准确来说，冯国璋并没有失去军队，只不过被调离了他的大本营，只身到北京继承总统大位，以至于受制于段祺瑞和徐树铮。
冯国璋的起身资本可以说比段祺瑞还要早，早些年慈禧死了，光绪也死了，宣统继位，载丰独掌大权，马上就想把袁世凯弄死，可惜没那个胆子，因为六镇北洋军不好惹，只好把袁世凯以及袁世凯一党的人全部赶回家种红薯。
偏偏只留下了冯国璋，原因就在于这个冯国璋很会做人，有点蛇鼠两端的感觉，给载丰的感觉就是此人可用，所以冯国璋间接的成为了北洋军的大统帅。
后来打汉口，因为冯国璋一脑门子的跟革命党拼命，惹的老袁不高兴，才用段祺瑞换掉了冯国璋，段祺瑞才逐渐的盖住冯国璋，成为老袁头号天子门生。
但是即便如此，老袁手底下最精锐的北洋第三镇也一直都是冯国璋节制。
都知道六镇北洋军一直以来都是老袁的嫡系，而这个第三镇曾经担任过天津的警察卫戍部队，那更是嫡系中的嫡系，个个都是袁世凯最为倚重的天子门生。可见冯国璋还是很受重用的。
后来二次革命，不开眼的张勋打下了南京城，这个屠夫张勋一直被满遗那群人奉承说是武圣人（文圣人就是另一个满遗康有为），其实是个脑残加屠夫。他打下南京之后，发布将令：
十日不封刀。
杀害南京城中数十万百姓。惹得天怒人怨。
（说句多余的话，对南京犯下滔天大罪的，除了臭名昭著的日本侵略军，还有湘军曾国藩，最少杀了五十万人以上，以及这里说到的满遗张勋，屠杀人口也在十万以上）
说来可笑，张勋杀了数十万人大家破口大骂，但是张勋屁事没有。美滋滋的做他的江苏都督。张勋本人更是把民国的江苏都督当成了满清的两江总督来当，把清朝那一套官场礼仪发挥的淋漓尽致：
见面必须跪拜，让你坐只准坐半边屁股，主人抬手喝茶客人立马滚蛋，审案要大喊威武，想在江苏当官必须留辫子，犯了事要打板子，游街示众。抓到了革命党就在菜市场砍头示众。
不过终究出事了：张勋的部下太骄横了，平时杀中国人杀多了，胆子变大了，听说是为了吃妓女的醋，居然不小心杀了两个日本人。
这可是了不得的大事情，日本人一把屎尿就往张勋的脸上抹过来：八嘎呀路，你个小兔崽子，敢杀大日本帝国的臣民，活的不耐烦了。
别看张勋对中国人特别狠，对日本人可温顺了。吓得屁滚尿流，牙缝里蹦不出半个不字。跟他的老主人慈禧一样跪在地上听东洋佬的训斥。
袁世凯一看，立马出面做和事佬：
张勋你就到徐州去养老吧，江苏都督这个位置暂时就交给冯国璋来干。
张勋屁话也不敢说，就跑到徐州去当了什么长江巡阅使。
从此，冯国璋从袁世凯身边的一个大将，摇身一变，变成了北洋军中一方封疆大吏，而且掌握了整个中国当时最富庶的江苏以及上海地区（上海当时名义上归江苏都督管，实际上是有上海工部局自己管理）
此时冯国璋手里的权力不可谓不大，虽然说没有像段祺瑞一样在北京中央发号施令，但是段祺瑞只有一个空头陆军总长的名头，袁世凯弄了个陆海军大元帅办事处，就把段祺瑞的陆军总长给架空了。此时冯国璋权力隐隐有了大过段祺瑞的势头。
到了护国战争，段祺瑞和冯国璋两个人心照不宣，拒不支持袁世凯称帝，袁世凯气的一命呜呼，段祺瑞顺理成章成为了北洋政府实际上的最高领袖内阁总理，（表面上的总统是黎元洪黎大菩萨，徐树铮就直接说黎大菩萨就是个盖印机器，让你干啥就干啥，管那么多屁事干嘛？）而冯国璋则以江苏都督的身份兼领副总统职务，仍旧龟缩在南京拒不就职。
此时的冯国璋已经是独霸东南半壁的军阀，也是后来威震天下的直系军阀的前身，手底下豪杰众多，最著名的就有：第三师师长曹坤、吴佩孚、江西都督李纯、湖北都督王占元等等。势力囊括了江苏江西湖北等东南很多富庶的省份。
后来张勋复辟，黎元洪被赶下台。民国没有总统了，怎么办？段祺瑞就邀请冯国璋上北京当总统。
冯国璋也不傻，知道离开了自己的地盘去北京当劳什子空头总统屌用没有，不肯去，可是段祺瑞信誓旦旦解散讨逆军，说你看我也没军队了，你来吧，你来了就让你当实力总统，我甘心给你打工。你要不信，你还可以带兵来嘛。
冯国璋终究是耐不住寂寞，毕竟总统的位置还是太诱人了，黄袍加身啊。终于带了十六师进了北京城。
一到北京城才发现：草他么的段祺瑞你骗我。
讨逆军是解散了，但是安福军已经组建完毕了，段祺瑞实力大增，但是冯国璋也不是黎大菩萨可比的，手中有兵心不慌，处处跟段祺瑞掣肘交锋。最典型的的就是后来的护法战争，段祺瑞要武力统一，冯国璋要和平谈判。两人明里暗里把对方往死里搞，拢不到一块去。
但是尽管如此，张勋复辟后的段祺瑞皖系军阀势力大增，逐渐已经有了独揽全国军政大权的趋势，冯国璋虽然也有实力，但是此时此刻无力正面相抗衡，很多地方都向段祺瑞示弱，以至于处处窝囊，最后在民国七年辞去职务，并在民国八年病死于北京。
就这样，冯国璋鸟入牢笼、蛟龙困滩。失去了对军队的直接掌握权，而冯国璋军阀势力的继承人：曹坤，逐渐成为了直系军阀的实力代言人。其手下吴佩孚更是成为后来中国最有可能统一的豪杰。