当现在称为 Delta(德尔塔) 的冠状病毒变种于 2020 年 12 月首次出现在印度马哈拉施特拉邦时,它似乎并没有那么引人注目。但几个月后,当它出现在新德里时,其影响是毁灭性的,4 月下旬每天报告近 30,000 例病例。新德里基因组学和综合生物学研究所负责人阿努拉格·阿格拉瓦尔 (Anurag Agrawal) 说:“突然之间……它占据了主导地位,并完全替代了之前的 Alpha变异病毒。“

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阿格拉瓦尔说,新德里似乎不太可能爆发新的大规模疫情,因为它的许多居民已经被感染或接种了疫苗。但这些保护措施似乎几乎没有减缓 Delta 的速度,Delta 的传播性更强,可能会逃避免疫力,打比方:”原来的病毒需要翻过10米高的墙才能感染正常细胞,而现在只用翻过2米。”

14秒完成传播!

6月21日,广州警方在对一起四代重点病例接触追溯过程中发现,第三代感染者与第四代感染者在同一环境下仅用14秒就完成病毒传播,是本轮疫情接触时间中最短的!而传播的病毒就是德尔塔变异毒株。

警方公布的监控画面显示,黄某与鲁某(第四代感染者)在用餐时,两人分别进入卫生间,黄某走出卫生间时未佩戴口罩,走出数米后才拿出口罩戴上。双方在无接触肢体情况下,14秒就完成了病毒传播。

从新德里开始,该变种已迅速传播,现在看起来将席卷全球,这可能是一场毁灭性的新浪潮。在英国,达美航空已占所有感染的 90% 以上; 在急剧下降之后,它再次推动了 COVID-19 病例数的上升,并导致政府上周推迟了重新开放计划的最后阶段。里斯本三角洲驱动的复苏促使葡萄牙政府颁布了为期 3 天的城市与该国其他地区之间的旅行禁令。欧洲疾病预防和控制中心负责人安德里亚·阿蒙 (Andrea Ammon) 今天警告说,到 8 月底,该变体可能占欧盟所有 COVID-19 病例的 90%。她说:“Delta 变种很可能会在夏季广泛传播,特别是在不适合接种疫苗的年轻人中。这可能会给更脆弱的人带来感染和患重病的风险,如果他们没有完全接种疫苗就会死亡。”

达美航空似乎也在俄罗斯、印度尼西亚和许多其他国家引起了激增。在美国,目前估计其患病率至少为 14%,疾病控制和预防中心于 6 月 15 日宣布 Delta 为“关注的变种”。

激增引发了研究狂潮,以了解为什么 Delta 似乎比其他三个令人担忧的变体传播得更快,它是否在其他方面更危险,以及它独特的突变模式如何导致其发生微妙的变化。蛋白质,可以造成严重破坏。Delta 的到来也让人们重新关注 SARS-CoV-2 在未来几个月和几年内进化和适应的潜力。世界卫生组织首席科学顾问 Soumya Swaminathan 表示,目前,Delta 对那些几乎没有或根本无法获得疫苗的最贫穷国家构成特别威胁。“我直接担心的是,当三角洲被引入非洲时会发生什么,”她说。“最终可能会导致爆发性疫情。”

英国公共卫生部的研究强调了 Delta 的传播能力。与 2020 年在英国出现的 Alpha 相比,“据估计,传播率会增加 50% 或 100%,”伦敦卫生与热带医学学院的建模师 Adam Kucharski 说。

但 Kucharski 表示,对疫苗的保护减少也可能起作用。来自英格兰和苏格兰的数据表明,辉瑞 BioNTech 和阿斯利康疫苗对新变种引起的症状性感染的保护作用略低于 Alpha。像许多英国居民一样,只接种了一针疫苗的人尤其容易受到伤害。(两种疫苗的两种剂量仍然可以提供相同的高水平保护,防止 Delta 住院。)目前世界各地使用的许多其他疫苗对它的保护程度尚不清楚,而且关于先前疫苗产生的保护作用的数据很少。关于 COVID-19。

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印度大流行恐怖的数字背后,就是这种变异毒株

Wellcome Trust 的负责人 Jeremy Farrar 说,这两种影响——增加的传播性和免疫逃避——很难分开,但“我认为 Delta 变体是由它的传播性驱动的,而不是它逃避免疫的能力。” “如果 Alpha 确实比野生型毒株的传染性高约 50%,而 Delta 的传染性又比 Alpha 高 50%,那么我们谈论的病毒的传染性是初始毒株的两倍多,”Aris Katzourakis 补充道,牛津大学的进化病毒学家。这意味着疫苗接种率低的国家和人群可能会出现新的大规模疫情。事实上,如果更快的传播“完全取决于病毒的基本原理,那对世界其他地区来说就是灾难性的消息,”库查斯基说。

