《东京残响》
故事设定在第二次世界大战后，日本的国家主权受制于美国。90年代中期。日本首都制药公司在大脑机能领域开发出了新药，开始推行雅典娜计划。实验以小孩作为试验对象，但药物严重的副作用导致孩子相继死亡。在这些孩子中NINE和TWELVE一起逃出了试验基地，长大后NINE和TWELVE二人以斯芬克斯的代号针对参与了雅典娜计划的政府官员进行复仇。于是他们成功地炸毁了东京都厅的部分建筑，以此向社会引起警示。
《大雪海的卡纳》
随着“雪海”地不断扩张，在大地几近消失的异世界中，人们只能在在巨树“轨道树”的根部和从顶部延伸出来的“天膜”上勉强度日。居住在“天膜”上且相信雪海覆盖的下界还有人类存活的卡娜与为了找寻传说中的“贤者”，乘着浮游虫升上“贤者之森”天膜的莉莉哈相遇，展开了改变这即将毁灭的世界的故事。
《终末的后宫》
2040年，水原怜人罹患一种无法医治的罕见疾病“细胞硬化症”，他听从医生的建议进入冷冻睡眠五年，以便届时解药开发成功而得到治疗。不料这五年间，被称为“MK病毒”的病毒席卷了全世界，导致全世界包括怜人在内只剩五个男人生存。苏醒后的水原怜人却必须肩负与大量女性交配、让人类得以延续的使命……
《学园默示录》
原本是平凡生活中的一天，整个世界发生异变，街上出现大量如同丧尸般的死体，主角小室孝所就读的藤美学园也遭到死体的袭击。为了求生小室孝集结包含青梅竹马在内的一批人，在这如同地狱般世界中，过去的各种价值观及法律已毫无意义，为了能在这现实的世界存活下去，人们的自私、黑暗、疯狂开始渐渐浮现，主角一行人必须抛弃从前所谓的理想，面对残酷的现实，并在这崩坏的世界求得一线生机……
《天国大魔境》
许多孩子们都生活在一个井井有条，四周被高墙环绕，内部绿意盎然却有着莫名神秘感的环境下，他们被灌输外界是个充满怪物像是地狱的地方。男孩时男某天接受到“你想到外面的外面去吗？”的讯息，使得他开始想象外面究竟是什么样的世界。另一方面，斩子跟真留子这一对有着雇佣关系，看起来像是姐弟的搭档，在成了废墟的日本四处寻找一个人称“天国”的地方。
《Dr.STORNE 石纪元》
当高中生大木大树向暗恋五年的对象小川杠告白时，世界上所有人被不明光线石化变成了石头。3700年后，人类文明逐渐衰退。大树重获自由，他遇见了比自己早六个月醒来的好友石神千空，千空立志用自己所学的科学知识在这个“石之世界”中重建人类文明……
《进击的巨人》
在故事开始前的一百年，巨大的类人生物“巨人”突然出现，毫无理由地消灭大半人类。残余的人类建造了三道同心圆高墙，人类怀抱着摇摇欲坠的和平居住在墙内百年之久，许多人在墙内出生长大、不曾见过巨人。这一切在某一天起了变化，一个六十米的超大型巨人突袭并破坏了西干希娜区的城门，而另一个全身覆有似铠甲构造的铠之巨人则打碎了玛丽亚之墙的城门，让一大群巨人得以进入该区。人类被迫放弃了玛丽亚之墙和罗赛之墙间的土地，撤离到内部区域，导致人口变得密集，产生动乱和饥荒……
《你的名字》
故事背景发生在适逢千年一遇彗星到访的日本，生活在日本小镇的女高中生宫水三叶对于担任镇长的父亲所举行的选举运动，还有家传神社的古老习俗感到无聊乏味，对大城市充满憧憬的她，做了个自己变成男孩子的梦，在陌生的房间，面对陌生的朋友，以及东京的街道。与此同时，生活在东京的男高中生立花泷也做了个奇怪的梦，他在一个从未去过的深山小镇中，变成了女高中生。少男少女就这样在梦中邂逅了彼此，并带着“不论你在世界何方我一定会去见你”的信念去寻找彼此。
《天气之子》
阳菜并非一个平常的女生，她有能让气温变晴空万里的工作能力。阳菜和帆高本来准备的是售卖大晴天挣钱，一开始两人确实赚到了钱，但是之后气温愈来愈糟糕，还飘起了暴雨。眼见着雨没有要停住来的意思，阳菜慢慢懂了一件事的严重后果。但只有她可以拯救这一早已破败不堪的天气情况，阳菜放弃了自身，换得了日本东京的大晴天，可帆高也为此失去自身心爱的人。于是帆高不顾一切来到彼岸救回阳菜，动静也开始雨水泛滥……
《铃芽之旅》
铃芽是一位生活在九州的一个宁静小镇上的17岁少女，某天她遇到了“正在找门”的旅行青年草太。跟随着他的脚步，铃芽来到了山上的废墟之地，她发现有一扇古老的门孤零零地伫立在那。铃芽仿佛被什么吸引了一般，将手伸向了那扇门……不久之后，日本各地的门开始一扇接一扇地打开。在不可思议的门和小猫的引导下，铃芽在九州、四国、关西，还有东京及日本列岛开始了“关门之旅”。