黄菊同志1938年出生于上海，祖籍在浙江省嘉善县，童年至中学时期在浙江老家度过，1956年从嘉善一中考入清华大学，1963年毕业后回到上海在一家机器厂工作。黄菊同志他踏实工作，刻苦钻研，积极参与技术改造和技术革新，成功研制出了我国第一台可控硅电炉自动配电装置，减轻了劳动强度，缩短了熔炼时间，提高了钢水质量。他还从理论上总结了小容量电炉变压器大电流超功率运行的经验，并编写了《小电炉变压器超功率运行》一书，这方面的技术革新成果得到普遍推广和采用。得到了同事和领导的高度肯定。
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1983年3月，黄菊同志开始领导上海市的工业工作，他思想敏锐，思路开阔，考虑问题周到全面，表现出较强的组织领导能力。他从上海工业战线的实际出发，扎实细致地开展工作，积极稳妥地推进所属局、公司领导班子的调整和委办机关的内部建设，迅速打开了工作局面。
1994年9月至2002年10月，黄菊同志任中共上海市委书记，他推动上海市改革开放进一步扩大，国民经济和各项社会事业快速发展，城市面貌发生了显著变化。2003年3月黄菊同志被任命为国务院副总理，负责国务院常务工作，协助负责金融方面的工作，负责工业、交通和企业改革方面工作。
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2007年6月2日2时03分，黄菊同志，因病医治无效，在北京逝世，享年69岁。黄菊同志去世后骨灰一直存放在八宝山革命公墓。
2015年11月29日，黄菊同志去世8年后骨灰运回上海，迁往上海青浦福寿园公墓安葬，黄菊同志出生在上海，又在上海工作了40多年，对上海这座城市和上海人民有着深厚的感情。圆了自己和亲人们的梦，魂归故里，入土为安。