疫情之后，南京禄口机场投资近亿元的入境航班专用航站区正在紧张建设中，预计年底前就能启用。该航站区位于地铁空港新城江宁站附近，距离T2航站楼的远机位不远。
据“南京起飞”透露，为落实民航局“外防输入、内防反弹、人物同防”总体疫情防控要求，满足国际、国内保障区域物理空间、空调系统完全隔离，一线工作人员封闭管理等一系列要求，更加顺畅地保障服务国际（地区）客货运航班，南京机场已于今年8月开始准备进行大规模设施重建、改造及人员储备等工作。
2020年7月30日，南京禄口国际机场T1、T2“双楼运行”模式全面开启。
没想到，仅仅一年之后，2021年7月，南京机场就发生辐射全国的疫情。南京禄口国际机场是国家主要干线机场，2020年南京禄口机场旅客吞吐量位居全国第12位。如此可怕的吞吐量，无疑加速了疫情的外溢。
据官方通报，该次疫情早期报告的机舱保洁员病例的基因序列与2021年7月10日俄罗斯入境的CA910航班报告的1例输入病例的序列一致。这些保洁员工参加了俄罗斯入境的CA910航班的机舱清扫，工作完成后，因为防护洗脱不规范，可能造成个别保洁员感染，进而在保洁员工之间扩散传播。该公司的保洁员同时保障国际和国内航班的垃圾清运，机场其他工作人员因为接触保洁员或被污染的环境而感染。
分析认为，禄口机场两个航站楼混用为疫情发生提供了条件。禄口机场分两个航站楼，T1是国内航站楼，T2是国际航站楼。T1航站楼年承担运载进出港1200万人次，T2航站楼为1800万人次。两个航站楼疫情发生前被混用。
除上述“入境航班专用航站区”建设外，江苏城市论坛推文《投资2.7亿！东部机场集团航空食品基地设计招标》还提及了位于南京市溧水经济开发区滨淮大道的特大型工程——东部机场集团航空食品基地。
该项目占地60亩，规划总建筑面积48000平方米，包括38000㎡厂房和10000㎡综合辅助用房。项目新建航空冷冻餐生产线1条，冷冻烘焙生产线1条，项目建成后可达成航空配餐3650万份的年产能。
而在2019年11月，江苏省国资委官网就发布消息称东部机场集团将投资建设航空食品基地。该基地位于国家级南京临空经济示范区内，总投资约1.2亿元。对比可见，项目投资金额前后有了很大变化，如今已增至2.7亿元。