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如何去理解病毒?

为什么打疫苗是目前最有意义的事?

为什么说这个时代属于生命科学?

为什么从生命科学角度看,人类要学会谦卑?

意识上的焦虑,真的会改变我们的基因吗?

基因检测是什么,基因编辑技术又是什么?

科普作家、华大集团CEO尹烨,

是“新冠”和“非典”科研攻关的参与者。

他在今年3月的新书《生命密码3》中,

梳理了12种改变人类历史的微生物,

从基因的角度,回答了上述问题。

尹烨

尹烨曾在《自然》等国际学术期刊发表60余篇论文,

自2020年新冠疫情暴发,

一直奔波于抗疫的第一线,

一条连线了目前在深圳参与抗疫、

统筹建设全球火眼实验室的尹烨,

请他做一次科普。

撰文 | 陈薇沁

责编 | 陈子文

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2003年,非典型肺炎(SARS)肆虐之时,尹烨刚加入华大不到1年。疫情高发期,团队用36小时就测出了4株SARS病毒的序列,用96小时做出了SARS病毒酶联免疫试剂盒。提交注册的前一天晚上,他赶出了数百页研发和注册资料,掉落的头发填满了电脑键盘的空隙。

那时他写道:“如果在和平年代还能为国家做一点儿贡献,恐怕也就是现在了。

非典时期的尹烨

2020年,SARS暴发的17年后,他从一个职场新人转变为华大的CEO,依旧奔赴在新冠抗疫的战场,至今已不间断地工作了28个月。

华大主导设计的气膜版“火眼”实验室,成为了世界上首座可移动充气的P2级生物安全实验室,打包后可利用客机空运,支撑全球各国家的常态化检测。

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全球11个国家和地区已启用34座气膜版“火眼”实验室

这些年,他参与了近百个国际基因组合作项目,同时是基因科普播客、公众号和视频号的主创。

“每一个世纪的前几十年,我们都叫做某个奇迹的几十年,从物理的奇迹之年,再到化学、数学、地理等等,实际上这个世纪会是生命科学的黄金时期。”

以下是一条和尹烨的采访精选。

Q:一条

A:尹烨

Q:为什么这波疫情会如此凶猛?

A:可以说这是一场人类和病毒的战争。奥密克戎毒株(Omicron)目前的基本传播要比新冠原始株快得多,原始株的基本传染数(R0)大概是3-5,也就是一个感染病例可以传3-5个人,现在流行的变异株可以到9-11人,甚至有些专家认为它的新变种会有更高的基本传染数。

很多人可能不知道病毒具体长什么样,比如我手上的这个模型可以被理解为一个新冠病毒。那它实际的直径是多少呢?100个纳米。人类的细胞要比它大上百万倍、千万倍,人类的卵子是它的10亿倍(人卵子直径大概0.1毫米,是新冠病毒直径的1000倍,体积要立方,是它的10亿倍)。

冠状病毒的表面上有非常多的刺突,就像是矛一样,它叫刺突蛋白(Spike Protein),它会扎到人类的细胞里,就像是用一把钥匙去开锁一样。

所以当我们讨论新冠病毒的传播数,我们讨论的就是这一把钥匙。当病毒还是原始株或者阿尔法(Alpha)的时候,钥匙还比较笨,德尔塔(Delta)的时候已经很强了,但到现在的奥密克戎株(Omicron)时,它已经成为了一把万能钥匙

飞沫、气溶胶都是它的主要传播路径。因此,我们更要做好个人防护,戴好口罩、清洁手部非常重要。

提醒大家个小细节,其实目前中国的多个城市都在经历封控,大家集中去做核酸的时候,都会张嘴说“啊”,其实你可以不发声、只摆出口型,否则“啊”的过程中可能会有气溶胶出来。

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上海居民在小区内排队做核酸 摄|丝绒陨

Q:为什么说打疫苗是目前最有意义的事情?

