义和团首领朱红灯见大批官军前来镇压，率领几百拳民离开平原杠子李庄，往恩县方向转移。路上不断有人加入进来，人数迅速增加到两千多。1899年10月17日晚，这支浩浩荡荡的队伍走到平原县城西的森罗殿停了下来。
森罗殿是一座气势雄伟的古刹，工艺精良，布局得当，坐北面南，前有一座青砖蓝瓦的药王庙。高枕于马颊河东岸，四周林木茂盛，地势居高临下，易守难攻，在庙上可清楚俯视平原县城墙，有一条连接平原和恩县县城的东西要道经过此村，战略地位十分重要。
大门为半圆拱形，横墙挑角，朱漆大门，布钉吊环，楣洞之上是雕砖花砌的横镶池匾，内嵌“森罗殿”三个遒劲大字。进穿心殿门，两旁空间内各塑一匹栩栩如生的骏马，鞍韂齐备，傍有武士，宛如活人。
前院内有古松1株，高10数丈，葳蕤苍郁。前殿5间，园柱廊厦，高脊建瓴，翘檐飞角，上有五驹六兽，古风凌健。正殿门额上有朱绛漆木匾一幅，书“森罗宝殿”四个鎏金大字。殿宇之内，正壁前迎门是一尊伟岸肃坐的“五帝阎君”塑像，殿顶之下，坡悬着一幅金字横匾，刻有“森罗大帝”四字，落书为“睿亲王”。
塑像神态逼真，貌悦神严。长条供桌上，有三腿鼎式大铁香炉。下面有“牛头马面”各种塑像，场面宏大，层次错落、形态骇人。墙上绘满各种宣扬“因果报应”的壁画。
后大殿也是5间，建筑样式与前大殿相似。殿堂内供奉的是佛像。前后殿外有东西廊房，俱是格窗朱户，漆光耀目，廊内壁画，大多是宣扬“二十四轮回”等劝人向善的迷信说教。
前殿西南隅有一钟亭，有千斤古铁钟一口悬在亭内。后殿后有僧舍、仓库、敞棚、菜园、水井、磨房等，西墙有通外的小门。历代都有僧人居住，也有道士间居。殿前大门外，有一条东西大壑叫“牛头沟”，直通马颊河内。森罗殿西连龙王庙大街，北顺大堤，东南皆是深达七、八米的沟壑，与村庄分离。
1899年10月17日晚，义和团2000多人齐聚森罗殿。殿内外刀枪林立，旌旗猎猎。四乡百姓自带干粮赶来助阵。拳民在殿内及附近村庄宿营。准备稍作休整，攻打恩县城西的刘王庄和庞庄教堂。
卢昌诒等人刚回到县城不久，庞庄就派人来告急，说拳民要进攻庄内的教堂。卢昌诒忙派朱景荣带马队一哨前往支援。须臾，恩县又来告急，又派马队三十人前往增援。卢昌诒不想让拳民找到生事的借口，命令把之前捕获的六个拳民释放了。后经仔细调查，查明此案是因蠹役陈德和滋讧讹赃而起，立即将其锁铐收禁起来。
半夜时分，派去侦查敌情、劝说拳民解散的马探失魂落魄地跑回来报告，说自己被拳民抓住了，朱红灯对他说道：“我之所以离开杠子李庄，是为了给卢大人和袁大人留面子，并不是我们惧怕官军。请好自为之，不要再来相逼，否则两下动起手来自失颜面，可不要怪我。”卢昌诒闻言，心中甚为忧闷。
10月18日早晨，卢昌诒将义和团的情况电告毓贤。不一会儿，恩县派人飞马前来告急，说拳匪声势浩大，县内的教堂岌岌可危，请求将省城的军队全部开过去加以保护。卢昌诒闻言大惊，忙和袁世敦商量对策。
卢昌诒一脸愁容道：“拳匪闹得越来越厉害了，这可如何是好？”
袁世敦说：“大人不必忧心。昨日我等前去，没有碰到拳匪，今日不妨再去，拳匪见大军到来，必当惧而解散，就算不解散，相去二三里也应该不会把我们怎么样。否则拳匪猖狂肆虐，各处告急，防不胜防，驻守在县城里，也不是个办法。”
卢昌诒点头称是。让袁世敦率兵去扼守咽喉要地。派南庄庄长施砚田、商永和先去森罗殿跟拳民讲和。
亲兵马队只有二十人，袁世敦就率亲兵马队与亲兵步队一营前去。
