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作者:Daisy

导读:近日,发表在《Nature Communications》上的研究,揭示了与COVID-19严重病例相关的基因变异如何影响我们的免疫细胞,这是从人类遗传学角度揭示与疾病相关的新途径的力量。科学界已经确定了许多称之为“严重的COVID-19风险变异”,研究人员结合了COVID-19宿主遗传计划的患者遗传数据和免疫细胞表观基因组数据库,以确定这些风险变体影响的基因和易感细胞类型。发现一种风险变体在非经典单核细胞(先天免疫细胞)中表现出最强的效果,这种风险变异导致该细胞减少了一种名为OAS1的基因的表达。缺乏OAS1表达可能会降低一个通常降解病毒RNA并激活免疫系统抗病毒反应的蛋白质家族的表达,从而阻碍机体的防御。这可能是COVID-19的潜在治疗靶点。

新的研究显示了与COVID-19严重病例相关的基因变异如何影响我们的免疫细胞

这项由拉霍亚免疫研究所(LJI)研究所的科学家们领导,首次深入研究COVID-19严重程度与多种类型的免疫细胞中的基因表达之间的联系这项研究可以指导新冠病毒疗法的开发,以提高免疫细胞功能

在他们的研究中,研究人员报告称,一种称为非经典单核细胞的细胞类型中存在一种基因,可能是COVID-19的潜在治疗靶点

《Nature Communications》的资深作者、LJI教授、医学博士Panduragan Vijayanand说:“这项研究强调了人类遗传学揭示与疾病相关的新途径的力量。”

这项研究于近日发表在《Nature Communications》上,研究人员发表了一篇题为“COVID-19 genetic risk variants are associated with expression of multiple genes in diverse immune cell types”的文章:

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科学界已经确定了许多基因差异,称为多态性,他们称之为“严重的COVID-19风险变异”。这些基因变异与基因表达相关,似乎会影响病例的严重程度。然而,科学家们不知道哪些免疫细胞受这些风险变体的影响最大

在COVID-19疾病基因表观,Vijayanand和他的同事们的研究中,将其与来自COVID-19宿主遗传计划的患者遗传数据和LJI开放获取的免疫细胞表观基因组数据库(LICE)相结合,以确定这些风险变体影响的基因和易感细胞类型。研究团队观察了人体关键保护性和抗病毒细胞的13种亚型:T细胞、B细胞、NK细胞和单核细胞

“有许多不同的免疫细胞类型,它们都在全局发挥着很小的作用,”研究第一作者、LJI的讲师Benjamin Schmiedel博士说,“我们必须分别观察每种免疫细胞类型,以了解免疫系统如何对新冠病毒作出反应。”

研究人员发现了基因变异与基因的几个重要关联。其中有一种风险变体影响了研究的13种细胞类型中的12种。21号染色体上这种严重的COVID-19-风险变异与细胞上一种称为IFNAR2的受体表达降低有关。该受体是一个信号通路的一部分,该通路向免疫系统发出感染警报。这一新的关联可能有助于解释为什么有些人不能对SARS-CoV-2产生强烈的免疫反应

与此同时,12号染色体上的一种风险变体在非经典单核细胞中表现出最强的效果,这是一种天然免疫细胞,在体内巡逻,并发送信号分子提醒其他免疫细胞注意威胁这种风险变异导致非经典单核细胞减少了一种名为OAS1的基因的表达缺乏OAS1表达可能会降低一个通常降解病毒RNA并激活免疫系统抗病毒反应的蛋白质家族的表达,从而阻碍机体的防御

Schmiedel说:“非经典单核细胞是一种罕见的、未被充分研究的细胞类型。它们只构成大约2%的免疫细胞。”

Schmiedel希望COVID-19疾病的基因表达在临床上进一步评估,以确定这些基因在COVID-19发病中的作用。他说:“我们能够识别这些遗传机制是向前迈出的一大步。我们可以利用这些信息,结合我们的免疫细胞数据,找到潜在的治疗目标。”

该研究的其他作者,“COVID-19遗传风险变异与多种免疫细胞类型中多个基因的表达相关”,包括Job Rocha、Cristian Gonzalez Colin、Sourya Bhattacharyya、Ariel Madrigal、Christian H.Ottensmeier、Ferhat Ay和Vivek Chandra。

参考资料:

https://medicalxpress.com/news/2021-11-covid-case-severity-genetic-differences.html

注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。

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