最重要的是,Delta 可能比 Alpha 更有可能将未接种疫苗的人送进医院。英国的早期数据表明,住院的风险可能高两倍。Swaminathan 说,这些特征加在一起可能会给非洲带来巨大的问题。“那里将没有足够的氧气,也没有足够的病床。我们已经知道,在非洲住院的人的结果比其他国家更糟糕,”她说。“所以这真的会导致更高的死亡率,即使在年轻人中也是如此。”

突变可能会阻碍抗体

科学家们才刚刚开始探索是什么让德尔塔如此危险。他们专注于编码刺突基因的一组九个突变,刺突蛋白是一种镶嵌在病毒表面并使其能够侵入人体细胞的蛋白质。一个名为 P681R 的重要突变改变了弗林蛋白酶裂解位点旁边一个点的氨基酸,人类酶在此处切割蛋白质,这是病毒侵入人体细胞的关键步骤。在 Alpha 变体中,该位点的突变使切割更有效; 5 月下旬发表的预印本 显示 Delta 的不同变化使弗林蛋白酶解理更加容易。研究人员表示,这可能会使病毒更容易传播。

进化病毒学家安德鲁·兰博特(Andrew Rambaut)表示,日本研究人员制造出携带该突变的假病毒 并没有发现 它在实验室中增加了传染性,然而在印度,包含相同突变的其他冠状病毒变种远不如 Delta 成功。爱丁堡大学。“所以它一定是与基因组中其他东西的相互作用。”

Delta 中的其他突变可以帮助它阻止免疫。一些改变了从蛋白质表面突出的尖峰的 N 端结构域 (NTD)。一个 最近的 小区 标识的纸 NTD 中的一个点作为“超级位点”,一直被来自康复患者的“超强效”中和抗体所针对。Delta 独特的突变删除了超位点第 156 和 157 位的氨基酸,并将第 158 位氨基酸从精氨酸变为甘氨酸;佛罗里达大学的结构生物学家大卫奥斯特罗夫说,后者消除了抗体结合的直接接触点。“我们认为 157/158 突变是 Delta 的标志性突变之一,它赋予了它更多的免疫逃避表型,”弗雷德哈钦森癌症研究中心的计算生物学家 Trevor Bedford 表示同意。

NTD 超位点中的另一个突变也可能有助于抵抗抗体。加州大学旧金山分校的分子生物学家 Nevan Krogan 说,科学家们应该开始研究其他 Delta 变异蛋白的变化所起的作用。“在各个层面上,我们对这些变体知之甚少。我们太黑暗了。” 例如,Delta 在核衣壳蛋白中有几个突变,它有很多作用,“就像瑞士军刀蛋白一样,”弗朗西斯克里克研究所的病毒学家大卫鲍尔说。然而,使问题变得清晰的实验需要几个月的时间。

加速疫苗接种

与此同时,科学家们同意需要采取紧急行动来阻止新变种的传播。萨斯喀彻温大学的病毒学家安吉拉·拉斯穆森说:“对三角洲的担忧应该激励我们真正加大疫苗接种力度,并将疫苗大量投放到三角洲正在流行的地方。” 美国总统乔拜登 敦促美国人 全面接种疫苗以保护自己免受 Delta 的侵害。艾蒙今天呼吁欧洲国家加快为弱势人群全面接种疫苗的计划;与此同时,她说,应该保持限制,以防止新变种传播并导致病例、住院和死亡再次激增。拉斯穆森说,几乎无法获得疫苗的国家需要再次采取诸如保持社交距离和戴口罩等干预措施。在欧洲,艾蒙要求各国做到这两点:保持限制,同时推动对弱势人群进行全面接种。

其目标不仅是立即挽救生命,而且是减少病毒进一步进化的空间。巴塞尔大学病毒学家 Emma Hodcroft 表示,Delta 的成功表明科学家们无法及时识别危险的新变种以阻止它们传播,尽管全球为实时跟踪其进化做出了前所未有的努力 。Katzourakis 说,假设 SARS-CoV-2 不能做得更好是危险的。“在进化过程中至少发生过两次的任何事情都是某种模式的一部分,”他说。“如果我们在未来一两年看到类似的变化,我不会感到惊讶。”

梵观点:真是道高一尺魔高一丈的对抗。