提起日本忍者，想必大家都不陌生。根据日本史料记载，忍者起源于镰仓时代，并在室町时代与战国时代大显身手。战国大名们为了获取有利情报，或秘密暗杀对手，都会聘用忍者来完成这些见不得光的工作。
诸如织田信长、德川家康、丰臣秀吉都与忍者保持着密切的合作。
1582年6月21日，随着反骨仔明智光秀一声“敌人在本能寺”的召唤，“第六天魔王”织田信长殒命京都本能寺中，信长的野望就此破灭。
德川家康当时身在离本能寺不远的大阪，当天就得知了信长的死讯，他意识到天下将很快陷入激烈的动荡之中，立即召唤三十四名武将与家臣保护自己赶回大本营三河国冈崎城（今爱知县冈崎市）。
为了家康的人身安全，麾下武将服部正成（家康十六神将之一，另一个名字叫做服部半藏）聘用三百余名“伊贺”与“甲贺”忍者，保护着家康穿越伊贺国山区，顺利抵达伊势国港口，而后保护着家康搭船平安回到冈崎城。
这段惊险的逃亡过程日后被改编为各类作品，日本史料称这段历史为“神君伊贺穿越”。
在后世衍生的作品中，服部正成被描述为忍术高超的忍者首领，掌控伊贺国所有忍者。事实上他并非忍者首领，只是聘用过忍者帮助家康作战，顶多算是跟忍者相熟的武将，并非什么忍者首领。
也正是因为这次与忍者之间的关系，服部正成开始与伊贺忍者、甲贺忍者密切接触。
1590年8月，家康奉“猴子”丰臣秀吉之命进驻江户城，服部正成再次聘用伊贺忍者和甲贺忍者入住江户城，保护家康安全的同时，兼任城内的警备工作，另外刺探情报，观察秀吉动向的工作也全部交由忍者完成。
伊贺派与甲贺派本以为背靠大树好乘凉，可以借助家康的势力壮大自己的势力，谁知在家康夺得天下后，却根本不去重用他们。
随着日本战国结束，进入太平年月，忍者们随之失去了功用，在德川幕府（江户幕府）的打压之下，忍者渐渐地从历史舞台上退场了。失去了工作的忍者们如同被溥仪从紫禁城赶走的太监一样，为了生存必须放下身段从事各类工作。
一些忍者成了富人的保镖，一些则成了浪人，一些做起了小生意，一些则隐居深山独自修行，甚至有些还干起了打扫卫生倒垃圾的工作，真应了那句“为了混口饭，啥活俺都干”。
江户幕府第八代将军德川吉宗在纪州藩担任藩主之时，手下有一个小型组织，名叫“药込役”。其成员全部为忍者的后代，他们名义上为藩主制造“铁炮”（火绳枪）所用的火药，实则还兼任暗杀和刺探情报的工作。
这些人在德川吉宗继任将军之后受到重用，吉宗从纪州藩出发去江户城，身边带着十六名“药込役”成员保护他的安全，并效法他的祖辈德川家康，将这十六人也称为“十六神将”。
坐稳将军之位后，他将十六人分开，七人组成“御休息御庭缔户番”，九人组成“伊贺御庭番”，这十六人与另外一个吉宗的心腹由此成为历代德川将军直属的隐秘部队——“御庭番”的始祖。
“御庭番”这个名字听上去很高大上，所担负的职责却只是负责将军府的卫生，每天扫院子倒垃圾，忙得不亦乐乎。这就好比大清雍正年间的“粘杆处”，外界认为是大内特务组织，其中不乏训练有素、杀人于无形的“血滴子”。
实则“粘杆处”只是一个小小的太监组织，主要任务是用长竹竿子挂上面糊粘走树上烦人的知了。
雍正的“粘杆处”只杀知了不杀人，但德川吉宗的“御庭番”却真的会杀人。打扫庭院只是表面工作，其目的是掩饰身份，真实身份是大内密探，负责为将军干掉死对头或看不顺眼的人，兼带情报收集与监视诸藩的工作。
确切来说，“御庭番”更像是出现自大明洪武年间的“锦衣卫”，而非大清雍正年间的“粘杆处”。
直到德川幕府末期，“御庭番”仍旧存在，并不断为主人执行各类任务，与当时非常有名的“新选组”保持密切关系，在日本近代史上著名的戊辰战争中，与“新选组”并肩作战，对抗明治天皇的新政府军。
战争失败后，幸存的“御庭番”逃亡北海道，组织新的力量伺机报复，但最终没能成事。时至今日，一些自称忍者后代的日本人，仍以先辈的“御庭番”身份感到自豪。
有着“日本最后的忍者”之称的川上仁一自称甲贺流忍术伴家忍第21代宗家，他利用大学教授的身份经常给学生讲祖辈们的历史，这使得他引以为豪。不过他并不打算将忍术传给下一代，究其原因，是根本不存在什么忍术。
所谓忍术，根本不能上天入地，也不能变成青蛙，更没有水上漂、烟雾遁地、瞬间消失的绝招。忍者必备之物是“石灰粉”，危急关头抓出一把丢在对方的脸上，趁着对方睁不开眼的当口，一刀将对方刺死或趁机逃之夭夭。
一切关于忍者神乎其神的技艺，都是影视剧和动漫类作品夸大，事实上在没有工作的时候，忍者除去暗杀之外的只是清洁员和勤杂工，这才是真正的忍者。
近代有人认为日本的忍术与中国的汉代五行术有起源关系，比如忍术权威著作《万川集海》中就说，忍术思想的根源来自中国殷周之际的姜太公吕望。是他首先提出了忍术概念，并写在了传世名著《六韬》之中。
后来，孙武、张良、韩信等相继对忍术理论进行了完善。特别是孙子的《孙子兵法》倍受忍者阶级推崇。于是乎，忍术的诞生也涵盖权谋，阴阳，技巧这几个主要宗旨。
但结合历史，忍者的出身并不光彩，当时日本战争激烈，信武士道的那群人不干这种窃取情报的事情，毕竟吃苦受累需要下等人去做，于是忍者应用而生，而且就在这样的环境中，刮起了一片的风林火山！