洲的患者身上发现了一种全新的毒株，它的遗传信息与欧洲和北美分离的大不相同。因此，最初的发现的病毒被命名为HIV-1，而新发现的的毒株被称为HIV-2。
HIV-2是一种不太常见的HIV病毒，高度集中在西非国家比如塞内加尔，尼日利亚，加纳和象牙海岸，在我国境内HIV-2罕见。过去，在西非地区之外报告的病例很少，但因交通和经济的发展，旅客以及移民把HIV-2带到了世界各地。
HIV-1与HIV-2有一些微妙而又独特的区别。它们相似之处有：
- 传播方式是相同的(性接触，血液传播，母婴传播)。
- HIV-1和HIV-2的治疗方法是基本相同的。均为抗逆转录病毒药物。
- CD4检测也可同样用于监测HIV-1和HIV-2疾病的进展。
而它们的不同之处则包括：
- HIV-2病毒的毒性通常较小，通常比HIV-1消耗免疫系统的速度更慢。
- 与HIV-1感染者相比，感染HIV-2的人在疾病的早期阶段的传染性较低。但HIV-2在晚期疾病中的传染性更强。特别是当CD4降至200以下的时候。
- 病毒载量测定以及核酸检测，大部分仅仅能检测HIV-1，对HIV-2并不适用。
- 某些抗逆转录病毒药物（非核苷类药物）对HIV-2感染者可能不太有效。
HIV-2的检测
初筛检测：
在中国药监局批准的HIV筛查试剂中，无论是抗体检测试剂还是抗原+抗体检测试剂，绝大多数都能同时检测HIV-1和HIV-2抗体，仅有极个别试剂只能检测HIV-1抗体、不能检测HIV-2抗体。
确证检测：
HIV诊断流程分为初筛和确证，我国最常用的确证检测方法有免疫印迹试验（WB）和条带/线性免疫试验（RIBA/LIA），目前获批准的确证检测试剂中有1种可以同时检测并区分HIV-1和HIV-2感染，其他的虽然以检测HIV-1为主，但膜条上都有1条HIV-2指示带，不用担心HIV-2漏检。另外，少数实验室在特定条件下（适用于高流行地区、高危人群）使用替代策略，根据3种HIV筛查检测试剂的检测结果检出“HIV抗体阳性”样品，只要所用试剂能覆盖HIV-2，就不会遗漏。
核酸检测：
由于核酸检测（病毒载量）有更短的窗口期，所以不少恐艾的人等不及抗体检测，就去做核酸检测。但遗憾的是，在已获国家药监局注册批准的HIV核酸检测试剂中，无论是病毒载量检测试剂还是用于诊断的核酸定性检测试剂，都只能检测HIV-1、不能检测HIV-2。如需做HIV-2核酸检测，目前只能使用实验室自建方法。HIV-2前病毒DNA、RNA和总核酸（DNA/RNA）检测结果均可用于HIV-2感染诊断，但因HIV-2感染者和艾滋病病人血浆中HIV-2 RNA检出率低、病毒载量水平也低，建议优先使用HIV-2 前病毒DNA或总核酸检测方法。需要注意的是，HIV-2核酸阴性结果不能排除HIV-2感染。
HIV-2的治疗
若发现HIV-2感染，或HIV-1+HIV-2混合感染，需立即开始治疗，治疗方案可能与HIV-1有所区别。
据报道，HIV-2对非核苷抗逆转录病毒药物耐受，这些药物包括奈韦拉平、依非韦伦，依曲韦林和利匹韦林等。它们不能用于HIV-2的治疗。
HIV-2的预防和阻断
由于暴露前预防（PrEP）和暴露后预防（PEP）所推荐使用的药物方案主要是TDF（或TAF）、恩曲他滨（或拉米夫定）、多替拉韦等，并不包含上述非核苷类药物，所以与HIV-1的PEP/PrEP没有区别，依然有良好的预防效果。
如果你的检测结果是阴性，并且已经过了窗口期的话，那么其实是HIV-1和HIV-2都是阴性，所以就没必要额外担心HIV-2的问题。
最后，由于HIV-2和HIV-1的传播途径是一样的，所以预防方法也是完全一样，不需要额外的预防措施。