日本现行的学制是“六三三制”，即小学6年，初中3年，高中3年。与中国的9年义务教育不同，日本是小学到高中为12年义务教育。留学生可报读的高等教育机构主要有：学（本科）、大学院、专门学校语言学校、短期大学、别科等。
大学（本科）
日本本科（学部）的修业年限为四年，但医科，牙科以及兽医学的大学修业年限为六年。
四年制学部课程相当于中国的大学本科。
大学院（硕士、博士）
日本大学的“大学院”，在中国称为研究生院，相对应的为“修士”中国称为硕士。研究生院设有硕士课程和博士课程。硕士课程学制为两年，博士课程学制为三年。有的学校将博士课程分为前期两年和后期三年，前期的两年亦可看做硕士课程，也有单独设置后期三年博士课程的情况。
日本语言学校
语言学校，开学是一年有4次，分别是1月、4月、7月、10月。日本大学开学一般是每年的4月，所以在日本读语言学校的时间主要看自己的入学时间和升学时间，语言学校一般最长可以读两年。
日本专门学校学制
设有专门课程的学校称为专门学校(分为专门学校和高等专门学校)，属于高等教育机构之一，通常学制两年，是以传授职业教育和学习实际生活所必需的知识、技术、学习技能和提高教养为目的的教育机构，包括医疗、工业、文化、教养、商业实务、卫生、教育、服饰、家政等领域的学校，有意从事以下职业者，可以经此取得必要的资格，如室内设计师、建筑师、系统工程师、汽车修整师等。
日本短期大学学制
短期大学其修业年限为两年或三年，在日本的短期大学在中国的教育制度中一般被认定为大专。
别科
大学别科都是私立大学下属的较多，是和语言学校一样培养日语的地方。但是在很多方面，它却有看似优于语言学校。比如，别科全部是留学签证。享受留学生享受的一切优惠和待遇。并且由于别科是隶属于某个大学的，因此别科的学生还享有所隶属大学里的一切优惠和待遇。包括大学内的一切设施与特殊权益等等。别科一般是每年4月和10月开学，最长学习时间也是2年。