众神之父奥丁很生气，因为雷神天天在地球上，跟复仇者们在一起。他认为地球人生性懦弱，不堪大用，而自己的儿子天天跟他们在一起，早晚有一天会变成懦夫。
这天，他特意为儿子举办了雷神节，准备在宴会上，劝阻儿子不要再去地球。没想到儿子却告诉父亲，你没跟他们接触过，根本不知道他们身上可贵的精神。
就在父子二人争辩的时候，海姆达尔告诉雷神一个消息，说地球上突然发生了一件怪事。但是，具体的，他也没看清楚，雷神听了之后赶紧飞了回去，留下了失望的奥丁。
当雷神回到复仇者基地的时候，他发现基地和以前不一样了，外面矗立着毁灭博士的雕像，复仇者的标志也没有了。
正当他愣神的时候，一些机器人攻击了他，雷神还没弄明白是怎么回事。鹰眼，猎鹰，蜘蛛侠来帮忙了，雷神终于缓过了神来，他用闪电将所有的机器人都消灭了。
鹰眼众人带着雷神坐船跑了，在船上，鹰眼告诉雷神，我们是守卫者。毁灭博士一直很怕你，他认为你早晚都会来的，雷神问鹰眼不认识自己了？
鹰眼说自己从来没见过雷神，雷神被眼前的一切弄蒙了，他是穿越了吗？明明自己才走了两三天，为什么复仇者们不见了。鹰眼，猎鹰，蜘蛛侠都换了昵称，还不认识自己了？
他们正在聊天，毁灭博士的手下又来追击了，带头的是黑寡妇，雷神看到她之后很高兴。不过，黑寡妇却没有手下留情，因为她是毁灭博士的未婚妻，她让手下攻击雷神，而且还用高科技将雷神的锤子给封印在真空当中。
雷神失去了武器，守卫者们只好带着雷神赶紧逃走，他们回到了自己的基地，蜘蛛侠怀疑雷神的能力，他不断地刺激雷神。
正当大家吵架的时候，毁灭博士亲自上阵了，他来到守卫者的基地，三下五除二就制服了所有的守卫者，包括雷神。
雷神被带到毁灭博士的基地，他远远地看到被困在冰里的美队，毁灭博士让雷神放弃自己的锤子。但是雷神哪里会这样做？正在这个时候，钢铁侠通过视频告诉毁灭博士，千万不要打死雷神，自己还需要他，原来钢铁侠也成了毁灭博士的手下。
毁灭博士将雷神带到实验室中，雷神不但遇到了钢铁侠，还看到了班纳博士，他不明白钢铁侠和班纳博士为什么会成为毁灭博士的跟班？
钢铁侠告诉他，自己差点被炸弹伤害的时候，是毁灭博士突然出现救了他一命。所以，他要帮毁灭博士。而班纳的命运也是一样，当初实验出了问题，眼看自己就要暴露在伽玛射线之下，也是毁灭博士救了自己。
听到这里，雷神终于明白了，毁灭博士肯定是穿越到过去，他改变了历史，毁灭博士才不管他到底知不知道事情的真相，他要雷神之锤，然后统一全宇宙。雷神当然不肯，毁灭博士看到他宁死不从，就成全了他，让他跟所有的守卫者一起接受最后的审判。
要说最后的审判也挺壮观的，黑寡妇是宣判者，惩罚者是执行者。但是，事情没有毁灭博士想得那么顺利，就在雷神开始质疑人生的时候，黑寡妇突然让罚叔解决掉毁灭博士的手下，她叛变了！
雷神和守卫者们被救了下来，罚叔，黑寡妇，守卫者们一起开始对付毁灭博士，钢铁侠和班纳博士也参加了战斗。不过他们都是技术性人员，也只能对毁灭博士嘴炮一番而已。
毁灭博士知道自己肯定会失败，于是就想重新进入时光机器，好在雷神和班纳博士发现了，他们阻止了毁灭博士。雷神则是进入了时间机器，他想起海姆达尔告诉他地球出问题的时间，然后回到了过去，他要去改变所有的一切。
穿越回去的雷神悄悄地潜入毁灭博士的实验室中，在毁灭博士刚启动机器的时候，他在暗处用雷电将机器给毁灭了。不知情的毁灭博士还以为是自己的问题，他愤怒地将所有的零件都砸个粉碎。
看来，他再也不会做类似的实验了，一场风暴就这样无声无息地解决了。