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1、东京女子医科大学附属医院 Tokyo Women's Medical University Hospital
日本东京女子医科大学附属医院是东京女子医科大学三所附属医院中最大的一所，也是日本最大的大学医院，共有床位1400余张，并且拥有日本心脏研究所等9个具有水准的研究所。东京女子医大附设医院紧邻学校，2010年平均每天接待门诊病人4207次，日平均住院病人1181人，共有医生787名，护士1176名。其下并设有肠胃、神经、糖尿病、肾脏、内分泌，呼吸照护等研究中心，而且其中肠胃及神经中心在日本非常有名气。
2、国立癌症中心 National Cancer Center Hospital
日本国立癌症中心设立于1961年，位于东京的中心地带，毗邻银座。国立癌症中心是日本的癌症对抗核心机构。癌症预防、检验研究中心和医院一体，以癌症的预防、早期发现、早期治疗为目标。1992年在千叶县柏市成立了国立癌症中心东医院，同时原来的医院改为国立癌症中心中央病院，1994年还设立了研究所分所。国立癌症中心成立以来，不仅是日本也是世界上都是屈指可数的癌症对抗中心之一。
国立癌症研究中心中央医院是日本最著名的世界的肿瘤专科医院, 直属国家卫生部领导。医院拥有国内的检验中心、的诊疗设备、的专家团队和的服务理念，综合实力和医疗品质在日本癌症检测和治疗领域首屈一指。
日本国立癌中心中央医院的特点是学科门类齐全和科学合理的分科与协作，如消化系统肿瘤分为胃肠外科、肝胆胰外科、食管外科，内科则分成消化道内科与肝胆胰内科等。临床科室在分科的基础上，与放疗、医技等科室医生分别组成37个诊断治疗小组，几乎包括了所有肿瘤的诊断与治疗。设置有VIP病房、手术室、门诊肿瘤化疗中心、肿瘤放射治疗中心、骨髓干细胞移植中心病房、体检中心、学术交流多功能厅、医疗康复设施、放射诊断科，以及高端会员门诊等部门。内科系统治疗肿瘤的科室主要有呼吸内科，消化内科，血液科。其中消化内科最强，主要治疗特色：肝癌的射频消融，胰腺癌、胆管癌支架下化疗，胃癌、肠癌的化疗等，2009年治疗各类消化系统肿瘤3800例。外科分科较细，其中乳腺内分泌外科治疗乳腺癌和甲状腺癌，胃食管外科、结直肠外科、肝胆胰外科、脑外科分别治疗相应的肿瘤及良性疾病。泌尿外科以治疗膀胱癌、肾癌、输尿管癌为主，以综合治疗为特色，包括化学药物治疗、免疫治疗和放射治疗。妇科2009年治疗宫颈癌、卵巢癌等各类妇科肿瘤580例，以腹腔镜等微创手术为特色。
日本国立癌中心东医院位于日本千叶县，开放病床425张，设内科、精神科、呼吸科、消化科、脑外科、胸外科、眼科、妇科、放射肿瘤科等科室，其肿瘤治疗特色为质子治疗，每年接受患者7000人次，其中质子治疗80人，手术患者2500人次，放射治疗1000人次。质子治疗主要用于眼部肿瘤、肺癌、肝癌等恶性肿瘤，具有对肿瘤高效能治疗作用和对周边正常组织损伤小的优点。
3、东京大学医科学研究所附属病院 Institute of Medical Science University of Tokyo
东京大学医科学研究所是日本最大并拥有附属医院的生命科学研究所，主要从事癌症、感染症以及其它疑难杂症的医疗研究。2005年4月29日，中国科学院与东京大学签署了全面合作协议（2005年到2010年）；随着中科院与东京大学新一轮合作（2010年到2015年）启动，日方为拓宽合作渠道，正积极寻求新的合作领域。
东京大学医科学研究所附属病院位于东京都港区白金台，前身为大日本私立卫生会附属研究所，成立于1892年11月。东京大学医科学研究所以“从实验室到临床”为宗旨，为救助承受传染病折磨的患者进行研究和治疗，其设立的附属病院目前拥有床位135个。
4、福岛医科大学附属医院 Fukushima Medical University Hospital
拥有一般病床位713个，精神病床位49个，结核病床位14个，感染病床位2个，日平均接待患者数632人次。2009年4月拥有医生468名，护士710名，此外还有346名技术和管理人员。
