免疫微环境的异质性是肿瘤耐药、复发和预后差的重要原因之一。近年来,免疫检查点治疗及相关联合治疗方案给晚期肿瘤患者带来希望,系统探究肿瘤免疫微环境的异质性对于治疗选择、疗效预测、方案优化及开发新的免疫治疗靶点等有重要指导作用。

前段时间,国内团队联合在 Nature 发表研究,利用 10x Genomics 单细胞和空间多组学技术,首次在单细胞精度定义了肝癌的五种免疫微环境亚型,并首次全面揭示肿瘤相关中性粒细胞的异质性[1]。

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图 1.文献截图

在本研究中,研究人员综合利用单细胞转录组测序、空间转录组测序、外显子测序、染色质开放空间测序、小鼠肿瘤模型和大量实验验证,系统探究了肝癌多种亚型在单细胞层面的异质性,首次在单细胞精度定义了肝癌的五种免疫微环境亚型(TIMELASER),探究了其细胞组成、趋化因子受体-配体网络、细胞空间分布和特异基因组特征,发现并分别验证 CCL4+、PD-L1+ TAN 两个关键亚群的促肿瘤机制,最终通过构建小鼠肝癌模型和实验分析证明靶向肿瘤相关中性粒细胞有望形成新的免疫治疗方案。

近年来,单细胞与空间多组学结合的免疫学(尤其肿瘤方向)研究文章频发,通过单细胞与空间多组学研究结合分析新机制,而后进行实验验证的研究思路,逐渐成为主流。

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亮点提炼:

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2. 肝癌免疫微环境和中性粒细胞异质性

Nature 一作亲自解读高分文章背后的研究故事。从研究思路到技术实操,全面拆解如何综合利用单细胞转录组测序、空间转录组测序、外显子测序等技术高效开展科研分享;如何探究肝癌多种亚型在单细胞层面的异质性与促肿瘤机制。

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讲师介绍

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赵琳琳

多年从事生命科学及转化医学领域相关工作,在单细胞多组学、空间多组学、原位技术及新一代测序行业有着丰富的经验。2018 年 9 月加入 10x Genomics,现任中国区资深市场经理,负责中国区市场战略制定,产品及技术推广,市场运营,合作伙伴开发等。2015~2018 年曾任 Illumina 大中华区资深产品市场经理,负责产品涉及 NovaSeq,桌面型测序仪以及单细胞解决方案。2009~2015 年先后在基因有限公司市场部及大型仪器部任高级产品经理,在大型仪器部期间作为 PacBio 第三代测序仪和 Affymetrix 细胞遗传学相关产品的全国市场部负责人。

薛瑞栋

北京大学医学部/北京大学第一医院助理教授,致力于结合多组学/单细胞测序与功能研究来探索肿瘤的起源演化及微环境调控机制。以第一/通讯作者(含共同)发表论文 12 篇,包括 Nature、Cancer Cell、Gastroenterology(2022,2016)等,入选「细胞出版社 2019 中国年度论文」和「2022 年度中国生物信息学十大进展」,主持项国家自然科学基金青年及面上项目,担任国家重点研发计划课题骨干。即将于北京大学-云南白药国际医学研究中心开展独立研究,欢迎对肿瘤研究有兴趣和热情的人才加入本课题组。

内容策划:潘成
内容审核:朱超敏

题图来源:图虫创意