约克大学研究人员创建的免费在线工具可以帮助我们更好地了解细胞突变和耐药性。相关研究4月3日发表在 Nature Communications上。

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图:人乳腺癌细胞中的应力纤维和微管。

能够观察和跟踪细胞随时间变化和发育的方式是科学和医学研究的重要组成部分。

细胞的延时研究可以向我们展示细胞如何在特定环境中发生突变或它们对外部影响(例如医疗)的反应。这些信息可以阐明疾病是如何传播的,以及为什么一些患者的细胞对化疗等治疗没有反应。追踪特定细胞特征的发展是一个困难的过程,然而,约克大学生物和数学系的科学家们现在已经创建了一个免费的数字工具,可以提供帮助。

特征

这个名为CellPhe的工具因为它可以在延时研究中从细胞中提取一系列特征,并根据细胞的行为和内部结构来表征细胞。该工具包还自动删除细胞跟踪中的错误以提高数据质量。

发表在 Nature Communications(4 月 3 日)上的一项研究中,CellPhe 正确识别了两组不同的乳腺癌细胞,一组接受了化疗药物治疗,另一组未接受化疗药物治疗。比较两组,CellPhe 还能够识别处理过的细胞的潜在耐药子集。

此类数据对于了解乳腺癌和设计其治疗方法尤为重要,因为化疗耐药通常会导致乳腺癌患者复发。

CellPhe 还可以在药物筛选和疾病预后预测等过程中有进一步的实际应用。

激动人心

生物学系的 Laura Wiggins 说:“能够以如此方式的细节量化随时间变化的细胞行为是非常令人兴奋的。

“为了使 CellPhe 易于使用并适应新的应用程序,我们付出了很多努力,因此我们期待看到社区将如何使用我们的工具包。

我们预见 CellPhe 在我们理解细胞药物反应以及细胞通过信号和直接接触相互交流的方式方面发挥着关键作用。”

CellPhe 可在线免费获取,可在任何操作系统上运行,并附带手册和说明视频。

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