阿富汗和巴基斯坦之间的关系本来就很平淡，随着阿富汗驻巴基斯坦大使女儿被绑架事件的发生，两国关系更是迅速恶化。据路透社最新报道，阿富汗外交部已经将其驻巴基斯坦大使和其他高级外交官撤离，直到安全威胁完全消除，包括逮捕和惩罚肇事者。
对此，巴基斯坦外交部专门发表了一份声明以“表示遗憾”，希望阿富汗政府会重新考虑撤回大使和其他高级外交官的决定，巴基斯坦外长甚至会见了阿富汗大使，并保证巴基斯坦会采取措施，对侦查这起政治意味极其浓厚的绑架案进行全力配合，但此举并未阻止阿富汗外交部要撤回大使的决定。
当地时间7月16日，阿富汗驻巴基斯坦大使纳吉布 · 阿里克希尔的女儿在伊斯兰堡市中心被绑架，但绑匪并未联系阿富汗驻巴基斯坦大使，更没有提出赎金要求，而是在数小时后将大使的女儿释放，但大使的女儿在此期间遭到残酷虐打，浑身不满伤痕，多处骨折。尽管详细情况还不清楚，但很多评论认为这是一起政治绑架事件，绑匪试图借此警告阿富汗驻巴基斯坦外交人员。
目前的阿富汗局势极为紧张，尽管巴基斯坦政府目前在阿富汗问题上极为谨慎，但众所周知，塔利班和巴基斯坦政府尤其是巴基斯坦军方和情报部门关系密切。有消息称，现在有超过一万名巴基斯坦武装分子进入了阿富汗，与塔利班并肩战斗，更是有消息称，巴基斯坦实际上支持了塔利班的进攻。
在塔利班统治时代（1996年-2001年），巴基斯坦是三个与阿富汗保持外交关系的国家之一（另外两个是沙特和阿联酋），在塔利班上台的过程中，巴基斯坦被认为提供了全力支持。而2001年后的阿富汗政府与巴基斯坦政府则关系十分冷淡，阿富汗驻巴基斯坦大使馆甚至都不在戒备严密的使馆区内。
巴基斯坦和塔利班之间的复杂关系早已不是秘密，此前，美国政府就以“反恐不力”为由，取消了巴基斯坦的盟友地位，使得巴基斯坦失去了以优惠价格获得美制高技术武器等待遇；阿富汗政府虽然没有明说，但也对巴基斯坦与塔利班之间的关系心知肚明。
在与巴基斯坦关系冷淡的同时，阿富汗政府与印度政府的关系则十分密切：印度向阿富汗政府提供了军事援助，并在阿富汗拥有超过30亿美元的投资。印度不希望看到塔利班重新控制阿富汗，这会威胁到印控克什米尔地区，印度担心塔利班控制下的阿富汗会支持印控克什米尔地区的恐怖组织，此举符合巴基斯坦的利益。巴基斯坦军方和情报部门支持了一系列武装组织，包括恐怖组织，这些组织经常会越境进入印控克什米尔境内，袭击驻扎在那里的印度军队和警察部队。