近日，沪通一体化多层次轨道交通方案研究出炉，未来，上海-南通之间将会有至少三条轨道交通连接。
西线：走海太隧道与上海嘉闵线连接，进而连接上海虹桥、上海北站、上海站；
中线：规划南通S5线走崇海通道横跨崇明，再由沪崇线连接上海北站；
东线：启东连接崇明线（陈家镇），启东-金吉路控制在1小时到达。
除了以上三条轨交，南通-上海将来通过北沿江高铁将实现30分钟通达，南通新机场-浦东机场-虹桥机场通达时间控制在45-60分钟。
方案同时还梳理了即将新建或规划的沪通主要过江通道：
1、江心沙通道（海太通道）
2、崇海通道（沪崇通道）
3、北沿江高铁通道
4、崇启东通道（补充规划）
沪通多层次轨道交通主要分为四个层次，分别承担不同的任务、发挥不同的作用：
（1）国铁干线/高铁： 解决南通-上海中心城或主枢纽之间半小时通达；如目前拟建的北沿江高铁等；
（2）城际线： 解决南通-上海之间45分钟-1小时通达，并串联沿途重点城镇、组团；
（3）市域线： 南通、上海分别规划有市域网，市域网之间应进行全面衔接，串联南通上海以及沿途主要客流集散点，全程运行时间60~70分钟；
（4）市区轨道线： 两市分别规划有市区轨道网，主要解决城市内部交通及串联城市交通枢纽。
方案小结：
（1）通过三套方案的综合分析，各方案各有特点，也串联了沿线不同重点地区或枢纽，均匀分布在南通-上海85km交界面上， 不是三选一，而是并列的三条衔接通道，都有条件也有必要进行全面衔接；
（2）根据上海轨道项目进展、南通-上海的需求、沿线的规划发展等情况，可以分初近期、远期适时分别启动建设。
（3）当前(初期)最紧迫的尽快推进北沿江高铁的设计建设，实现南通上海主要枢纽30min左右通达；
（4）目前崇明线(东通道)已国家立项，上海计划年底或明年初开工建设，建议南通可以开展崇明线北延或南通S5市域线南延衔接崇明线的规划和预可行性研究，以便崇明线标准的合理制定和做好相关预留；
（5）西通道方案可以结合沪苏二通道(海太通道)规划建设，研究西通道的规划及预可行性研究；
（6）三条通道中中通道是南通毗邻上海北大门最近、市域线网衔接最紧密且直接串联沪苏跨江融合试验区的通道。
但对于上海而言，沪崇线仅为远期规划。且该通道上海范围线路长(达66km)、崇明岛上线路走行长，特别是在崇明岛中西部已计划建设北沿江高铁、东部计划建设崇明线的前提下，该通道目前启动设计建设需要做好做足通、沪融合发展的大文章，省、市决策层面进一步加大协调力度。
（7）积极推进中通道(沪崇线)衔接崇明、海门、新机场的规划研究(通道预留)。建议目前可以开展前期方案研究工作，为衔接、协调、融合发展奠定扎实基础。 初近期可以利用北沿江高铁的富余能力开行部分城际/市域列车，根据北沿江高铁建设后的城市发展和客流需求情况适时启动建设中通道方案。