据银行进账单查；根据往来款分析查，根据发票开具查、根据收据开具查，根据成本费用倒算、根据销售提成倒算等。
也可以这样查询
1.发票使用
2.银行流水
3.股东个人银行账号流水
4.公司规模、业务范围
5.往来单位往来的明细流水
税务局是如何发现偷税漏税的?
税务局发现偷漏税的手段主要有三种
国税办理流程如下:
一、纳税人首次办理涉税事宜，如发生纳税义务办理纳税申报或者领用(代开)发票时，填报《纳税人首次办税补充信息表》，进行税种(基金、费)认定.税种认定后,纳税人应当按照法律法规规定,连续按期纳税申报。
二、对于领取营业执照后30日内未到税务局办理涉税事宜的纳税人,不予进行"逾期办理税务登记"的处罚。
1.举报.比如消费者举报不开发票,还有离职的财务举报(很大比例)、竞争对手举报等等,这个大家都懂不需要多说,这个主要针对的是中小企业。
2.查上下游企业的时候连带查出问题的.比如查到虚开发票的企业,接受虚开的抵扣方就肯定有问题,无非是主观故意还是不知情的区别,不知情的要做进项转出,故意的可能要坐牢.还有就是查关联公司的时候,很可能整个集团存在筹划偷漏税的情况,那就一锅端。
3.目前税务局最常用的，系统比对。我们国税局有一个风险识别系统，会自动根据企业的各类报表(增值税、所得税、会计报表等)的信息分析疑点。打个比方，如果一个工业企业常年水电耗费很高却始终保持亏损,就是一种反常现象(因为亏损工厂一般都要减产甚至停工)，就会提醒我们税务局要去查一下。还有发票系统未来彻底完善后，每一张专用发票都要走系统,查起来就容易得多。
税务局怎么知道我的营业额？小编在上文中为大家列举了一些方法，有很多种，所以我们在经营中千万不要偷税漏税。在上面小编为大家解释了税务局发现公司偷税漏税常见的办法,一经发现就是犯罪。但是小编要告诉大家，合理避税并不是偷税漏税哦。