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【摘要】ctDNA作为液体活检的一种生物标志物,在肿瘤早期筛查、早期诊断、治疗及复发监测等方面具有重要的应用价值。因为血浆中ctDNA含量极低,对保存和检测带来极大挑战。要实现精准检测,需要从检测的各个环节提高检测精准度和检测灵敏性,尤其是血液保存和ctDNA抽取环节。桐树基因自主研发FT14天游离核酸保存专用采血管与C95超高效循环肿瘤DNA抽提试剂盒助力肿瘤ctDNA精准检测。

一、ctDNA含量极低带来的挑战和解决方案

在你进行液体活检ctDNA检测过程中,是否遇到过如下问题?

  • 短暂的血液保存时间:血液离体后的保存时间仅1天左右,稍有不慎就会导致检测结果错误、成本损耗、让患者承受着无谓的痛苦和焦虑

  • 抗震荡能力差:采血管运输需要震荡,稍有过度震荡,会导致溶血加重,实验结果被扭曲,造成惊人的资源浪费

  • 低回收率的cfDNA抽提试剂盒:常规cfDNA抽提试剂盒的回收率仅50-80%左右,这意味着大量宝贵的cfDNA被无情地抛弃,无法满足早筛、MRD等高精度检测

  • 无法有效去除gDNA污染:常规cfDNA抽提试剂盒无法有效去除gDNA,浪费大量测序数据及其成本,假阴性率大幅提高

随着肿瘤诊断和治疗技术的不断进步,液体活检作为一种无创、高效的肿瘤检测手段被广泛应用。ctDNA(circulating tumor DNA)作为一种液态生物标志物,在肿瘤早期筛查、早期诊断、治疗及复发监测等方面都具有重要意义。然而,血浆中ctDNA含量极低,保存和检测都很困难。对保存和检测带来极大挑战。要实现精准检测的目的,需要从检测的各个环节提高检测精准度和检测灵敏性。

在检测过程中,大家往往容易忽略的环节---血液保存和ctDNA抽提。血液采集保存和运输的过程中,不可避免地会伴随核酸酶对DNA的降解以及基因组DNA的释放。这些都会大大降低ctDNA的含量和占比。另外,核酸抽提得到的ctDNA的总量和在血液总循环DNA中的占比也是影响检测精准度的重要因素!

桐树基因作为肿瘤液体活检基因科技引领者, 以其创新技术和专注精神,致力于为肿瘤患者创造价值。桐树基因曾推出“诊心安”——MRD高精度ctDNA检测技术系统化解决方案。该方案运用四大底层创新技术极大提升ctDNA检测灵敏度, 使血液与组织一致率高达80%,并发表在顶级医学杂志《Lancet Respir Med》。同时还获得火炬中心颠覆性创新技术优秀奖、肿瘤诊疗黑科技一等奖、抗癌协会三大专委会一等奖、2022年度肿瘤标志物十大创新技术/产品奖等众多奖项。

在此基础上,桐树基因又进一步在血液保存和ctDNA抽提环节进行颠覆性的创新技术研发,推出FT14天游离核酸保存专用采血管与C95超高效循环肿瘤DNA抽提试剂盒两款突破性产品,为肿瘤液态活检检测精准度提高带来突破性技术引领!

二、FT14天游离核酸保存专用采血管

桐树基因FT14天游离核酸保存专用采血管通过特殊管壁处理技术以及特殊保存液,可以使得血浆和血细胞可以在采集后立即离体分离出来,因此可以获得稳定的血浆和血细胞。

该采血管具有长期保存的优势,最长可达14天。这一创新性设计使得采血样的收集更为灵活与便捷,科研人员和医护人员可以在采样后有更多的时间进行后续实验操作。同时,采血管的长期保存能够确保样本的完整性和稳定性,从而提高基因检测的准确性和可靠性。

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图1:FT14天游离核酸保存专用采血管与进口厂家对比

(来源/桐树基因)

桐树基因FT14天游离核酸保存专用采血管同时具备的抗震功能。使用数控旋转混匀仪对不同采血管进行斡旋震荡。斡旋震荡整整7天后,桐树FT14天游离核酸保存专用采血管分离的样本血浆无溶血发生。

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图2:桐树基因FT14采血管与其他采血管对比

(来源/桐树基因)

基于进行抽提后的片段分析,桐树FT14天游离核酸保存专用采血管分离的样本50-250bp片段占比最高。这意味着,桐树FT14天游离核酸保存专用采血管能够有效保障样本游离DNA的稳定性与白细胞的完整性。

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图3:4种不同厂家采血管进行志愿者采血后提取cfDNA的质控分析

(来源/桐树基因)

三、C95超高效循环肿瘤DNA抽提试剂盒

桐树基因同步推出的C95超高效循环肿瘤DNA抽提试剂盒是另一个引人瞩目的产品。与传统试剂盒相比,该试剂盒具有独特的技术优势。cfDNA抽提回收率高达95%以上,远远大于传统试剂盒抽提回收率(约80%)。

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图4:针对40ng cfDNA模拟片段的不同抽提试剂盒回收率比较

(来源/桐树基因)

最重要的是,该试剂盒能够更多地富集到肿瘤释放到血液中的50-250bp的短片段DNA。

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图5:不同抽提试剂盒的提取率比较

(来源/桐树基因)

C95超高效循环肿瘤DNA抽提试剂盒还可以有效去除基因组DNA的污染。

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图6:不同抽取试剂盒的2100生物片段分析

(来源/桐树基因)

在后续测序环节,可以大大降低重复率,提高测序有效深度。这项技术突破有效解决了传统方法在提取片段时可能出现的局限性,大大提高了检出率。

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图7:不同抽提试剂盒抽提cfDNA的测序Dup率及平均有效深度对比

(来源/桐树基因)

四、桐树基因的创新突破助力肿瘤液体活检的研究和临床应用

桐树基因FT14天游离核酸保存专用采血管的研发在采血样的保存和运输方面提供了全新的解决方案。极大地提高了采血的便利性和稳定性。它们可以室温条件保存和运输长达14天的采血管,为样本的批量集中处理和长距离运输带来了极大的便利。

这一创新性设计解决了现有游离DNA样本保存的难题,简化了科研准备工作和临床实验室的运作。 C95超高效循环肿瘤 DNA 抽提试剂盒的研发使得ctDNA的提取效率和纯度得到了显著提高。 能够更好地富集到肿瘤释放的短片段 DNA,从而提高后续测序的效果和数据质量 。 两者双剑合璧,共同助力液体活检技术的研究和临床应用,为肿瘤患者创造价值。

桐树基 因的创新突破对于液态活检的发展具有重要意义。 在未来,桐树基因将继续致力于肿瘤液体活检技术的研发和创新。 通过不断推陈出新的产品和技术,桐树基因希望为肿瘤患者提供更精准、高效的诊断和治疗方案,为肿瘤研究和临床实践带来新的突破和进展。

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