亳州历史上自秦设县以来，历经3000年的州、国、郡、府、州等建置变革，历史上管辖区域范围最广的时候有四个时期：
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一东汉时期。东汉建武十八年（公元42年），东汉政府决定把豫州刺史治所设于谯县，这一决定就改变了亳州的历史地位，亳州从此成为军事重镇，兵家必争之地。豫州刺史管辖中原的颖川、汝南两郡，梁、陈、沛、鲁四国，97县。相当于现在的一个省的建置。（从现有文献资料中所查询到的东汉时期15任豫州刺史（不含遥领），有一人后来成为开国皇帝，8人后来担任了东汉的宰相）
二（三国）魏国时期。魏国建立，以谯为魏帝祖庭之地，定谯县为陪都—东都。并封魏宗室曹林（曹操第十子）为谯王，谯郡也改为谯国，谯国管辖15个县：谯、苦、宋、酂、铚、虹、相、城父、山桑、竹邑、龙亢、符离等。区域涵盖现在的安徽北部地区。
三（南北朝）北魏、北齐、北周时期。北魏正始四年（公元507年），置南兖州，初治涡阳（今亳州市范围），正光移治小黄（谯县），南兖州管辖7郡：陈留、谯、梁、沛、北梁、下蔡、马头，21县。后南兖州领地为北齐和北周占领，建置不变，北齐因应战争形势需要，改南兖州刺史为南兖州行台（为出征时代表中央机构所在地），驻地谯县。北周在南兖州设立南兖州总管府，治谯县。北齐的南兖州行台和北周的南兖州总管府的总管基本上以王公宰相等担任。隋开国皇帝杨坚就担任过南兖州总管府总管。
四唐开国初期。唐武德四年（公元621年）在亳州置总管府，辖谯、亳、宋、颖、沈、北荆六州，30余县。七年改为都督府，辖境不变，贞观年初，因战争防卫重点的调整裁撤。