A:这一刻真正有意义的其实就是疫苗。应该来说,人类寿命的大幅度延长,首先要归功于疫苗,但是全世界即使是发达国家,也有很多个人、群体甚至意见领袖反对疫苗。离我们最近的一个惨痛教训是10年前欧洲大规模反对麻疹疫苗,导致因为麻疹感染而死的人数大幅度上升。

从群体的角度来看,疫苗是非常安全有效的公共卫生产品,这不仅是中国的数据,这是全人类的数据。因为奥密克戎毒株它带来了一种突破性的感染,意味着你即使打了疫苗还是有可能感染病毒,但从中国香港的数据来看,患者无论是接种过mRNA疫苗还是灭活疫苗,尤其是在接种过加强针的情况下,重症和死亡率会有效降低。

所以打疫苗这件事不是疫情严重了以后再去想,而是应该在还没有发生之前就去做。我强烈建议大家有条件的情况下,尽快和社区咨询自身的情况,去把疫苗或者加强针打完。

Q:网传新冠有两百多种后遗症?

A:关于新冠后遗症的话题讨论一直没有停止,网上有很多“被新冠病毒感染后,男性生殖器’缩水’,加速大脑萎缩”等言论,基本都是利用大家的恐惧心理和幸存者偏差来博得关注,但其实不堪深究。

目前已知的新冠后遗症有200多种,绝大多数人感染后症状是比较轻微的,也很快就会康复。反过来,如果我们对后遗症毫无办法,光担心有啥用呢?最好的方式不还是不要感染新冠吗?所以从这个意义上讲还不是要打疫苗,还不是要做好个人的防护,这就是正途。

Q:如何从生物学角度去理解病毒?

A:病毒来到这个地球已经30多亿年了,人类开始统治这个地球,从农业时代算起也就只有1万年的时间。所以从这个意义上讲,不是说人类允不允许病毒存在,换言之是病毒允不允许人类存在。

病原体基因组 绘制者:吴彪

从基因的角度来看,至少几万年前,我们的基因组当中就有跟冠状病毒或它的祖先对抗的一个痕迹。我们每一个人的基因组里有高于8%的属于逆转录病毒插入序列,所以你和我的基因都不是传统意义上那种特别“干净”的,应该说没有物种的基因是“干净”的。

要知道,这个地球不只是有人类,我们跟无数种真菌、细菌、动物、植物共生共存着。

Q:为什么说人是一个生态系统?

A:我们习惯性会说人是由细胞组成的,其实也可以理解为我们是由病毒组成的。仅仅是专门吃人肠道细菌的这部分病毒,也就是肠道噬菌体,就有10万-19万种,所以我们不是一个人,我们是一个生态系统,有一肚子细菌,细菌又养了一大堆的病毒。

噬菌体病毒

只攻击特定的细菌,包括人体内的共生细菌

人类疱疹病毒6型

多数人感染后,终身为阴性携带者

当我们在谈论一个人,落在生物学家的眼里,他看到的是一个人菌共生的共同体,如果你不好好对待跟我们一起共生的菌,它也会不好好对待你。

其实只有极少数的病毒是有害的,绝大部分跟你无关,还有很多对你有益。如果人体没有病毒,我们连胎盘都演化不出来。

Q:人类基因组计划的源起是什么?

A:1971年,美国的阿波罗号登月成功后,当时的总统尼克松特别想去对抗癌症,因为那时是美国癌症的最高峰,花费几十亿美金制定了一个“肿瘤的射月计划”

过了10多年的时间,以失败告终。大家去讨论为什么这样,最后搞明白,如果我们仅仅是研究肿瘤的放疗、化疗,不去研究基因,我们永远不可能战胜肿瘤。

1990年,“国际人类基因组计划”启动,多个国家联合,计划测一个人的基因组,按照当时的测序能力,预计要花30年。当时,华大的创始人就觉得这个事情中国必需在一开始就参与进去,首先提出我们要代表中国人,代表当时全世界1/5的人口去参与这个项目。

人类基因组计划 第五次战略会议合影

研究成果部分发布在了《科学》和《自然》杂志上

然后前后历经13年,美、英、日、德、法、中6个国家联手做完了一个人的基因组。一共有6个国家的16个中心,不少于8000人参与,总花费38亿美元,才完成了一个人的基因组。这个人的基因组,也成为了日后基因检测的“康熙字典”。

发展到今天,检测一个人的基因组,成本也从38亿美元降到了大概300美元 ,且24小时内就可以完成。

Q:测出一个人的基因后,就能分析一个人了吗?