5、 旭川医科大学附属医院Asahikawa Medical College Hospital
旭川医科大学位于日本北海道中部大雪山麓旭川市，1973年建校，在医学教育、医疗服务等方面成绩突出，是世界上首先开展远程医疗的大学之一，也是世界上目前开展远程医疗最好的单位之一，运用世界领先技术在眼科等临床领域形成显著特色。
旭川医科大学自1994年开始，在日本索尼公司的技术之下，大力开展了远程医疗的建设，迄今已有十六年的历史。在吉田晃敏校长的积极推进下，该项技术得到了日本政府的大力支持，目前在北海道地区已经建立起，以旭川医科大学为中心，连接50余家地方医院的远程医疗网络，极大地解决了日本北海道地区医疗资源不均衡和偏远地区居民就医难的问题，促进了地方医疗技术的发展。同时，在日本索尼公司的支持下，日本首先将3D图像传输技术应用于远程医疗之中，目前此项技术属于国际领先水平。由于旭川医科大学和吉田晃敏校长在远程医疗方面做出的成绩，吉田晃敏校长被誉为日本远程医疗领域的“第一人”。
6、 京都大学医学部附属医院 Kyoto University Hospital
进度大学医学部附属病院下设内科、呼吸器外科、循环器科、小儿科、精神科、神经内科、外科、整形外科、形成外科、脑神经外科、心脏血管外科、产科、妇科、眼科、耳鼻咽喉科、皮肤科、泌尿器科、放射线科、麻醉科、矫正齿科、口腔外科，拥有病床位1182个（一般病床1107床，精神病床60床以及结核病床15床）。
7、九州大学附属医院 Kyushu University Hospital
九州大学是日本原 7 个帝国大学之一，目前已成为日本着名的国立大学，在日本以及世界上均占有一定的地位。学校附属医院设有1,312张病床，每日可接待病员2,400人，其中外地病员1,233人。另外牙科附属医院亦有40张病床；生医所附属医院有140张病床。
8、日本国立精神及神经中心 National Center of Neurology and Psychiatry
日本国立精神及神经中心是六家国立医学研究中心之一，拥有两个研究所（神经研究所和精神保健研究所）及一家附属医院。共有病床440张。
我院提供的新的诊断和治疗精神、神经、肌肉和发育相关疾病的治疗手段。我们也积极参与对这些疾病的许多科研项目。我们医院的使命是“向病人提供高质量的医疗服务和照顾同时尊重他们的人权”。此外，我们紧密与病人的家庭相联系，帮助病人了解这种疾病的所有影响和处理生活上不能自理的问题，使他们可以享受富有成果和高质量的生活。我们医院总是诚心接受患者及其家属。
9、圣路加国际医院 St. Luke's International Hospital
日本圣路加国际医院是基督教系的综合医院，成立于1902年，是日本医疗史上第一所现代化医院，位于东京中央区明石町，医院创立的目标是在基督精神之下、以患者为中心的医疗照护。
圣路加国际医院规模很大且规格很高，拥有不错的室内外环境、优良的设施、细致的服务。现在的圣路加国际医院进入大厅如同五星级观光饭店，新医院为追求住院病人的舒适感和尊重个人隐私，除了小儿科病房外，所有病房皆为单人房，相对收费价格不菲（房间费由10500~105000日元不等）。全院员工约1400人，其中护理人员670人，医师211人，医事人员201人。虽为财团法人医院，亦是推展公益性医院。门诊病人数约2200~2600人/天。总病床数520床，住院占床率87%，平均住院天数为10天。
圣路加高级老年保健公寓是其一大特色，为日本国内最昂贵的老年设施。其公寓内部不亚于五星级宾馆，每套公寓约67-169平米不等。由于该公寓不仅硬件，更有圣路加医院作为依托，服务无微不至，可容纳240人的公寓已接近满员，甚至有人为了使自己日后能顺利入住，已提前交付了高额的入住费用。
10、 圣隷浜松病院Seirei Hamamatsu General Hospital
成立时间1962年，目前拥有病床数量为744张，全职员工1826人（2011年4月1日）。下设35个分科室，综合性强。2010年全年平均每日住院人数为692人，平均住院天数11.7天。