过了一会儿，卢昌诒和蒋楷也出发了。走出七八里地，突然听见一阵枪声。随即看见一个受伤的士兵踉踉跄跄地跑来说道：“报告大人，我军和拳匪打起来了。”
卢昌诒吃了一惊，忙问：“为什么这么快就打起来了？”
士兵说：“我也不知道，事出突然，我防备不及，所以才受了伤。”
众人心怀畏怯，欲进不进。袁世敦派人再三前来催促，只好前行至小马庄。小马庄离前线只有半里路，离森罗殿有三四里。
因为村首禁止习拳，大芝坊村没有拳民，拳民被阻挡在村外。很多人肚子饿了，只好过河到恩县张庄集市上去吃早饭。南庄庄长施砚田与商永和试图前去说服拳民解散，但是没有结果。随后袁世敦率领20名骑兵和一队400多人的步兵分三路向森罗殿包抄过来，企图剿灭义和团。
刚靠近森罗殿，突然听见一阵炮声，一个年轻拳民骑马送来一张黄纸，上面用红字写着稀奇古怪的文字，宛如符箓一般。官兵问是什么，拳民说这是战书，又骑马离去了。正在惊愕间，拳民已以两三倍的数量猛然扑来，狂驱颠突，就像中了邪一样。
袁世敦大惊，连忙指挥士兵向其开火。拳民有大刀、长矛、少量原始猎枪和两门老式土炮，他们怀着刀枪不入的信念奋勇冲杀。官军只带着单发步枪，射击后来不及装弹，在拳民猛烈的攻击下，有3名士兵被当场砍死，十余人受伤，后哨的门旗都被拳民夺去了。
一个哨官吓得想要逃跑，袁世敦拔刀出鞘厉声大喝道：“你敢逃，就先把你斩了！”命士兵摆出五圆阵与拳民相持，催促县中马步队速来增援。拳民攻势猛烈，官军招架不住，袁世敦骑马跑到小马庄，仰天悲叹道：“今天不活了！抓一个土匪都受辱至此，还有什么面目见人？”
众兵闻言大为感奋。有个道士抄小路想来袭击他，被士兵当场斩杀。袁世敦趁势挥军猛进，再次向森罗殿发起进攻。拳民奋力抵抗，头目各执两面红旗，旋绕胸前，有的被击中数枪才倒地而死。
这时庞庄和恩县的马队闻警赶来支援，两面夹攻，官兵排枪齐发，拳民纵有刀枪不入的神术，也抵挡不住官兵的真枪实弹，经过约五小时的激战，义和团遭受重创，阵亡二十七人（包括三个头目，其中两个是朱红灯的弟弟和恩县拳首孙治泰）。
朱红灯率余部渡过马颊河往西南逃去。马队穷追不舍，直到将其彻底驱散才罢。缴获大旗一面、大炮二尊、抬枪十馀杆、刀矛各以百计。
此次战斗中，附近四个平民被误伤毙命。殿旁有两家客店，官兵指控其窝藏拳匪，强行闯入搜查，当时人多手杂，店内物件有所丢失。勇兵在将拳民击散后又捕获了十六人。经卢昌诒审问，都是良民，将其释放了。
拳民逃散后，官军在大芝坊村外鸣枪放炮，准备进入村中搜查余匪。村民担心官兵骚扰，派十几位老者走出村寨，希望面见袁世敦，声明他们没有卷入这场战斗，恳请官军收兵。
不料官军误认为他们是义和拳，朝其开枪射击，当场打伤数人，秀才裴秀亭的父亲因伤势过重当场身亡。官兵进村搜查拳民时又抢了一些东西。
森罗殿之战后，拳民力量分散，多数人回了家。朱红灯带领一批骨干成员逃到禹城丁家寺，与心诚和尚、于清水和其他拳首一起商讨下一步行动。团民暂时停止了活动，除长清发生了两起小敲诈外，该地整整两个星期都没出事。
不久，朝廷发来上谕：“著毓贤选派妥员秉公查办，务即从速迅结，毋任酿成事端。”毓贤随即委派卢昌诒彻查此案。
卢昌诒于10月23日向毓贤禀告：“卑府在途中即访，闻平原县二快总役陈德和，有讹诈拳民、以致酿祸情事”，“查陈德和久充快总，非平日鱼肉乡民，何至为众人侧目？李长水等闹教，既以该役得财籍口，其酿成事变，实为此案罪魁，且难保无因事诈赃别案。”