A:是的,连自己都可以分析自己。

基因能解决的最重要的三件事:第一个叫做与生俱来的基因——我们都想生个健康的孩子,不想他/她出生就有缺陷。

现在每个孕妇都会去做产检,好多项目都是用基因检测来确保肚子里的孩子是健康的,比如无创产前基因检测,就是抽孕妈妈一管外周血,来检测胎儿是否患有染色体遗传疾病,普及率在中国已经非常高了。

第二个是肿瘤,人生下来都没有肿瘤,后来才会得肿瘤。检查与时俱进的基因就是让有害的基因突变更早地被知道,最好不要等到肿瘤3期、4期了再发现,基因检测是一种很好的早期监测技术。比如结直肠癌早筛,可以很方便地检测粪便中脱落的肿瘤细胞DNA,来及早发现癌变及早治疗。

核酸检测

最后一个就是外来侵入的基因,比如新冠病毒。现在使用的核酸检测本身就是把基因检测用到了极致。

未来的这几十年会是生命科学的黄金期。而我们对于基因的解读,也叫做生物信息分析的能力,或遗传咨询的能力,就像我们今天去用一门编程语言,或掌握一门外语一样,这会是一种通用能力。

Q:基因编辑是一种怎样的技术?

A:理解基因编辑技术,首先是理解细胞。

细胞核模型

一个细胞,打开后中间就是有一个细胞核,我们的基因是一个双螺旋的结构。

人有23对染色体,30亿对碱基,我把双螺旋模型打开,这就非常像一个铁轨,在这个配对的过程中,红的一定要对黄的、蓝的一定要对绿的,如果这里面发生了碱基突变,或者说夫妻双方正好都携带了同一种遗传病,这个基因就很可能会出错。

我们用打扑克举例,比如斗地主,6、7、8、9、10顺子一把就出去了,而6、7、8、8、10你肯定就被抓了,所以我们就把其中的一个8换成9,这就是基因编辑技术,像不像出老千?

今天的基因编辑基本上主要用于可以把错的改对,某个孩子如果有遗传病,用基因编辑技术把他的这个遗传病相关的基因改好,这个是可以的。

基因编辑技术动画展示

举个例子,地中海贫血,主要的治疗方法就是造血干细胞的移植,以前我们认为这种骨髓移植都是要去找配体,比如父母的,再用抗排斥药物去压制。现在不用了,把自己干细胞取出来,基因编辑改对后再回输体内,这不是一个很好的事情吗?

你说能不能把不够优秀的变优秀?做不到。比如说编辑一个婴儿,恨不得德智体美劳全面发展,做不到,因为我们对基因就了解不到这个程度,人类定义不出来什么叫“完美”。

当然现在全世界对基因编辑的态度,仅仅允许修改体细胞,而不能修改生殖细胞,因为如果允许修改生殖细胞,就真的可以去做婴儿定制了,这个就是我们现在伦理学的一个大忌。

科学家必须心怀敬畏,有所为有所不为。

Q:意识上的焦虑,真的会完全改变我们的基因吗?

A:非常明确的证据显示:仅仅靠想,就能够改变基因,而且想出来的这些基因还会通过我们的生殖细胞,尤其是精子向下传递。

意识,一直是我很关心的话题。“9.11”事件发生时,很多孕妇目睹了,而她们生出的孩子得抑郁症的概率要高出其他的孩子。为什么?因为基因记住了。

很多人得了肿瘤,可能肿瘤本身没什么大问题,反倒自己一个月被吓死了;还有很多人得了肿瘤,看起来好像很严重,但他心理状态好,可能又活了很多年。

所以请大家一定管理好自己的情绪,多去进行正念的想法。一定要相信如果你面前有阴影,是因为你背后有阳光,回头看。

不管在任何条件下都不能放弃希望。一个人活着,碰到的问题大到天了可能就是死,那么在这个过程中为什么不更加乐观健康地去向死而生。

Q:为什么您总说“人类是生命的共同体”?

A:人类是通过群体的方式实现永生的,任何个体追求永生都不切实际。

但什么是可以永生的?文脉可以永生,比如说李白,比如说孔子,其实在他们生活的年代可能不太出名,到今天已经变成每个中国人都知道了,是因为他们的思想传递下去了。

对我自己来讲,其实生命科学它很复杂,就在于每个人都可以在自己身上去对照,他会有很多人性的光辉,他还要去对抗基因的自私性,去面对很多的挑战,很多的不理解。

我做了这么多年的生命科学,我想有一点很重要的就是:人类要学会谦卑。

对自然谦卑,对众生谦卑。

把自己就当成很普通的一个物种当中的很普通的个体,在这个过程中释放对环境、对自然、对同类的爱,才能够见天地,见众生,进而见自己。

部分配图出自《生命密码》