超然楼历史悠久，约在元武宗、仁宗时期（1307—1320），不晚于元至治元年（1321），元代大学士李泂在大明湖畔修建了以超然楼为主要建筑的湖上别业，以供回乡时居住。李泂在世时，湖上别业内的建筑屡有增建，但到元末时，李泂湖上别业的建筑遭到破坏，天心水面亭被毁。
不过，明代初年，超然楼及天心水面亭又被修复，并一直持续到明末。据《明史》记载，崇祯十二年初（1639），清军攻克济南城，城内建筑多被焚毁。在这次清军入侵中，超然楼毁于战火，楼后的天心水面亭因位于水中而免于兵祸。至此，超然楼在原址共存在310余年。
超然楼作为“名士之楼”，在明代，自然也与当时的名士有很深的渊源，例如汪广洋、杨衍嗣都曾作过与超然楼有关的诗词。
汪广洋
汪广洋
汪广洋（?～1379），江苏高邮人，字朝宗，明朝初年宰相，重臣。元末进士出身，通经能文，尤工诗，善隶书。朱元璋称赞其“处理机要，屡献忠谋”，将他比作张良、诸葛亮。年少时跟随太祖朱元璋起义反元。明朝建立后，先后担任山东行省、陕西参政、中书省左丞、广东行省参政、右丞相职务。受封忠勤伯，为人宽和自守。洪武十二年（1379），以胡惟庸党案，谪海南，赐死。
汪广洋在济南任山东行省参知政事时，曾到过李泂的湖上别业。此时，超然楼及天水水面亭俱毁，仅能看到湖岸天心水面亭旧址的土基。汪广洋在超然楼旧址怀古，作《过故翰林李慨之天心水面亭遗址》律诗：“供奉归来已浪游，大明湖上贮清秋。十千美酒倾山雨，半百闲身对海鸥。水面风生杨柳岸，天心月过藕花洲。自从烂醉吹箫去，谁解临亭泛夕流。”
杨衍嗣
杨衍嗣，生卒年月不详，明代天启、崇祯年间文人，山东历城（今济南）人。
杨衍嗣曾作七律《超然楼》，诗曰：“近水亭台草木欣，朱楼百尺会波濆。窗含东海蓬瀛雨，槛俯南山岱岳云。柳色荷香尊外度，菱歌渔唱座中闻。七桥烟月谁收却？散入明湖已十分。”
明崇祯《历城县志》中记载的杨衍嗣所作《超然楼》诗。
位于超然楼六楼西侧的杨衍嗣《超然楼》诗作雕刻。