毓贤也认可此判断，批示道：“查平原县二快总陈德和，籍案讹诈，妄拿无辜，以致百姓众怒，土匪乘乱，酿成事端，实堪发指。应即提省严办，以儆不法。至该县蒋令，始而纵役诈赃，舆情不恰；继而张皇失措，民变几成，忽禀地方安静，忽报乱级围城。其往日之昏聩，办事之荒谬，竟至如此。”
毓贤
随后上奏朝廷：“奴才再三查访，该署县蒋锴前在莒州本任时，人本昏庸，办事不能持平，几酿大祸；经前抚臣张汝梅调署平原，不知改悔，仍然谬妄，始而纵役诈赃，继则张皇失措。似此昏聩糊涂，若不据实严参，无以整肃吏治。相应请旨将调署平原县事莒州知州蒋锴即行革职，永不叙用，以免投效开复再误民生。
“至管带亲军营袁世敦心地直爽，勇于任事，不无可取，惟此次弹压查办实属猛浪。至搜查匪党未能约束勇丁，以致客店失物，误伤良民，虽非无心，究属异常草率。应即撤去统带，由奴才另行择人接统，以肃戎行而服民心。可否将袁世敦发交袁世凯随营历练，以观后效，抑应如何示儆之处，出自圣裁。”并强调：“东省民风素强，民俗尤厚，际此时艰日亟，当以固结民心为要图。”
朝中不少官员都附和毓贤的主张，御史黄桂均在奏折中说：“自德人占据胶澳，教焰益张，宵小恃为护符，藉端扰害乡里。民间不堪其苦，以致衅端屡起。地方官不论曲直，一味庇教而抑民。遂令控诉无门，保全无术，不得已自为团结，借以悍卫身家”，“盖刀会、拳会与团练相表里，犯法则为匪，安分则为民”。建议朝廷对义和团“善为安抚”，以“收干城之用”。
父亲无故被官军打死，裴秀亭悲愤异常，毅然上告。此事引起轩然大波。御史王绰上折弹劾袁世敦，称其“不察虚实即纵兵开枪，并有掳掠情事”，建议朝廷将其罢免。
后军机处寄给毓贤的上谕除支持将蒋楷撤职外，并称：“营官袁世敦，行为孟浪，纵勇扰民，著一并革职。该抚谨请将袁世敦发交袁世凯军营历练，显系意存袒护，岂封疆大吏所宜出于此？毓贤著传旨申斥。”
平原事件处理完毕后，清廷采纳了毓贤的建议，倾向于招抚义和团，使义和团在森罗殿之战后发展得更加迅速。但由于缺乏一定的军事编制，不能组织起一支有效的作战队伍，都是随打随集，打完即散，加上后来泥沙俱下、鱼龙混杂的情况比较严重，内部也出现了一些矛盾和分化。
朱红灯在和心诚和尚、于清水等首领商议后，认为“事已闹大，诚恐官兵兜拿，不如分党四出，抢得赀财，以图再举”。
11月4日，朱红灯、心诚和尚等率领义和团前往禹城苗家林庄“闹教”，袭击了四户教民，烧毁房屋四间，杀死看门人一个。而后兵分两路，一路以朱红灯为首南下长清；一路由心诚和尚率领奔赴茌平北部和博平一带。
11月8日，朱红灯率领义和团从禹城苗家林转战长清，袭击了长清县李家庄李公堂家，抢夺银钱、衣物、车辆、牲畜，绑架李公堂之父李凤来，得赎金二十千文，将李公堂房屋烧毁。
11月9日早晨，义和团抢劫长清县郑家营教民郑继先家，牵去牛马，放火烧毁房屋三间。晚上，转回茌平南部张官屯，在教民徐清华家放火、抢劫；将平日欺压乡里的教堂教徒王观杰从教堂中架出杀死，悬首树上，抛弃尸身。
11月11日，义和团在博平抢劫，将教民朱明经绑架，烧毁其房屋；向周克存家勒索五十两银子；抢劫教民赵文灿家车辆粮食，放火烧毁房屋四间；绑架赵文灿，勒索马儿一匹。
11月12日，朱红灯与心诚和尚的队伍集结于马家窝。
在博平抢劫完以后，朱红灯等人听到这样的传言：假如义和团愿意自动解散，不再闹事，官府将对他们法外施恩，对以往的罪行不予追究。他们前思后想，认为暂时歇手、就地分钱是最好的选择。于是把抢来的东西简单分了一下后就各自散去了。
不料，有二十多个拳民在分散时路过茌平张庄教堂，又引发了新的冲突。