1942年，由于会计检查出现问题，石井四郎不得不被替换。伪满医科大学细菌学教授北野正二和陆军军医北野少将继任。这位大学教授不仅继承了石井的犯罪遗产，而且还使之雪上加霜。
北野自担任招生教授以来，就因对“孙武热”——流行性出血热的研究而闻名。到了731军，我很关注技术员笠原带领的微（滤）子学习班。于是，以残酷屠杀中苏爱国志士为实验材料，开展了利用微滤器伤害人类的田野研究。
他特别关注了一种生活在西伯利亚森林中的蜱虫，这种蜱虫可以传播微过滤西伯利亚森林蜱脑炎，并命卡诺翻译和小川翻译翻译相关文献。1944年夏后，秦中尉等六人组织了翻译队，前往苏联收集医疗资料。
1944年夏天，他向牡丹江、孙乌、海拉尔、林口等分局提供了数十吨产菌材料。例如，林口分公司接收5台大型高压蒸汽灭火罐“Pepton”（胃蛋白酶分析的蛋白质，易溶于水，具有透过动物质膜的能力），用于压缩肉干、琼脂、盐等约六十吨。
分支经常保存和培养各种细菌。根据毒性试验的结果，选择强菌以防万一，多多少少都可以产生。六十吨材料可以产生五百公斤细菌。如果以树枝为基地，通过飞机在苏联远东地区、军事基地、重工业区、各大港口、航空基地、最高统帅部所在的地方传播这些优良的菊花，那么就以霍乱和伤寒菌为例举例来说，500公斤，可以使约17万平方公里的地区，也就是相当于整个东北三分之一以上的面积，遭受霍乱、伤寒等大流行的袭击。
同时，为保证日军能够在疫区行动，各支队被分配到各个部队，命名为“防疫供水部队”。例如，林口分局有五十九辆汽车（包括2号滤水车和2号消毒车），属于驻扎“东安”的关东军第五军司令部。如果第五集团军入侵苏军领导，该支队将从事防疫和供水工作。
2月初，石井四郎回到了731部队的老巢。4月初，他一上任，就批评了前北野军首长，称：“这两年自从我走后，这支军队就成了一个研究所，从现在开始，哪怕是一分钟，也不允许浪费在无用的研究和生产上，干活！”于是他拼命地将全部精力投入到鼠疫菌的生产上。
陆军参谋长办公室，在总务大臣太田太田和课长田部中佐的参与下，召集了孙武、林口、海拉尔、牡丹江的支部部长传达命令。“按照大本营的指示，八月底前，部队将生产一到两吨鼠疫跳蚤！”
按照这个计划，为了将蛋养殖的老鼠全部送到总部，除了全力抓老鼠外，还下令加强白老鼠的饲养和饲养。在总部，以田中技术中佐夫为首的老鼠饲养班和鼠疫跳蚤饲养班大幅扩充，动员全体人员攻打、喂食老鼠。
第一班的研究人员一直只对各种细菌进行基础研究，现在也被纳入以第一班星村手人为中心的营养研究班。这是关东军计划撤军至通化山，继续生产细菌武器的政策体现。
731部队及其支队不仅仅局限于抓老鼠、饲养白鼠。他们还下令关东军后方医院和物资仓库饲养白鼠。还有人试图从假冒的“兴安南省”强行购买野生龙猫来代替老鼠。比如，林口分局负责人相原少佐大肆宣传各种“鼠害”，分局全体成员“农民先锋”被动员起来搜捕。4月份送到731部队的老鼠只有1000只，5月份有1万只，6月份有8000只，7月份有7000只，总共有26000只之多。
6月份后，各分公司还开展了“投跳蚤教育”，每人给予一公斤跳蚤开始繁殖。6月初，约200名军人家属被送回日本，试图减轻军队作战负担。与此同时，部分部队和装备也撤至朝鲜江街。虽然7月份总部田中小队就收缴了数万只老鼠，但对于侵略者的犯罪阴谋来说，还是远远不够的。
石井四郎与关东军司令部第四科参谋宁忠佐、第一科参谋宫田协商，“每月收集并移交伪满洲国20万只老鼠”。7月中旬，调查科科长石光勋和班主任秦忠伟被派往沉阳、长春、哈尔滨三大城市寻找生产鼠疫跳蚤的工厂。
月底，竟然以关东军的名义，被派往司令部返回原参谋部调动。还计划通过伪满警察总部动员所有假警察，强迫他们每月从沉阳抓捕老鼠十万只，长春抓捕老鼠五万只，哈尔滨抓捕老鼠五万只，送往上述地区的生产工厂。地区想方设法生产鼠疫菌跳蚤，谎称可以制作斑疹伤寒疫苗。
回顾19世纪末至20世纪初发生在中国东北的鼠疫，从海拉尔沿中东铁路，如火如荼地蔓延到“直隶”（河北省）和山东省内，夺去了数百万人的生命。现在拟将月产量一到两吨，即2500万到5000万只以上的鼠疫跳蚤，通过空运的方式，投放到城市或密集部队等主要目标。
假设这种跳蚤直接和间接附着在人体上的可能性为10%，那么100万只跳蚤就可以让一座10万人口的城市因鼠疫而灭亡。曾经附着在人体上的跳蚤会转移到其他人身上，从而感染他人。地上老鼠身上附着的跳蚤也会引起鼠疫，然后传染给人类，并通过各种媒介传播。感染肺鼠疫的人可能会在一两天内因吐血或败血症而死亡。当时人们认为鼠疫的死亡率是80%，更何况这些细菌还是从鼠疫细菌中选出的毒性最强的细菌！
1945年8月9日，731部队还笼罩在夜色之中，天空突然被苏联红军的照明弹照亮。红军机械化部队即将抵达哈尔滨。石井四郎无奈，只能对部队进行“善后”，即消除一切犯罪证据。
首先，第一特战班长石井武夫将关在秘密监狱里的数十名爱国志士全部枪杀。一名狱中苏联妇女刚出生的婴儿也不例外。除了烧毁所有秘密文件、跳蚤、老鼠、细菌等外，工程队还奉命炸毁总部房舍——以监狱为中心，包括三层方形建筑、研究室、生产室等。工厂。
石井四郎第一时间察觉到“日本8月11日无条件投降已被确认”的外国情报，并下达了“全军撤退”的命令。近80列列车驶入队伍支线，满载两千余名队员及家属13日南逃。石井和家人乘坐女婿增田少校驾驶的飞机逃回日本。
当他们准备逃跑时，他们释放了一些带有鼠疫细菌的老鼠。以第73军为中心、距离方圆八公里的所谓“特殊区域”，鼠疫立即爆发。短短一周内，就有146名善良农民死去。